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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

AATGGAACCACAGATCAGGTCGAGAAGATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGGgtacggacaccaaaaacttttacgtgatgccttttaggactaacctcgaaggaggaaggacagacccagtggtggtggctcccacatgagtgggatagtc...

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G030784_T02
intron # 4
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|71325325|gb|DR799341.1|DR799341
EST:     GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGG                         AGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
genomic: GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGGgtacggacac ... tgcattgcagAGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
EST: gi|6021111|gb|AW066039.1|AW066039
EST:     GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGGTCCCCCTTCAGATGTTGTTG                         AGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTGTGGCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
genomic: GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGGgtacggacac ... tgcattgcagAGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
EST: gi|211522695|gb|FL104750.1|FL104750
EST:     GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGG                         AGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
genomic: GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGGgtacggacac ... tgcattgcagAGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
EST: gi|211525699|gb|FL104762.1|FL104762
EST:     GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTTG                         AGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
genomic: GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGGgtacggacac ... tgcattgcagAGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
EST: gi|211525698|gb|FL104761.1|FL104761
EST:     GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGG                         AGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
genomic: GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGGgtacggacac ... tgcattgcagAGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
EST: gi|14569384|gb|BI097707.1|BI097707
EST:     GA-TGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGG                         AGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
genomic: GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGGgtacggacac ... tgcattgcagAGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
EST: gi|211419268|gb|FL091406.1|FL091406
EST:     GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTCG                         AGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
genomic: GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGGgtacggacac ... tgcattgcagAGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
EST: gi|5296085|gb|AI782960.1|AI782960
EST:     GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGG                         AGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
genomic: GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGGgtacggacac ... tgcattgcagAGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
EST: gi|13198659|gb|BG354461.1|BG354461
EST:     GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGG                         AGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
genomic: GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGGgtacggacac ... tgcattgcagAGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
EST: gi|213178228|gb|FM191284.1|FM191284
EST:     GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGG                         AGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
genomic: GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGGgtacggacac ... tgcattgcagAGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
EST: gi|7216447|gb|AW562569.1|AW562569
EST:     GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGG                         AGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
genomic: GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGGgtacggacac ... tgcattgcagAGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
EST: gi|211331048|gb|FL104687.1|FL104687
EST:     GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTCG                         AGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
genomic: GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGGgtacggacac ... tgcattgcagAGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
EST: gi|71323015|gb|DR798174.1|DR798174
EST:     GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGG                         AGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
genomic: GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGGgtacggacac ... tgcattgcagAGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
EST: gi|211531696|gb|FL104786.1|FL104786
EST:     GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGG                         AGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
genomic: GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGGgtacggacac ... tgcattgcagAGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
EST: gi|67026065|gb|CO454814.1|CO454814
EST:     GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGG                         AGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
genomic: GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGGgtacggacac ... tgcattgcagAGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
EST: gi|67024324|gb|CO453073.1|CO453073
EST:     GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGG                         AGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
genomic: GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGGgtacggacac ... tgcattgcagAGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
EST: gi|29544519|gb|CB604899.1|CB604899
EST:     GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGG                         AGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
genomic: GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGGgtacggacac ... tgcattgcagAGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
EST: gi|71433477|gb|DR814527.1|DR814527
EST:     GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGG                         AGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
genomic: GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGGgtacggacac ... tgcattgcagAGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
EST: gi|31355717|gb|CD440074.1|CD440074
EST:     GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTCG                         AGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
genomic: GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGGgtacggacac ... tgcattgcagAGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
EST: gi|116821141|gb|EC864427.1|EC864427
EST:     GATTGTCAAAACCCTGAATGAACGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTTG                         AGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
genomic: GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGGgtacggacac ... tgcattgcagAGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
EST: gi|211331053|gb|FL104692.1|FL104692
EST:     GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGG                         AGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
genomic: GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGGgtacggacac ... tgcattgcagAGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
EST: gi|74236492|gb|DT644406.1|DT644406
EST:     GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGG                         AGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
genomic: GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGGgtacggacac ... tgcattgcagAGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
EST: gi|211324554|gb|FL104645.1|FL104645
EST:     GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTCG                         AGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
genomic: GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGGgtacggacac ... tgcattgcagAGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
EST: gi|67021074|gb|CO449823.1|CO449823
EST:     GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGG                         AGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
genomic: GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGGgtacggacac ... tgcattgcagAGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
EST: gi|61236882|gb|DN586594.1|DN586594
EST:     GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTTG                         AGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
genomic: GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGGgtacggacac ... tgcattgcagAGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
EST: gi|67034586|gb|CO463136.1|CO463136
EST:     GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGG                         AGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
genomic: GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGGgtacggacac ... tgcattgcagAGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
EST: gi|21760002|gb|BQ635543.1|BQ635543
EST:     GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGG                         AGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
genomic: GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGGgtacggacac ... tgcattgcagAGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
EST: gi|211331046|gb|FL104685.1|FL104685
EST:     GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTCG                         AGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
genomic: GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGGgtacggacac ... tgcattgcagAGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
EST: gi|211335381|gb|FL104715.1|FL104715
EST:     GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTCG                         AGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
genomic: GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGGgtacggacac ... tgcattgcagAGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
EST: gi|193503181|gb|AM937593.1|AM937593
EST:     GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGG                         AGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
genomic: GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGGgtacggacac ... tgcattgcagAGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
EST: gi|211326717|gb|FL104658.1|FL104658
EST:     AATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTCG                         AGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
genomic: AATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGGgtacggacac ... tgcattgcagAGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
EST: gi|32865187|gb|CF004869.1|CF004869
EST:     GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGG                         AGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
genomic: GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGGgtacggacac ... tgcattgcagAGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
EST: gi|211324555|gb|FL104646.1|FL104646
EST:     ATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCKGTCAGATGTTGTCG                         AGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
genomic: ATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCC-TTCAGATGTTGTGGgtacggacac ... tgcattgcagAGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
EST: gi|211331043|gb|FL104682.1|FL104682
EST:     GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTCG                         AGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
genomic: GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGGgtacggacac ... tgcattgcagAGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
EST: gi|211335377|gb|FL104711.1|FL104711
EST:     GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTCG                         AGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
genomic: GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGGgtacggacac ... tgcattgcagAGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
EST: gi|32906873|gb|CF011686.1|CF011686
EST:     GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGG                         AGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
genomic: GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGGgtacggacac ... tgcattgcagAGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
EST: gi|67016932|gb|CO445681.1|CO445681
EST:     GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGG                         AGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
genomic: GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGGgtacggacac ... tgcattgcagAGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
EST: gi|84980759|gb|DW531108.1|DW531108
EST:     GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTTG                         AGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
genomic: GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGGgtacggacac ... tgcattgcagAGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
EST: gi|211528700|gb|FL104778.1|FL104778
EST:     GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTCG                         AGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
genomic: GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGGgtacggacac ... tgcattgcagAGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
EST: gi|211531698|gb|FL104788.1|FL104788
EST:     GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTCG                         AGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
genomic: GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGGgtacggacac ... tgcattgcagAGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
EST: gi|7162498|gb|AW520120.1|AW520120
EST:     GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGG                         AGGTCGNTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
genomic: GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGGgtacggacac ... tgcattgcagAGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
EST: gi|38502719|gb|CF972579.1|CF972579
EST:     GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTTG                         AGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
genomic: GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGGgtacggacac ... tgcattgcagAGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
EST: gi|78109161|gb|DV527578.1|DV527578
EST:     GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGG                         AGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
genomic: GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGGgtacggacac ... tgcattgcagAGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
EST: gi|211522688|gb|FL104743.1|FL104743
EST:     GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTCG                         AGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
genomic: GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGGgtacggacac ... tgcattgcagAGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
EST: gi|211525697|gb|FL104760.1|FL104760
EST:     GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGG                         AGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
genomic: GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTGGgtacggacac ... tgcattgcagAGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
EST: gi|116813239|gb|EC855658.1|EC855658
EST:     GATTGTCAAAACCCTGAATGAAGGACAGGTTCCCCCTTCAGATGTTGTTG                         AGGTCGTTGTCAGCCCTCCTTATGTCTTCCTTCCTGTGGTCAAGAGCCAGC
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Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
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