ERISdb: a Database of Plant Splice Sites

General
Orthologs
EST
RNA-Seq
cis-regulatory elements

Sequence

atgc intronic sequence ATGC exonic sequence

GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctcctgtgcactatgagggtctgttcattttctgatgattggtgaatgcatgtcgacagccttatttgttctaatacag

Basic information

species	Zea mays
transcript	GRMZM2G074300_T01
intron #	3
splice site	5'
intron type	U2

Orthologous splice sites

atgc intronic sequence ATGC exonic sequence

upper sequence: GRMZM2G074300_T01 (Zea mays), 5'ss of exon 3
lower sequence: LOC_Os03g38000.2 (Oryza sativa), 5'ss of exon 2

GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctcctgtgcactatgagg-gtctgttcattttctgatgattggtgaatgcat----gtcga-cagccttatttgttctaatacag
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | | ||| || ||  |      ||| ||  |  ||||  || ||  |  |||    || || | |     ||| |||| || |||
GGCTTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGCGAGgtgagttc-cttgtacaataaaaattacatgtgcaaatg-tgatattttgtacacacattaaagttgaactgatccctttattcttattcag

upper sequence: GRMZM2G074300_T01 (Zea mays), 5'ss of exon 3
lower sequence: PP1S127_74V6.1 (Physcomitrella patens), 5'ss of exon 4

GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgt----tagtgctcctgtgcactatgagggtctg----ttcattttctgatgattggtgaatgcat---gtcg-acagccttatttgttctaatacag--
||| || || || || ||  | ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    | |  | |       |||| |    | |    |  | ||| | | | |     ||    |    | | | |   ||||      ||||  |   
GGCTTGTTACGGAGTGCTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCCAAGGGTTGTGAGgtatgattggtccctcaactgctatcatttcccgaaaatgtactttttaaagttaaagaaacatgttagattgcaaaaaattatgctcggtaatgtaacg

upper sequence: GRMZM2G074300_T01 (Zea mays), 5'ss of exon 3
lower sequence: PP1S31_178V6.1 (Physcomitrella patens), 5'ss of exon 4

GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctcctgtgcactatgagggtctgttcatt------ttctgat-gattggtgaatgcatgtcgacagccttatt--tgttctaatacag------
||| |||||||| || ||  | ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||  |    ||| | |   |||  | |     ||||      || || |  | || || |   | || ||||| | |||   |||  |  | |        
GGCTTGCTATGGAGTGCTGAGGTTCATCATGGAGAGCGGTGCCAAGGGTTGTGAGgtatggtaacctctactggatgtagtttgagccattgaaacgttttgtttaactgatggaccta-gtggacagtcgtatgaatgtatttttgcgaaatatc

upper sequence: GRMZM2G074300_T01 (Zea mays), 5'ss of exon 3
lower sequence: PP1S41_146V6.1 (Physcomitrella patens), 5'ss of exon 4

GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctcc------tgtgcactatgagggtctgttcattttctgatg--attggtgaat--gcatgtcgacagccttatttgttctaatacag-------
||| |||||||| ||  |  | ||  | |||||||| |||||||||||||||||||||  |  ||       | || ||| ||||   ||| || ||   || ||  |||     ||   | |    | ||    || |  || |||||         
GGCTTGCTATGGAGTGTTGAGGTTCATCATGGAGAGCGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttgttattctctactttatgtactttgaga--ctgatctttgaatggtgtaattaactgattaacctactaatagaaacatat-ctcgaatacgtgaatttt

upper sequence: GRMZM2G074300_T01 (Zea mays), 5'ss of exon 3
lower sequence: PP1S136_175V6.1 (Physcomitrella patens), 5'ss of exon 4

GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgt-tagtgctcctgtgc-----actatgagggtctgttcattttct--gatgattggtgaatg-catgtc------gacagccttatttgttctaatacag
||| |||||||| || ||  | ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||   |||  | |||||     | | ||   | |  |  |||   |  | |  |   | | ||  |||||      |||  ||| |     || ||  || 
GGCTTGCTATGGAGTGCTGAGGTTCATCATGGAGAGCGGTGCCAAGGGTTGTGAGgtactgtgaccatgtgcttgatattttggaagccattgtattcctttgggtattcatttagtgatatgtcattccggacgccctaaaaaactccaa-gcat

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments

ATGC    EST sequence
ATGC    genomic sequence (exon)
ATGC    genomic sequence (truncated intron)

EST: gi|28361609|gb|CB239965.1|CB239965

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCCATGAAGTT
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCC-ATGAAGTT

EST: gi|76017326|gb|DT944496.1|DT944496

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|211264435|gb|FL070938.1|FL070938

EST:     GCTATGGCGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|148999968|gb|EE037043.2|EE037043

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|71304431|gb|DR788336.1|DR788336

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|26457601|gb|CA829184.1|CA829184

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAATTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|37424890|gb|CF650179.1|CF650179

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|149083927|gb|EE173304.2|EE173304

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|148933725|gb|EC877641.2|EC877641

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCCAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|28361791|gb|CB240147.1|CB240147

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|211374869|gb|FL197001.1|FL197001

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAA
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAA

EST: gi|78121892|gb|DV540276.1|DV540276

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|4874453|gb|AI673973.1|AI673973

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAA
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAA

EST: gi|32164835|gb|CD670153.1|CD670153

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|9254109|gb|BE344577.1|BE344577

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAATTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|27522126|gb|CA989232.1|CA989232

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|211514361|gb|FL197100.1|FL197100

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|211514357|gb|FL197096.1|FL197096

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTNGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTT
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATT-GTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTT

EST: gi|21988014|gb|BQ779542.1|BQ779542

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAATTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|211512006|gb|FL197086.1|FL197086

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCCAGTCCATGAAATTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|91057136|gb|EB167554.1|EB167554

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCANAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|60343353|gb|DN210326.1|DN210326

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|29576818|gb|CB616930.1|CB616930

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|31998117|gb|CD661932.1|CD661932

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|211264443|gb|FL070946.1|FL070946

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAATTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|4886195|gb|AI677315.1|AI677315

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAATTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|76284526|gb|DV024094.1|DV024094

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|27521990|gb|CA989096.1|CA989096

EST:     GCTATGGTGTTTTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|22542258|gb|BU092696.1|BU092696

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAATTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|211507270|gb|FL197054.1|FL197054

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAATTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|60395599|gb|DN228469.1|DN228469

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|71436918|gb|DR817968.1|DR817968

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|67015398|gb|CO444147.1|CO444147

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|149044287|gb|EE047535.2|EE047535

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|5455784|gb|AI833474.1|AI833474

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAATTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|22715617|gb|BU197866.1|BU197866

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAATTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|32864638|gb|CF004320.1|CF004320

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|211507274|gb|FL197058.1|FL197058

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|211264444|gb|FL070947.1|FL070947

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAATTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|32850480|gb|CD990161.1|CD990161

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|71770189|gb|DR968126.1|DR968126

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|113702981|gb|EE680485.1|EE680485

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|4886094|gb|AI677214.1|AI677214

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAATTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|211507269|gb|FL197053.1|FL197053

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGNCTCAA-GAGCCAAGTCCATGAAGGT
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGG-CTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAG-T

EST: gi|5439322|gb|AI820243.1|AI820243

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAATTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|211516715|gb|FL197112.1|FL197112

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|15053894|gb|BI359439.1|BI359439

EST:     GCTATGGCGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGT
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGT

EST: gi|28568922|gb|CB280797.1|CB280797

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCCAGGGTTGTGAG                         GTCCTTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCCTGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|110523710|gb|EE027894.1|EE027894

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|148991020|gb|EE032461.2|EE032461

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCACAGAG
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAG

EST: gi|74241306|gb|DT649220.1|DT649220

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|21626375|gb|BQ621296.1|BQ621296

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCATGGCTCATAGAGCCAAGTCCATGAAATTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|211369553|gb|FL196974.1|FL196974

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAATTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|29576817|gb|CB616929.1|CB616929

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|76280736|gb|DV020304.1|DV020304

EST:     GCTATGGTGTTTTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|211129665|gb|FL448923.1|FL448923

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|15053893|gb|BI359438.1|BI359438

EST:     GCTATGGCGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|211377531|gb|FL197007.1|FL197007

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAATTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|211286416|gb|FL307757.1|FL307757

EST:     TGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: TGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|211372204|gb|FL196985.1|FL196985

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|29947264|gb|CB816565.1|CB816565

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|94480031|gb|EB708989.1|EB708989

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|6918465|gb|AW399995.1|AW399995

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|110195743|gb|EC877640.1|EC877640

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|29946514|gb|CB816187.1|CB816187

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|211507268|gb|FL197052.1|FL197052

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAATTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|149109486|gb|EE190225.2|EE190225

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGCCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|91871102|gb|EB401244.1|EB401244

EST:     GCTATGGTGTTTTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|211374868|gb|FL197000.1|FL197000

EST:     GCTATGGKGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGKGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCA
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCA

EST: gi|67020703|gb|CO449452.1|CO449452

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|74233864|gb|DT641778.1|DT641778

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|22545535|gb|BU097894.1|BU097894

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAATTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|37397371|gb|CF635983.1|CF635983

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|30031573|gb|CB833424.1|CB833424

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|31664617|gb|CD573550.1|CD573550

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|37397796|gb|CF636206.1|CF636206

EST:     GGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|211289717|gb|FL361719.1|FL361719

EST:     TGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAG-CAAGTCCATGAAGTTC
genomic: TGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|71439153|gb|DR820203.1|DR820203

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|211504914|gb|FL197044.1|FL197044

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGC-AAGTCCATGAAGT
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGT

EST: gi|110532862|gb|EE037042.1|EE037042

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|111193194|gb|EE291330.1|EE291330

EST:     GTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|60356933|gb|DN223906.1|DN223906

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|211512000|gb|FL197080.1|FL197080

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGT
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGT

EST: gi|211372194|gb|FL196975.1|FL196975

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|67013922|gb|CO442671.1|CO442671

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|149069758|gb|EE158144.2|EE158144

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|84351642|gb|DW246047.1|DW246047

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAAGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCA
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCA

EST: gi|211509642|gb|FL197077.1|FL197077

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAATTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|29129878|gb|CB380582.1|CB380582

EST:     TCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTCCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: TCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|89251839|gb|DY623625.1|DY623625

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|211372206|gb|FL196987.1|FL196987

EST:     CTATGGTGTTCTTCGCTTTNGT-ATGGAGAGTGGTGC-AAGGGGTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCC
genomic: CTATGGTGTTCTTCGCTTT-GTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCC

EST: gi|9952937|gb|BE639520.1|BE639520

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAA
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAA

EST: gi|6127310|gb|AW129835.1|AW129835

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|88752356|gb|DY536497.1|DY536497

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|78026439|gb|DV494826.1|DV494826

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAATTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|76280737|gb|DV020305.1|DV020305

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|149105751|gb|EE291331.2|EE291331

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|60347205|gb|DN214178.1|DN214178

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|18654852|gb|BM499657.1|BM499657

EST:     GCTATGGGGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|5398800|gb|AI812144.1|AI812144

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAATTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|71304430|gb|DR788335.1|DR788335

EST:     GCTATGGTGTTTTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|211031757|gb|FL369434.1|FL369434

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|148981803|gb|EE027895.2|EE027895

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|148961778|gb|EE012555.2|EE012555

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|22546268|gb|BU098579.1|BU098579

EST:     CTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAATT
genomic: CTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGA-GTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAA-GCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTT

EST: gi|149044418|gb|EE047536.2|EE047536

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|74233592|gb|DT641506.1|DT641506

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|28930830|gb|CB334191.1|CB334191

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|22546706|gb|BU099017.1|BU099017

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAATTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|29130998|gb|CB381702.1|CB381702

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCCAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|89248143|gb|DY619929.1|DY619929

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

EST: gi|211502555|gb|FL197027.1|FL197027

EST:     GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGTCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC
genomic: GCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTC

RNA-Seq data

ATGC Supported by RNA-Seq exonic block that spans over the splice site

atgs Truncated intron sequence

Each block is as long as the maximal overhang of any read spanning the junction.
The score is the number of alignments spanning the junction.

Found data for 4 RNA-Seq libraries.

Block sizes: 49 (upstream exon), 49 (downstream exon)
Score: 1042

GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTCAAGGATGGCTACATGATCTCATCTGGTCAGCCAGTGAATGAGTACATCG

Block sizes: 49 (upstream exon), 49 (downstream exon)
Score: 970

GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTCAAGGATGGCTACATGATCTCATCTGGTCAGCCAGTGAATGAGTACATCG

Block sizes: 49 (upstream exon), 49 (downstream exon)
Score: 1027

GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTCAAGGATGGCTACATGATCTCATCTGGTCAGCCAGTGAATGAGTACATCG

Block sizes: 49 (upstream exon), 49 (downstream exon)
Score: 538

GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctc ... tctaatacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTCAAGGATGGCTACATGATCTCATCTGGTCAGCCAGTGAATGAGTACATCG

Putative cis-regulatory sequences

atgc	intron	ATGC	exonic elements by Pertea et al.
ATGC	exon	atgc	putative intronic elements
		ATGC	putative exonic elements identified for retained introns

        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
GGCCTGCTATGGTGTTCTTCGCTTTGTTATGGAGAGTGGTGCCAAGGGTTGTGAGgttagtgctcctgtgcactatgagggtctgttcattttctgatgattggtgaatgcatgtcgacagccttatttgttctaatacag

- - - - - - - - - - - - - -  TGGAGA

Data associated with selected splice site

Sequence

Basic information

Orthologous splice sites

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments

RNA-Seq data

Putative cis-regulatory sequences