1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
AAGAATTTTAAATGCTGTTGATGCGAGCTGGAACTCATCAACACTATGAACCAAACAATAAGGTCTTAGGAGAGAATGGCCTCATGTTGGTCATAGCATGgtaaggtcagttttacaaataattgtttcaccctcagatccaatctttttttccttttgccttacattttgatatctcgtacag
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G108364_T01 |
intron # | 3 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: CCAAACAATAAGGTCTTAGGAGAGAATGGCCTCATGTTGGTCATAGCATG GTAAATTGGAAAACTGATTTAAGTATTCATTGTGGTGCTGTTGTGACTATGEST: gi|211391902|gb|FL468029.1|FL468029
genomic: CCAAACAATAAGGTCTTAGGAGAGAATGGCCTCATGTTGGTCATAGCATGgtaaggtcag ... tctcgtacagGTAAATTGGAAAACTGATTTAAGTATTCATTGTGGTGCTGTTGTGACTATG
EST: TTAGGAGAGAATGGCCTCATGTTGGTCATAGCATG GTAAATTGGAAAACTKATTTAAGTATTCATTGTGGYTGCTGTTGTGACTATEST: gi|86468836|gb|DY235206.1|DY235206
genomic: TTAGGAGAGAATGGCCTCATGTTGGTCATAGCATGgtaaggtcag ... tctcgtacagGTAAATTGGAAAACTGATTTAAGTATTCATTGTGG-TGCTGTTGTGACTAT
EST: CCAAACAATAAGGTCTTAGGAGAGAATGGCCTCATGTTGGTCATAGCATG GTAAATTGGAAAACTGATTTAAGTATTCATTGTGGTGCTGTTGTGACTATGEST: gi|6827711|gb|AW331354.1|AW331354
genomic: CCAAACAATAAGGTCTTAGGAGAGAATGGCCTCATGTTGGTCATAGCATGgtaaggtcag ... tctcgtacagGTAAATTGGAAAACTGATTTAAGTATTCATTGTGGTGCTGTTGTGACTATG
EST: AAGGTCTTAGGAGAGAATGGCCTCATGTTGGTCATAGCATG GTAAATTGGAAAACTGATTTAAGTATTCATTGTGGTGCTGTTGTGACTATGEST: gi|76921088|gb|DV168449.1|DV168449
genomic: AAGGTCTTAGGAGAGAATGGCCTCATGTTGGTCATAGCATGgtaaggtcag ... tctcgtacagGTAAATTGGAAAACTGATTTAAGTATTCATTGTGGTGCTGTTGTGACTATG
EST: CCAAACAATAAGGTCTTAGGAGAGAATGGCCTCATGTTGGTCATAGCATGGTAAGEST: gi|12972747|gb|BG268136.1|BG268136
genomic: CCAAACAATAAGGTCTTAGGAGAGAATGGCCTCATGTTGGTCATAGCA---T--Ggtaaggtcag ... tctcgt
EST: CCAAACAATAAGGTCTTAGGAGAGAATGGCCTCATGTTGGTCATAGCATG GTAAATTGGAAAACTGATTTAAGTATTCATTGTGGTGCTGTTGTGACTATGEST: gi|149072983|gb|EE161244.2|EE161244
genomic: CCAAACAATAAGGTCTTAGGAGAGAATGGCCTCATGTTGGTCATAGCATGgtaaggtcag ... tctcgtacagGTAAATTGGAAAACTGATTTAAGTATTCATTGTGGTGCTGTTGTGACTATG
EST: CCAAACAATAAGGTCTTAGGAGAGAATGGCCTCATGTTGGTCATAGCATG GTAAATTGGAAAACTGATTTAAGTATTCATTGTGGTGCTGTTGTGACTATGEST: gi|89106086|gb|DY576303.1|DY576303
genomic: CCAAACAATAAGGTCTTAGGAGAGAATGGCCTCATGTTGGTCATAGCATGgtaaggtcag ... tctcgtacagGTAAATTGGAAAACTGATTTAAGTATTCATTGTGGTGCTGTTGTGACTATG
EST: CCAAACAATAAGGTCTTAGGAGAGAATGGCCTCATGTTGGTCATAGCATG GTAAATTGGAAAACTGATTTAAGTATTCATTGTGGTGCTGTTGTGACTATG
genomic: CCAAACAATAAGGTCTTAGGAGAGAATGGCCTCATGTTGGTCATAGCATGgtaaggtcag ... tctcgtacagGTAAATTGGAAAACTGATTTAAGTATTCATTGTGGTGCTGTTGTGACTATG
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| AAGAATTTTAAATGCTGTTGATGCGAGCTGGAACTCATCAACACTATGAACCAAACAATAAGGTCTTAGGAGAGAATGGCCTCATGTTGGTCATAGCATGgtaaggtcagttttacaaataattgtttcaccctcagatccaatctttttttccttttgccttacattttgatatctcgtacag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGGAGA