1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
CCGAAGAAGGGCCAACCCTCCAGGTGGCCATCTCTTGTGCAGCAAATATCTATTTCATTTATCAGAGGGTCAAAAGTGGATGGCGAGCATTCTTTTATGGgtatgctttcttctcattgtaggattttagtttattaagtatacatctgcattggcctatgttttgctcttagtacaattgcatttgttttcaattcatt...
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G013814_T01 |
intron # | 4 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TATTTCATTTATCAGAGGGTCAAAAGTGGATGGCGAGCATTCTTTTATGG GTTTGGTTCTTTCTTTGCTTCCTGGTTCCTTGGCACCTTCTTGATGGTATCEST: gi|32934335|gb|CF039147.1|CF039147
genomic: TATTTCATTTATCAGAGGGTCAAAAGTGGATGGCGAGCATTCTTTTATGGgtatgctttc ... gacctttcagGTTTGGTTCTTTCTTTGCTTCCTGGTTCCTTGGCACCTTCTTGATGGTATC
EST: TATTTCATTTATCAGAGGGTCAAAAGTGGATGGCGAGCATTCTTTTATGG GTTTGGTTCTTTCTTTGCTTCCTGGTTCCTTGGCACCTTCTTGATGGTATCEST: gi|60349514|gb|DN216487.1|DN216487
genomic: TATTTCATTTATCAGAGGGTCAAAAGTGGATGGCGAGCATTCTTTTATGGgtatgctttc ... gacctttcagGTTTGGTTCTTTCTTTGCTTCCTGGTTCCTTGGCACCTTCTTGATGGTATC
EST: TATTTCATTTATCAGAGGGTCAAAAGTGGATGGCGAGCATTCTTTTATGG GTTTGGTTCTTTCTTTGCTTCCTGGTTCCTTGGCACCTTCTTGATGGTATCEST: gi|71761054|gb|DR958991.1|DR958991
genomic: TATTTCATTTATCAGAGGGTCAAAAGTGGATGGCGAGCATTCTTTTATGGgtatgctttc ... gacctttcagGTTTGGTTCTTTCTTTGCTTCCTGGTTCCTTGGCACCTTCTTGATGGTATC
EST: TATTTCATTTATCAGAGGGTCAAAAGTGGATGGCGAGCATTCTTTTATGG GTTTGGTTCTTTCTTTGCTTCCTGGTTCCTTGGCACCTTCTTGATGGTATCEST: gi|88751083|gb|DY535224.1|DY535224
genomic: TATTTCATTTATCAGAGGGTCAAAAGTGGATGGCGAGCATTCTTTTATGGgtatgctttc ... gacctttcagGTTTGGTTCTTTCTTTGCTTCCTGGTTCCTTGGCACCTTCTTGATGGTATC
EST: TATTTCATTTATCAGAGGGTCAAAAGTGGATGGCGAGCATTCTTTTATGG GTTTGGTTCTTTCTTTGCTTCCTGGTTCCTTGGCACCTTCTTGATGGTATCEST: gi|86473870|gb|DY240240.1|DY240240
genomic: TATTTCATTTATCAGAGGGTCAAAAGTGGATGGCGAGCATTCTTTTATGGgtatgctttc ... gacctttcagGTTTGGTTCTTTCTTTGCTTCCTGGTTCCTTGGCACCTTCTTGATGGTATC
EST: TATTTCATTTATCAGAGGGTCAAAAGTGGATGGCGAGCATTCTTTTATGG GTTTGGTTCTTTCTTTGCTTCCTGGTTCCTTGGCACCTTCTTGATGGTATCEST: gi|211144102|gb|FL136022.1|FL136022
genomic: TATTTCATTTATCAGAGGGTCAAAAGTGGATGGCGAGCATTCTTTTATGGgtatgctttc ... gacctttcagGTTTGGTTCTTTCTTTGCTTCCTGGTTCCTTGGCACCTTCTTGATGGTATC
EST: TATTTCATTTATCAGAGGGTCAAAAGTGGATGGCGAGCATTCTTTTATGG GTTTGGTTCTTTCTTTGCTTCCTGGTTCCTTGGCACCTTCTTGATGGTATC
genomic: TATTTCATTTATCAGAGGGTCAAAAGTGGATGGCGAGCATTCTTTTATGGgtatgctttc ... gacctttcagGTTTGGTTCTTTCTTTGCTTCCTGGTTCCTTGGCACCTTCTTGATGGTATC
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| CCGAAGAAGGGCCAACCCTCCAGGTGGCCATCTCTTGTGCAGCAAATATCTATTTCATTTATCAGAGGGTCAAAAGTGGATGGCGAGCATTCTTTTATGGgtatgctttcttctcattgtaggattttagtttattaagtatacatctgcattggcctatgttttgctcttagtacaattgcatttgttttcaattcatt
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGTGGA