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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTTGGAAGGAACTTGAAAGATTTGCCATCACCTACTTTGGCTATTGTATCAGAAAGGCTGAAACTGTCTACTGTACATGAAGgtggtgtcttatagattgtgtattgtaatacactctattccatattataaggcattttaggttttctggatccataagttttcttattcacttcgatttc...

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G068755_T01
intron # 30
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GRMZM2G068755_T03 (Zea mays), 5'ss of exon 29
lower sequence: LOC_Os01g60040.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 30
GTTGGAAGGAACTTGAAAGATTTGCCATCACCTACTTTGGCTATTGTATCAGAAAGGCTGAAACTGTCTACTGTACATGAAGgtggtgtcttatagattgtgtattgtaatacactctattccatattataaggcatt-ttaggttttctggatccataagttttcttattcacttcgatttc-
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GTTGCGAAGAACTTGAAAGATTTGCCATCACCTACTTTGGCCATTGTAGCAGAGCGGTTAAAACTGTCCACTGTACACGAAGgtgtc--cttgattatcgtgcttcacaaatgtttctgttt----ttctgaaatgttgtcaacatttgtgtactcatttgatatcactgtcttattgaaatag