1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
AGATGGCGCTGGACTGCTTCTTCGCTGTATGGTTTGTTGTGGGAAATGTGTGGGTGTTTGGTGGACATTCTTCCGCCCATGACGCACCCAACCTGTACAGgtgcgctcctaacctgccatgatggcgtaccttcgcatacttatttcgatgtttcaaggtgtgtgtactcatgtttttcag
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G092244_T03 |
intron # | 3 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TGGGTGTTTGGTGGACATTCTTCCGCCCATGACGCACCCAACCTGTACAG GTTGTGCATAGCCTTCCTCACTTTCAGCTGCATTGGCTATGCGATGCCCTTEST: gi|101389625|gb|EB816746.1|EB816746
genomic: TGGGTGTTTGGTGGACATTCTTCCGCCCATGACGCACCCAACCTGTACAGgtgcgctcct ... tgtttttcagGTTGTGCATAGCCTTCCTCACTTTCAGCTGCATTGGCTATGCGATGCCCTT
EST: CATTCTTCCGCCCAGGACGCACCCAACCTGTACAG GTTGTGCATAGCCTTCCTCACTTTCAGTTGCATGGGCTATGCGATGCCCTTEST: gi|71771564|gb|DR969501.1|DR969501
genomic: CATTCTTCCGCCCATGACGCACCCAACCTGTACAGgtgcgctcct ... tgtttttcagGTTGTGCATAGCCTTCCTCACTTTCAGCTGCATTGGCTATGCGATGCCCTT
EST: GGTGGACATTCTTCCGCCCATGACGCACCCAACCTGTACAG GTTGTGCATAGCCTTCCTCACTTTCAGCTGCATTGGCTATGCGATGCCCTT
genomic: GGTGGACATTCTTCCGCCCATGACGCACCCAACCTGTACAGgtgcgctcct ... tgtttttcagGTTGTGCATAGCCTTCCTCACTTTCAGCTGCATTGGCTATGCGATGCCCTT
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| AGATGGCGCTGGACTGCTTCTTCGCTGTATGGTTTGTTGTGGGAAATGTGTGGGTGTTTGGTGGACATTCTTCCGCCCATGACGCACCCAACCTGTACAGgtgcgctcctaacctgccatgatggcgtaccttcgcatacttatttcgatgtttcaaggtgtgtgtactcatgtttttcag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGTGG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGTGGA