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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TGTTATCGGCACACTTCGTGGGTTCGACCAGTTCATGAATCTGGTGGTGGACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTGgtaagttttcttctactgaaaggttatttggtacttgcttagtaacatgctgacagcctactattatcctcag

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G083642_T02
intron # 3
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GRMZM2G083642_T02 (Zea mays), 5'ss of exon 3
lower sequence: LOC_Os03g29740.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 3
TGTTATCGGCACACTTCGTGGGTTCGACCAGTTCATGAATCTGGTGGTGGACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTGgtaagttttcttctactgaaaggttatttggt-acttgcttag-taacatgctgacagcctactattatcctcag----------------------------------------------------
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AATTGTTGGTACGCTCCGTGGATTCGATCAGTTTATGAATTTGGTGGTGGACAACACGGTAGAGGTCAATGGAAATGACAAGACTGATATTGGAATGGTGgtaagccttctg----tgaagaatcacttgcttatttgtttaaactctatacttattgcaaggagatttactagcaagttgcaatatatacattgattatatgctgatgcccctaaatcatttgcag

upper sequence: GRMZM2G083642_T02 (Zea mays), 5'ss of exon 3
lower sequence: GLYMA03G35490.1 (Glycine max), 5'ss of exon 3
TGTTATCGGCACACTTCGTGGGTTCGACCAGTTCATGAATCTGGTGGTGGACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTGgtaagttttcttctac---tgaaaggttatttggtacttgcttagtaacatgctgacagcctactattatcctcag------------------
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GGTTGTTGGTACTCTCCGTGGCTTCGACCAGTTTATGAATTTAGTTGTTGACAACACTGTGGAAGTGAATGGCAATGAGAAAAATGACATAGGGATGGTGgtgagtcctcttttgcatatcaatggtcatggtatagcag-ttaatagagcatggacatggtttttagattgataattttccctcttattgcag

upper sequence: GRMZM2G083642_T02 (Zea mays), 5'ss of exon 3
lower sequence: AT3G11500.1 (Arabidopsis thaliana), 5'ss of exon 3
TGTTATCGGCACACTTCGTGGGTTCGACCAGTTCATGAATCTGGTGGTGGACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTGgtaagttttcttcta---ctgaaaggttatttggtacttgcttagtaacatgct-------gacagcctactattatcctcag-----
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GGTTGTTGGAACTCTCCGTGGCTTTGATCAGTTCATGAATCTTGTTGTGGATAACACTGTTGAAGTCAATGGTGATGACAAAACTGACATTGGGATGGTGgtacgtttctctccatctctctaactcacccacagaatcttcttgtcatttgttttgtttaaacattctacttttttcctggatgcag

upper sequence: GRMZM2G083642_T02 (Zea mays), 5'ss of exon 3
lower sequence: AT2G23930.1 (Arabidopsis thaliana), 5'ss of exon 3
TGTTATCGGCACACTTCGTGGGTTCGACCAGTTCATGAATCTGGTGGTGGACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTGgtaagttttcttctactgaaaggttat-ttggtacttgcttagtaacat--gctgacagcctactattatcctcag-----
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GGTTACTGGAACTCTTCGTGGGTTTGATCAGTTCATGAATCTTGTTGTGGATAACACTGTTGAGGTGAACGGTAACGACAAAACCGACATCGGGATGGTGgtaagtctctcgattctgtgtccctttgtcgttaatcttctgctgctcttgactgatgttttactttggttttgggagcag

upper sequence: GRMZM2G083642_T02 (Zea mays), 5'ss of exon 3
lower sequence: Vv08s0007g03130.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 3
TGTTATCGGCACACTTCGTGGGTTCGACCAGTTCATGAATCTGGTGGTGGACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTGgtaagttttcttctactgaaaggttatttggtacttg----cttagtaac-atgctgacagcctactattatc--ctcag----------------------------------
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GGTGGTTGGAACTCTTCGTGGGTTTGACCAGTTCATGAACCTGGTGGTGGACAACACTGTGGAAGTGAATGGAAATGAGAAAACTGATATAGGCATGGTGgtaggttaatttttcatcttgttttatttttctcttaatattttatttaccatttggatatgatactgtaattagctcagccttttgcaattgatgtcacaattgtacctgcag

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|4730334|gb|AI649500.1|AI649500
EST:     ACAACCCTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTG                         GTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCCCTGGAGCCAGTTGCG
genomic: ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTGgtaagttttc ... ttatcctcagGTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
EST: gi|32918711|gb|CF023523.1|CF023523
EST:     ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTG                         GTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
genomic: ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTGgtaagttttc ... ttatcctcagGTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
EST: gi|4730324|gb|AI649490.1|AI649490
EST:     ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTG                         GTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
genomic: ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTGgtaagttttc ... ttatcctcagGTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
EST: gi|211056773|gb|FL266053.1|FL266053
EST:     ACAACATTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTG                         GTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
genomic: ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTGgtaagttttc ... ttatcctcagGTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
EST: gi|211056780|gb|FL266060.1|FL266060
EST:     ACAACATTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTG                         GTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
genomic: ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTGgtaagttttc ... ttatcctcagGTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
EST: gi|32851081|gb|CD990762.1|CD990762
EST:     ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTG                         GTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
genomic: ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTGgtaagttttc ... ttatcctcagGTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
EST: gi|211059777|gb|FL266067.1|FL266067
EST:     ACAACATTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTG                         GTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
genomic: ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTGgtaagttttc ... ttatcctcagGTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
EST: gi|211050870|gb|FL266019.1|FL266019
EST:     ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTG                         GTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
genomic: ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTGgtaagttttc ... ttatcctcagGTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
EST: gi|211056779|gb|FL266059.1|FL266059
EST:     ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTG                         GTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
genomic: ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTGgtaagttttc ... ttatcctcagGTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
EST: gi|211050875|gb|FL266024.1|FL266024
EST:     ACAACATTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTG                         GTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
genomic: ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTGgtaagttttc ... ttatcctcagGTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
EST: gi|211047917|gb|FL266005.1|FL266005
EST:     ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTG                         GTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
genomic: ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTGgtaagttttc ... ttatcctcagGTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
EST: gi|211044960|gb|FL265995.1|FL265995
EST:     ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTG                         GTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
genomic: ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTGgtaagttttc ... ttatcctcagGTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
EST: gi|211044958|gb|FL265993.1|FL265993
EST:     ACAACATTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTG                         GTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
genomic: ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTGgtaagttttc ... ttatcctcagGTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
EST: gi|211056776|gb|FL266056.1|FL266056
EST:     ACAACATTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTG                         GTTATCAGGAGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
genomic: ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTGgtaagttttc ... ttatcctcagGTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
EST: gi|211053829|gb|FL266039.1|FL266039
EST:     ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTG                         GTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
genomic: ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTGgtaagttttc ... ttatcctcagGTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
EST: gi|211047915|gb|FL266003.1|FL266003
EST:     ACAACATTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTG                         GTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
genomic: ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTGgtaagttttc ... ttatcctcagGTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
EST: gi|211053824|gb|FL266034.1|FL266034
EST:     ACAACATTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTG                         GTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
genomic: ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTGgtaagttttc ... ttatcctcagGTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
EST: gi|211050872|gb|FL266021.1|FL266021
EST:     ACAACATTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTG                         GTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
genomic: ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTGgtaagttttc ... ttatcctcagGTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
EST: gi|32912905|gb|CF017717.1|CF017717
EST:     GCAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTG                         GTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
genomic: ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTGgtaagttttc ... ttatcctcagGTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
EST: gi|32906791|gb|CF011604.1|CF011604
EST:     ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTG                         GTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
genomic: ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTGgtaagttttc ... ttatcctcagGTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
EST: gi|9794235|gb|BE552543.1|BE552543
EST:     ACAACATTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTG                         GTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
genomic: ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTGgtaagttttc ... ttatcctcagGTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
EST: gi|32862587|gb|CF002269.1|CF002269
EST:     ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTG                         GTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCA
genomic: ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTGgtaagttttc ... ttatcctcagGTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
EST: gi|33102583|gb|CF062543.1|CF062543
EST:     ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTG                         GTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
genomic: ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTGgtaagttttc ... ttatcctcagGTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
EST: gi|211056778|gb|FL266058.1|FL266058
EST:     ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTG                         GTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
genomic: ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTGgtaagttttc ... ttatcctcagGTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
EST: gi|32943915|gb|CF048734.1|CF048734
EST:     ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGCG                         GTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
genomic: ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTGgtaagttttc ... ttatcctcagGTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
EST: gi|32911245|gb|CF016057.1|CF016057
EST:     ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTG                         GTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
genomic: ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTGgtaagttttc ... ttatcctcagGTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
EST: gi|32829993|gb|CD969671.1|CD969671
EST:     ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTG                         GTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
genomic: ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTGgtaagttttc ... ttatcctcagGTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
EST: gi|211056781|gb|FL266061.1|FL266061
EST:     ACAACATTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTG                         GTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
genomic: ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTGgtaagttttc ... ttatcctcagGTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
EST: gi|15499226|gb|BI595739.1|BI595739
EST:     ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTG                         GTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
genomic: ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTGgtaagttttc ... ttatcctcagGTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
EST: gi|211050873|gb|FL266022.1|FL266022
EST:     ACAACATTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTG                         GTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
genomic: ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTGgtaagttttc ... ttatcctcagGTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
EST: gi|211050879|gb|FL266028.1|FL266028
EST:     ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTG                         GTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
genomic: ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTGgtaagttttc ... ttatcctcagGTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
EST: gi|32847475|gb|CD987156.1|CD987156
EST:     ACAACCCTGTGGAGGTCAATGGAAATGCCAAAACAGATATTGGAATGGTG                         GTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
genomic: ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTGgtaagttttc ... ttatcctcagGTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
EST: gi|32917219|gb|CF022031.1|CF022031
EST:     ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTG                         GTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
genomic: ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTGgtaagttttc ... ttatcctcagGTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
EST: gi|20299967|gb|BQ162910.1|BQ162910
EST:     ACAACATTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTG                         GTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
genomic: ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTGgtaagttttc ... ttatcctcagGTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
EST: gi|32908376|gb|CF013189.1|CF013189
EST:     ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTG                         GTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
genomic: ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTGgtaagttttc ... ttatcctcagGTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
EST: gi|211050876|gb|FL266025.1|FL266025
EST:     ACAACATTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTG                         GTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
genomic: ACAACACTGTGGAGGTCAATGGAAATGACAAAACAGATATTGGAATGGTGgtaagttttc ... ttatcctcagGTTATCAGGGGAAACAGTGTTGTAATGATCGAGGCACTGGAGCCAGTTGCG
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Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
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- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GTGGAG
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