Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTTAATGGCGTTGGGAAGACCACAGGTATGGAGTACCCAGAGCGCCCTGGACAGCCACTCTGTGAGgtaaataaaaccaattttaaatctatttcttattgacattttaggtcaaaatgtattatttttttattgtcatgtggtggaaactctggttacgaaattctcgttattttcag

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G475017_T03
intron # 3
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|31910491|gb|CD651450.1|CD651450
EST:     AGACCACAGGTATGGAGTACCCAGAGCGCCCTGGACAGCCACTCTGTGAG                         TACTATGCAAAGAATGGCACATGCAAATTTGGTTCCAATTGCAAGTTTGAT
genomic: AGACCACAGGTATGGAGTACCCAGAGCGCCCTGGACAGCCACTCTGTGAGgtaaataaaa ... ttattttcagTACTATGCAAAGAATGGCACATGCAAATTTGGTTCCAATTGCAAGTTTGAT
EST: gi|78116119|gb|DV534507.1|DV534507
EST:     AGACCACAGGTATGGAGTACCCAGAGCGCCCTGGACAGCCACTCTGTGAG                         TACTATGCAAAGAATGGCACATGCAAATTTGGTTCCAATTGCAAGTTTGAT
genomic: AGACCACAGGTATGGAGTACCCAGAGCGCCCTGGACAGCCACTCTGTGAGgtaaataaaa ... ttattttcagTACTATGCAAAGAATGGCACATGCAAATTTGGTTCCAATTGCAAGTTTGAT
EST: gi|91876225|gb|EB406182.1|EB406182
EST:     AGACCACAGGTATGGAGTACCCAGAGCGCCCTGGACAGCCACTCTGTGAG                         TACTATGCAAAGAATGGCACATGCAAATTTGGTTCCAATTGCAAGTTTGAT
genomic: AGACCACAGGTATGGAGTACCCAGAGCGCCCTGGACAGCCACTCTGTGAGgtaaataaaa ... ttattttcagTACTATGCAAAGAATGGCACATGCAAATTTGGTTCCAATTGCAAGTTTGAT
EST: gi|94474028|gb|EB702986.1|EB702986
EST:     AGACCACAGGTATGGAGTACCCAGAGCGCCCTGGACAGCCACTCTGTGAG                         TACTATGCAAAGAATGGCACATGCAAATTTGGTTCCCATTGCCAGTTTGAT
genomic: AGACCACAGGTATGGAGTACCCAGAGCGCCCTGGACAGCCACTCTGTGAGgtaaataaaa ... ttattttcagTACTATGCAAAGAATGGCACATGCAAATTTGGTTCCAATTGCAAGTTTGAT
EST: gi|76921023|gb|DV168420.1|DV168420
EST:     AGACCACAGGTATGGAGTACCCAGAGCGCCCTGGACAGCCACTCTGTGAG                         TACTATGCAAAGAATGGCACATGCAAATTTGGTTCCAATTGCAAGTTTGAT
genomic: AGACCACAGGTATGGAGTACCCAGAGCGCCCTGGACAGCCACTCTGTGAGgtaaataaaa ... ttattttcagTACTATGCAAAGAATGGCACATGCAAATTTGGTTCCAATTGCAAGTTTGAT
EST: gi|71775279|gb|DR973157.1|DR973157
EST:     AGACCACAGGTATGGAGTACCCAGAGCGCCCTGGACAGCCACTCTGTGAG                         TACTATGCAAAGAATGGCACATGCAAATTTGGTTCCAATTGCAAGTTTGAT
genomic: AGACCACAGGTATGGAGTACCCAGAGCGCCCTGGACAGCCACTCTGTGAGgtaaataaaa ... ttattttcagTACTATGCAAAGAATGGCACATGCAAATTTGGTTCCAATTGCAAGTTTGAT
EST: gi|38687417|gb|CK144448.1|CK144448
EST:     AGACCACAGGTATGGAGTACCCAGAGCGCCCTGGACAGCCACTCTGTGAG                         TACTATGCAAAGAATGGCACATGCAAATTTGGTTCCAATTGCAAGTTTGAT
genomic: AGACCACAGGTATGGAGTACCCAGAGCGCCCTGGACAGCCACTCTGTGAGgtaaataaaa ... ttattttcagTACTATGCAAAGAATGGCACATGCAAATTTGGTTCCAATTGCAAGTTTGAT
EST: gi|76289471|gb|DV029039.1|DV029039
EST:     AGACCACAGGTATGGAGTACCCAGAGCGCCCTGGACAGCCACTCTGTGAG                         TACTATGCAAAGAATGGCACATGCAAATTTGGTTCCAATTGCAAGTTTGAT
genomic: AGACCACAGGTATGGAGTACCCAGAGCGCCCTGGACAGCCACTCTGTGAGgtaaataaaa ... ttattttcagTACTATGCAAAGAATGGCACATGCAAATTTGGTTCCAATTGCAAGTTTGAT
EST: gi|50338849|gb|CO533975.1|CO533975
EST:     AGACCACAGGTATGGAGTACCCAGAGCGCCCTGGACAGCCACTCTGTGAG                         TACTATGCAAAGAATGGCACATGCAAATTTGGTTCCAATTGCAAGTTTGAT
genomic: AGACCACAGGTATGGAGTACCCAGAGCGCCCTGGACAGCCACTCTGTGAGgtaaataaaa ... ttattttcagTACTATGCAAAGAATGGCACATGCAAATTTGGTTCCAATTGCAAGTTTGAT