1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
GAAACTTGGCTGGGCCATCGATGAGGATTTTGGTTCATTTGAGGCACTTGTAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatattatgctttgtttatgtttatcgataacagttgaagatgtgttctgttgaccatgaacctcatgcttctctgcag
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G124455_T01 |
intron # | 3 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAEST: gi|149008748|gb|EE040945.2|EE040945
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATA
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|60351803|gb|DN218776.1|DN218776
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|40337235|gb|CK371305.1|CK371305
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|31664230|gb|CD572955.1|CD572955
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|148948500|gb|EC894019.2|EC894019
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|31997580|gb|CD661666.1|CD661666
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|50329149|gb|CO524275.1|CO524275
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|28576119|gb|CB282011.1|CB282011
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|76292534|gb|DV032102.1|DV032102
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|71439541|gb|DR820591.1|DR820591
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|148933163|gb|EC876803.2|EC876803
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCCGTTGAAACTACAGCTEST: gi|60358457|gb|DN225430.1|DN225430
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|71439547|gb|DR820597.1|DR820597
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|67010892|gb|CO439641.1|CO439641
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|148972354|gb|EE023268.2|EE023268
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|67013650|gb|CO442399.1|CO442399
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|71440079|gb|DR821129.1|DR821129
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|110194904|gb|EC876802.1|EC876802
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|29131037|gb|CB381741.1|CB381741
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: AAAGAGGATGAATGCACGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCACGTTGAAACTACAGCEST: gi|101389793|gb|EB816827.1|EB816827
genomic: AAAGAGGATGAATGCA-GAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCA-GTTGAAACTACAGC
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|29544566|gb|CB604946.1|CB604946
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTCAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|149040135|gb|EE046786.2|EE046786
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|71298564|gb|DR785257.1|DR785257
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|166570251|gb|EG154517.1|EG154517
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCEST: gi|149107703|gb|EE189579.2|EE189579
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTC
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|71330409|gb|DR801958.1|DR801958
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|26557504|gb|CA829739.1|CA829739
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCEST: gi|149107702|gb|EE189578.2|EE189578
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGG-CAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGC
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|29543442|gb|CB603838.1|CB603838
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|71768769|gb|DR966706.1|DR966706
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|149021338|gb|EE045792.2|EE045792
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|71426927|gb|DR807977.1|DR807977
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|101384391|gb|EB814240.1|EB814240
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACEST: gi|149095146|gb|EE180760.2|EE180760
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAAC
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|211100828|gb|FL431020.1|FL431020
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTCTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|74244470|gb|DT652384.1|DT652384
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|50336612|gb|CO531738.1|CO531738
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|50329148|gb|CO524274.1|CO524274
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|76014752|gb|DT941922.1|DT941922
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|12969984|gb|BG266756.1|BG266756
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|60351636|gb|DN218609.1|DN218609
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|29544474|gb|CB604854.1|CB604854
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTEST: gi|6653893|gb|AW267298.1|AW267298
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|50331196|gb|CO526322.1|CO526322
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|71437068|gb|DR818118.1|DR818118
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|4776003|gb|AI665006.1|AI665006
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|71447967|gb|DR829017.1|DR829017
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|67011046|gb|CO439795.1|CO439795
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|40336945|gb|CK371015.1|CK371015
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|71426926|gb|DR807976.1|DR807976
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|91056846|gb|EB167264.1|EB167264
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|71440078|gb|DR821128.1|DR821128
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|91056845|gb|EB167263.1|EB167263
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|29544083|gb|CB604463.1|CB604463
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|29543885|gb|CB604265.1|CB604265
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|211255955|gb|FL470283.1|FL470283
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|67018883|gb|CO447632.1|CO447632
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|149102601|gb|EE188241.2|EE188241
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|50336630|gb|CO531756.1|CO531756
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|29577041|gb|CB617153.1|CB617153
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAEST: gi|71298562|gb|DR785256.1|DR785256
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCA
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|110934226|gb|EE154452.1|EE154452
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|37395751|gb|CF635158.1|CF635158
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|74233583|gb|DT641497.1|DT641497
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|71768768|gb|DR966705.1|DR966705
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|101400004|gb|EB821849.1|EB821849
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|71330410|gb|DR801959.1|DR801959
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|211255956|gb|FL470284.1|FL470284
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|149040136|gb|EE046787.2|EE046787
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|29544216|gb|CB604596.1|CB604596
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|5081114|gb|AI738160.1|AI738160
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTNCAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|148993134|gb|EE033733.2|EE033733
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|28568998|gb|CB280873.1|CB280873
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGEST: gi|76292533|gb|DV032101.1|DV032101
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAG
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|9733426|gb|BE512283.1|BE512283
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|78027681|gb|DV496068.1|DV496068
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|67010751|gb|CO439500.1|CO439500
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTNTGGATAAAAGAGGCAAAAA-GCTTTCAGTTGAAACTACAGCEST: gi|148931241|gb|EC874027.2|EC874027
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAA-GAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGC
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCTEST: gi|29545016|gb|CB605194.1|CB605194
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
EST: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTG TGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
genomic: TAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatat ... ttctctgcagTGGTTAGCTTTGGATAAAGAGGCAAAAAAGCTTTCAGTTGAAACTACAGCT
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GAAACTTGGCTGGGCCATCGATGAGGATTTTGGTTCATTTGAGGCACTTGTAAAGAGGATGAATGCAGAAGGCGCTGCTTTACAAGGATCTGGATGGGTGgtatgtatattatgctttgtttatgtttatcgataacagttgaagatgtgttctgttgaccatgaacctcatgcttctctgcag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGAGG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGAGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGGAT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGGATG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGCT