Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TACAAGCCGGAATCATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctactgctatgccttctcatctgtccccttatgttgccaaatgtatcattattgacagatgtcctccattgaactaactgaatgcttttttaca...

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G115757_T01
intron # 3
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GRMZM2G115757_T01 (Zea mays), 5'ss of exon 3
lower sequence: LOC_Os09g32526.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 3
TACAAGCCGGAATCATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctactgctatgccttctcatctgtccc-cttatgttgccaaatgtatcattattgacaga---tgtcctccattgaactaactgaatgcttttttaca
 ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |  |  | |||  | |   ||||     || | ||  |     |  | ||||| |   |   |||  | || |   |       || | |||  |  
CACAAGCCAGAATCCTGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGCGACAGAGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtttgatattctgctgtatggcctgttttgtttttatttactggcatcactttatttatgaagcctgtagttcacttggcctctgtcatccatttacag-
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|211289099|gb|FL333063.1|FL333063
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211489418|gb|FL342607.1|FL342607
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTKGATTCAAGCTATGAWAGANGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211494821|gb|FL326687.1|FL326687
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|32945395|gb|CF050214.1|CF050214
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211370098|gb|FL332312.1|FL332312
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211081043|gb|FL342751.1|FL342751
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211072827|gb|FL342708.1|FL342708
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211098726|gb|FL335593.1|FL335593
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211100736|gb|FL316240.1|FL316240
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAWAGADGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211028134|gb|FL319697.1|FL319697
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211409838|gb|FL347396.1|FL347396
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGAYTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211459454|gb|FL315088.1|FL315088
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|213167911|gb|FM194199.1|FM194199
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211322569|gb|FL457011.1|FL457011
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|32936362|gb|CF041181.1|CF041181
EST:     GGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: GGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211270294|gb|FL346405.1|FL346405
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211301545|gb|FL314593.1|FL314593
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGC                         GGGAAAACTTACTGATGG
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGG-AAAACTTACTGATGG
EST: gi|211437195|gb|FL306602.1|FL306602
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|32867013|gb|CF006695.1|CF006695
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211337315|gb|FL316037.1|FL316037
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211213871|gb|FL358296.1|FL358296
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|51592784|gb|CV071930.1|CV071930
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211083191|gb|FL315297.1|FL315297
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GAAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211440504|gb|FL341612.1|FL341612
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|61118943|gb|DN559904.1|DN559904
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211159386|gb|FL363030.1|FL363030
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAKGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211516972|gb|FL321890.1|FL321890
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|32912548|gb|CF017360.1|CF017360
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|32868578|gb|CF008260.1|CF008260
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211101914|gb|FL367360.1|FL367360
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|32918717|gb|CF023529.1|CF023529
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211104380|gb|FL367367.1|FL367367
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211404271|gb|FL334019.1|FL334019
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|16926838|gb|BM079906.1|BM079906
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211388267|gb|FL318320.1|FL318320
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211428324|gb|FL365900.1|FL365900
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GAAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211188215|gb|FL326432.1|FL326432
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211333831|gb|FL364098.1|FL364098
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211520179|gb|FL353415.1|FL353415
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|33095201|gb|CF055195.1|CF055195
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211293394|gb|FL333104.1|FL333104
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAWAGANGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|37377785|gb|CF625531.1|CF625531
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211153879|gb|FL318976.1|FL318976
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211101116|gb|FL333019.1|FL333019
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|32862807|gb|CF002489.1|CF002489
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211185806|gb|FL326412.1|FL326412
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211520399|gb|FL361935.1|FL361935
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211088390|gb|FL316169.1|FL316169
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAWAGANGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211021432|gb|FL345700.1|FL345700
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTTGATT
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTT-GATT
EST: gi|32911999|gb|CF016811.1|CF016811
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|32868577|gb|CF008259.1|CF008259
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|28568976|gb|CB280851.1|CB280851
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211314746|gb|FL360965.1|FL360965
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211508306|gb|FL361511.1|FL361511
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGANGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211525878|gb|FL340825.1|FL340825
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|32906815|gb|CF011628.1|CF011628
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211349792|gb|FL343922.1|FL343922
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211252942|gb|FL336101.1|FL336101
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTAATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211185709|gb|FL321584.1|FL321584
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|60346800|gb|DN213773.1|DN213773
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211268024|gb|FL355157.1|FL355157
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211320870|gb|FL365290.1|FL365290
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAMGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|32910868|gb|CF015680.1|CF015680
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211100907|gb|FL435527.1|FL435527
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211134098|gb|FL315803.1|FL315803
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|32936566|gb|CF041385.1|CF041385
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211412847|gb|FL367107.1|FL367107
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211113927|gb|FL310144.1|FL310144
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGANGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211148351|gb|FL363510.1|FL363510
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|27522007|gb|CA989113.1|CA989113
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211308758|gb|FL367419.1|FL367419
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211453594|gb|FL365496.1|FL365496
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|33095696|gb|CF055690.1|CF055690
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|32860174|gb|CD999855.1|CD999855
EST:     CGTGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|40334323|gb|CK368393.1|CK368393
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211023227|gb|FL319668.1|FL319668
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|18170517|gb|BM340357.1|BM340357
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|32911998|gb|CF016810.1|CF016810
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211424455|gb|FL316413.1|FL316413
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|60357970|gb|DN224943.1|DN224943
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211083684|gb|FL339615.1|FL339615
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211005223|gb|FL360681.1|FL360681
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211287072|gb|FL337514.1|FL337514
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAKGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|37399557|gb|CF637108.1|CF637108
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211159411|gb|FL365688.1|FL365688
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211075569|gb|FL342731.1|FL342731
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211407474|gb|FL353818.1|FL353818
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|60350853|gb|DN217826.1|DN217826
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211229020|gb|FL345085.1|FL345085
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GAAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|16917347|gb|BM073242.1|BM073242
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211081106|gb|FL344986.1|FL344986
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAKGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211126089|gb|FL352113.1|FL352113
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|32935279|gb|CF040091.1|CF040091
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGG                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211533904|gb|FL308313.1|FL308313
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211081045|gb|FL342753.1|FL342753
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211205132|gb|FL308046.1|FL308046
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGANGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|32912757|gb|CF017569.1|CF017569
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|211181405|gb|FL343272.1|FL343272
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGANGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
EST: gi|60344720|gb|DN211693.1|DN211693
EST:     CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGT                         GGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC
genomic: CATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctac ... ttttttacagGGAAAACTTACTGATGGAACGGTTTTTGATTCAAGCTATGAAAGAGGTGAC

Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
TACAAGCCGGAATCATGCAGCATTCAAGCTCACAAAGGTGACAAGGTTAAAGTTCACTACCGTgtaagtctactgctatgccttctcatctgtccccttatgttgccaaatgtatcattattgacagatgtcctccattgaactaactgaatgcttttttaca

- - - - - - - - - - - - CAAGCT
- - - - - - - - - - - - - AGCTCA