Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

CCATGCCTCTGTCCAGATCAACATTGGCCACTTGGATGCGAATGGCCTGTATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttcatgatatgtttattgcatttgtctagcccataaaatttaaagcttgagtgtaaagcctacatgaggctttttactgtctatgtgtttcct...

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G125300_T02
intron # 3
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GRMZM2G125300_T02 (Zea mays), 5'ss of exon 3
lower sequence: LOC_Os03g46490.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 3
CCATGCCTCTGTCCAGATCAACATTGGCCACTTGGATGCGAATGGCCTGTATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttcatgatatgtttattgcatttgtctagcccataaaatttaaagcttgagtgtaaagcctacatgaggctttttactgtctatgtgtttcct--
||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||| |||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |   |   ||  |  |||  |  ||||   |   ||  ||  | |     |  | |||          |   ||| |  | |  ||   || |      
CCATGCCTCGGTCCAGATCAACATTGGGCATGTGGATGAGAATGGGCTGTACGATGGCCGCTTCACCACGTTTGCTCTCTCTGGGTTCATCCGTGCTCAGgtaattatcattgtaaacttttgtttatttacatgtgcctgaatttctctttgtgaactgtctcattgctgtattgctct--atttcctgcatgatcatgaa

upper sequence: GRMZM2G125300_T02 (Zea mays), 5'ss of exon 3
lower sequence: GLYMA07G37700.1 (Glycine max), 5'ss of exon 2
CCATGCCTCTGTCCAGATCAACATTGGCCACTTGGATGCGAATGGCCTGTATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttcatgatatgtttattgcatttgtctagcccataaaatttaaagct--tgagtgtaaagcctacatgaggctttttactgtc-tatgtgtttcct---
||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  | ||| ||||||| ||  | || | |||||||||||| || || || || |||      ||| |  || | |  | | ||||  |     |  ||   ||||    |  | || |||  | | || |   ||||   |       |    || |||   
CCATGCCTCGGTTCAGATAAACATTGGCCATTTGGATGAGAATGGTATCTATAATGGTCATTTTTCCACTTCTGCTCTCTCTGGCTTCGTTCGAGCACAG-

upper sequence: GRMZM2G125300_T02 (Zea mays), 5'ss of exon 3
lower sequence: AT5G27700.1 (Arabidopsis thaliana), 5'ss of exon 3
CCATGCCTCTGTCCAGATCAACATTGGCCACTTGGATGCGAATGGCCTGTATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgt----gacagttcatgatatgtttattgcatttgtctagcccataaaatttaa---agcttgagtgta----aagcctacatgagg-------ctttttactgtctatgtgtttcct----------------------------------
 ||||||||||| ||| |||||||||| || || ||||| |||||| ||||    || || |||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||     ||| ||  | | ||| ||  | |||   |    |  |  | | || |      ||| |||||    |||   |  |||         | ||| | | ||||  | | | |                                   
TCATGCCTCTGTTCAGCTCAACATTGGTCATTTAGATGCTAATGGCTTGTACACCGGACAGTTCACAACCTTTGCTCTCTGCGGTTTTGTCCGTGCTCAGgtttgtaacaatttctca-atgctttgtccataattgagtcagaagagagttgatttgttttgtgtgtatcataagaagagttgaacaaccaaccctttgaatttctacttatcttcataggttaattaactattgatgtacacgattgcag

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|211081220|gb|FL122180.1|FL122180
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGTGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAAAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|32836843|gb|CD976521.1|CD976521
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|211133498|gb|FL122205.1|FL122205
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGTGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAAAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|9730947|gb|BE509699.1|BE509699
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACATTTGCTCTTTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGATGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|211083959|gb|FL122199.1|FL122199
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|32843553|gb|CD983234.1|CD983234
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGGCAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|15499195|gb|BI595708.1|BI595708
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTTCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|32843396|gb|CD983077.1|CD983077
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|211133496|gb|FL122203.1|FL122203
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|211181607|gb|FL122698.1|FL122698
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|33099857|gb|CF059817.1|CF059817
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|32843698|gb|CD983379.1|CD983379
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|15426862|gb|BI542684.1|BI542684
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTTCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCCCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|211486991|gb|FL364169.1|FL364169
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGTGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAAAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|16927021|gb|BM080089.1|BM080089
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|211083956|gb|FL122196.1|FL122196
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGAACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|78026424|gb|DV494811.1|DV494811
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|18174789|gb|BM350177.1|BM350177
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCAA-GAACAGGTTG-GGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|32836427|gb|CD976105.1|CD976105
EST:     ACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|18171966|gb|BM347354.1|BM347354
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|67011099|gb|CO439848.1|CO439848
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|32843282|gb|CD982963.1|CD982963
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|32843398|gb|CD983079.1|CD983079
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|28910667|gb|CB331553.1|CB331553
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|32843439|gb|CD983120.1|CD983120
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|211083952|gb|FL122192.1|FL122192
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|32932877|gb|CF037689.1|CF037689
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACATTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGATGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|211081223|gb|FL122183.1|FL122183
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|32843562|gb|CD983243.1|CD983243
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|211091696|gb|FL353088.1|FL353088
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGTGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAAAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|33103940|gb|CF063900.1|CF063900
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|30087061|gb|CB885269.1|CB885269
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|211078490|gb|FL122171.1|FL122171
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|211291611|gb|FL348657.1|FL348657
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGTGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAAAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|32843664|gb|CD983345.1|CD983345
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|32919371|gb|CF024183.1|CF024183
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|60346165|gb|DN213138.1|DN213138
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTTCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|211133497|gb|FL122204.1|FL122204
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|211083951|gb|FL122191.1|FL122191
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|113590052|gb|DW756033.1|DW756033
EST:     TTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
genomic: TTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|211083953|gb|FL122193.1|FL122193
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|211078493|gb|FL122174.1|FL122174
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCACAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|211083954|gb|FL122194.1|FL122194
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|32793079|gb|CD945315.1|CD945315
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|32912478|gb|CF017290.1|CF017290
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|32842936|gb|CD982617.1|CD982617
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|211486990|gb|FL364168.1|FL364168
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGTGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAAAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|33094595|gb|CF054589.1|CF054589
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACATTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGATGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|211133499|gb|FL122206.1|FL122206
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|211007505|gb|FL346577.1|FL346577
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGTGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAAAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|8367895|gb|BE050840.1|BE050840
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGTGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAAAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|211081226|gb|FL122186.1|FL122186
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|32842892|gb|CD982573.1|CD982573
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|211083955|gb|FL122195.1|FL122195
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGTGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAAAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|33104321|gb|CF064281.1|CF064281
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|32843230|gb|CD982911.1|CD982911
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|31355795|gb|CD440152.1|CD440152
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGTGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAAAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|32843212|gb|CD982893.1|CD982893
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|211081222|gb|FL122182.1|FL122182
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|32834170|gb|CD973848.1|CD973848
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|9824794|gb|BE575101.1|BE575101
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|211359564|gb|FL446656.1|FL446656
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|211302561|gb|FL363192.1|FL363192
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGTGACGCAGACAGCTCGTTGGACAGGCTGTGGCAAAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|211081221|gb|FL122181.1|FL122181
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|18165012|gb|BM334851.1|BM334851
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|213182377|gb|FM181171.1|FM181171
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|30088160|gb|CB886365.1|CB886365
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|32843338|gb|CD983019.1|CD983019
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|211081215|gb|FL122175.1|FL122175
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|33091065|gb|CF051059.1|CF051059
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACATTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGATGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|211216507|gb|FL470816.1|FL470816
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|211083950|gb|FL122190.1|FL122190
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|32831416|gb|CD971094.1|CD971094
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|211083961|gb|FL122201.1|FL122201
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|17931052|gb|BM268012.1|BM268012
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGATGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|32842742|gb|CD982423.1|CD982423
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|211534804|gb|FL337816.1|FL337816
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGTGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAAAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|32842901|gb|CD982582.1|CD982582
EST:     ATGATGGTCACTTCCCAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|6695761|gb|AW288839.1|AW288839
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACATTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|211393540|gb|FL318357.1|FL318357
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGTGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAAAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|40336239|gb|CK370309.1|CK370309
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTTCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|30306523|gb|CD001196.1|CD001196
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|31356690|gb|CD441047.1|CD441047
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGTGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAAAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|18162184|gb|BM332023.1|BM332023
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|32843401|gb|CD983082.1|CD983082
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|32842980|gb|CD982661.1|CD982661
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|30088304|gb|CB886509.1|CB886509
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|9952632|gb|BE639320.1|BE639320
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACATTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGATGCAGAC
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGAC
EST: gi|28986590|gb|CB351211.1|CB351211
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|18171086|gb|BM340926.1|BM340926
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTG-GGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|32843719|gb|CD983400.1|CD983400
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|32842946|gb|CD982627.1|CD982627
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|32842953|gb|CD982634.1|CD982634
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|9794730|gb|BE553038.1|BE553038
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTTCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|211414388|gb|FL329260.1|FL329260
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGTGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAAAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|32830767|gb|CD970445.1|CD970445
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|211081228|gb|FL122188.1|FL122188
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|211083960|gb|FL122200.1|FL122200
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|30032046|gb|CB833897.1|CB833897
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|211083949|gb|FL122189.1|FL122189
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT
EST: gi|32843482|gb|CD983163.1|CD983163
EST:     ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAG                         GGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGCTGAT
genomic: ATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGAT

RNA-Seq data


 ATGC   Supported by RNA-Seq exonic block that spans over the splice site

 atgs   Truncated intron sequence

Each block is as long as the maximal overhang of any read spanning the junction.
The score is the number of alignments spanning the junction.


Found data for 4 RNA-Seq libraries.


Block sizes: 49 (upstream exon), 49 (downstream exon)
Score: 2127

CCATGCCTCTGTCCAGATCAACATTGGCCACTTGGATGCGAATGGCCTGTATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGATATCAAGCAGTAGATTTTACATCTAGTTTACCAAGAATTGGACACTGCCT


Block sizes: 49 (upstream exon), 49 (downstream exon)
Score: 964

CCATGCCTCTGTCCAGATCAACATTGGCCACTTGGATGCGAATGGCCTGTATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGATATCAAGCAGTAGATTTTACATCTAGTTTACCAAGAATTGGACACTGCCT


Block sizes: 49 (upstream exon), 49 (downstream exon)
Score: 1135

CCATGCCTCTGTCCAGATCAACATTGGCCACTTGGATGCGAATGGCCTGTATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGATATCAAGCAGTAGATTTTACATCTAGTTTACCAAGAATTGGACACTGCCT


Block sizes: 49 (upstream exon), 49 (downstream exon)
Score: 747

CCATGCCTCTGTCCAGATCAACATTGGCCACTTGGATGCGAATGGCCTGTATGATGGTCACTTCACAACGTTTGCTCTCTCTGGGTTTGTCCGTGCTCAGgtgacagttc ... ttgtgcacagGGCGACGCAGACAGCTCCTTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTTGATATCAAGCAGTAGATTTTACATCTAGTTTACCAAGAATTGGACACTGCCT