1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
AAGTTTTTGAGGCAGCCACATTTCATTGTCTGGGACAACAGTGATCTTGTCACCCATGAGGTGATGGGTGGCCTGAAGAATGTCTATGCAATCGGTGCTGgtaatactaacttctgtctttttttaactgacaatattattgtacaataggcatcctactacttgatgttgaagaaaacataacaaacatgtaaatgttt...
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G155348_T01 |
intron # | 3 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: CAATCGGTGCTG GAATGGTGGCAGCTTTAACAAACGAGAGTGCAACAAGCAAATCTGTATATTEST: gi|32789125|gb|CD941361.1|CD941361
genomic: CAATCGGTGCTGgtaatactaa ... tatgtttcagGAATGGTGGCAGCTTTAACAAACGAGAGTGCAACAAGCAAATCTGTATATT
EST: CACCCATGAGGTGATGGGTGGCCTGAAGAATGTCTATGCAATCGGTGCTG GAATGGTGGCAGCEST: gi|74237292|gb|DT645206.1|DT645206
genomic: CACCCATGAGGTGATGGGTGGCCTGAAGAATGTCTATGCAATCGGTGCTGgtaatactaa ... tatgtttcagGAATGGTGGCAGC
EST: CACCCATGAGGTGATGGGTGGCCTGAAGAATGTCTATGCAATCGGTGCTG GAATGGTGGCAGCTTTAACAAACGAGAGTGCAACAAGCAAATCTGTATATTEST: gi|74245777|gb|DT653691.1|DT653691
genomic: CACCCATGAGGTGATGGGTGGCCTGAAGAATGTCTATGCAATCGGTGCTGgtaatactaa ... tatgtttcagGAATGGTGGCAGCTTTAACAAACGAGAGTGCAACAAGCAAATCTGTATATT
EST: CACCCATGAGGTGATGGGTGGCCTGAAGAATGTCTATGCAATCGGTGCTG GAATGGTGGCAGCTTTAACAAACGAGAGTGCAACAAGCAAATCTGTATATTEST: gi|32808682|gb|CD960916.1|CD960916
genomic: CACCCATGAGGTGATGGGTGGCCTGAAGAATGTCTATGCAATCGGTGCTGgtaatactaa ... tatgtttcagGAATGGTGGCAGCTTTAACAAACGAGAGTGCAACAAGCAAATCTGTATATT
EST: CACCCATGAGGTGATGGGTGGCCTGAAGAATGTCTATGCAATCGGTGCTG GAATGGTGGCAGCTTTAEST: gi|32798272|gb|CD950508.1|CD950508
genomic: CACCCATGAGGTGATGGGTGGCCTGAAGAATGTCTATGCAATCGGTGCTGgtaatactaa ... tatgtttcagGAATGGTGGCAGCTTTA
EST: CACCCATGAGGTGATGGGTGGCCTGAAGAATGTCTATGCAATCGGTGCTG GAATGGTGGCAGCTTTAEST: gi|32798448|gb|CD950684.1|CD950684
genomic: CACCCATGAGGTGATGGGTGGCCTGAAGAATGTCTATGCAATCGGTGCTGgtaatactaa ... tatgtttcagGAATGGTGGCAGCTTTA
EST: CACCCATGAGGTGATGGGTGGCCTGAAGAATGTCTATGCAATCGGTGCTG GAATGGTGGCAGCTTTAEST: gi|32798637|gb|CD950873.1|CD950873
genomic: CACCCATGAGGTGATGGGTGGCCTGAAGAATGTCTATGCAATCGGTGCTGgtaatactaa ... tatgtttcagGAATGGTGGCAGCTTTA
EST: CACCCATGAGGTGATGGGTGGCCTGAAGAATGTCTATGCAATCGGTGCTG GAATGGTGGCAGCTTTAEST: gi|60359720|gb|DN226693.1|DN226693
genomic: CACCCATGAGGTGATGGGTGGCCTGAAGAATGTCTATGCAATCGGTGCTGgtaatactaa ... tatgtttcagGAATGGTGGCAGCTTTA
EST: TACCCATGAGGTGATGGGTGGCCTGAAGAATGTCTATGCAATCGGTGCTG GAATGGTGGCAGCTTTAACAAACGAGAGTGCAACAAGCAAATCTGTATATTEST: gi|78111933|gb|DV530329.1|DV530329
genomic: CACCCATGAGGTGATGGGTGGCCTGAAGAATGTCTATGCAATCGGTGCTGgtaatactaa ... tatgtttcagGAATGGTGGCAGCTTTAACAAACGAGAGTGCAACAAGCAAATCTGTATATT
EST: AATCGGTGCTG GAAAGGTGGCAGCTTTTACAAACGAGAGTGCAACAAGCAAATCTGTATATTEST: gi|74245778|gb|DT653692.1|DT653692
genomic: AATCGGTGCTGgtaatactaa ... tatgtttcagGAATGGTGGCAGCTTTAACAAACGAGAGTGCAACAAGCAAATCTGTATATT
EST: CACCCATGAGGTGATGGGTGGCCTGAAGAATGTCTATGCAATCGGTGCTG GAATGGTGGCAGCTTTAACAAACGAGAGTGCAACAAGCAAATCTGTATATTEST: gi|32790350|gb|CD942586.1|CD942586
genomic: CACCCATGAGGTGATGGGTGGCCTGAAGAATGTCTATGCAATCGGTGCTGgtaatactaa ... tatgtttcagGAATGGTGGCAGCTTTAACAAACGAGAGTGCAACAAGCAAATCTGTATATT
EST: CACCCATGAGGTGATGGGTGGCCTGAAGAATGTCTATGCAATCGGTGCTG GAATGGTGGCAGCTTTAEST: gi|74237291|gb|DT645205.1|DT645205
genomic: CACCCATGAGGTGATGGGTGGCCTGAAGAATGTCTATGCAATCGGTGCTGgtaatactaa ... tatgtttcagGAATGGTGGCAGCTTTA
EST: CACCCATGAGGTGATGGGTGGCCTGAAGAATGTCTATGCAATCGGTGCTG GAATGGTGGCAGCTTTAACAAACGAGAGTGCAACAAGCAAATCTGTATATTEST: gi|76908350|gb|DV162896.1|DV162896
genomic: CACCCATGAGGTGATGGGTGGCCTGAAGAATGTCTATGCAATCGGTGCTGgtaatactaa ... tatgtttcagGAATGGTGGCAGCTTTAACAAACGAGAGTGCAACAAGCAAATCTGTATATT
EST: CACCCATGAGGTGATGGGTGGCCTGAAGAATGTCTATGCAATCGGTGCTG GAATGGTGGCAGCTTTAACAAACGAGAGTGCAACAAGCAAATCTGTATATT
genomic: CACCCATGAGGTGATGGGTGGCCTGAAGAATGTCTATGCAATCGGTGCTGgtaatactaa ... tatgtttcagGAATGGTGGCAGCTTTAACAAACGAGAGTGCAACAAGCAAATCTGTATATT
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| AAGTTTTTGAGGCAGCCACATTTCATTGTCTGGGACAACAGTGATCTTGTCACCCATGAGGTGATGGGTGGCCTGAAGAATGTCTATGCAATCGGTGCTGgtaatactaacttctgtctttttttaactgacaatattattgtacaataggcatcctactacttgatgttgaagaaaacataacaaacatgtaaatgttt
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CTGAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGAAGA