Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

ATTCATTGCTGGAGTTGCTGATGATAATGGCTATGGATGGGCAATTGCGAAGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgatcagactcttacagatttctttgcattgaacacttttgctgatcgattgtcttatgtagtattcttctttgacag

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G070422_T03
intron # 3
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GRMZM2G070422_T03 (Zea mays), 5'ss of exon 3
lower sequence: LOC_Os08g23810.2 (Oryza sativa), 5'ss of exon 3
ATTCATTGCTGGAGTTGCTGATGATAATGGCTATGGATGGGCAATTGCGAAGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgatcagactcttacagatttctttg-----cattgaacacttt--tgctgatcgattgtcttatgtagtattcttctttgacag
 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||  |||||| |||  |||  |      ||||      |||  |  |  ||  |    | ||| ||  |||| | |  ||||
GTTCATTGCTGGAGTTGCTGATGACAATGGCTATGGCTGGGCAATTGCAAAGGCTCTTGCTGCTGCTGGTGCTGAAATTCTTGTTGGTACATGGGTGCCTgtaagtggatccaactcttgcagtgttcaatagggatcatttttttttttcctctttgtcattcacttaatggagagttctacctgcacag

upper sequence: GRMZM2G070422_T03 (Zea mays), 5'ss of exon 3
lower sequence: GLYMA18G31780.1 (Glycine max), 5'ss of exon 2
ATTCATTGCTGGAGTTGCTGATGATAATGGCTATGGATGGGCAATTGCGAAGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat----cagactct--tacag-atttctttgcattgaacacttttgct---gatcgattgtct-tatgtagtattcttctttga-cag---------------------------
 ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||  | || || || || || |||||||||||||| || |||||||| || ||| ||  ||    | || |||  |  ||  | | | | |||||   |||||| |     |  ||| |  | | |||   ||       ||  |||                           
TTTCATTGCTGGTGTGGCTGATGACAATGGATATGGCTGGGCAATAGCAAAATCTCTCGCAGCAGCAGGAGCTGAAATTCTTGTCGGCACATGGGTACCTgtaagtaaatattactgattctggtgtagtgtgtttgtacattgtttacttttaccctgaaatgatggcatctctgtgaaatatacaagtggtcaggtactaactttgaacattttcatgcag

upper sequence: GRMZM2G070422_T03 (Zea mays), 5'ss of exon 3
lower sequence: GLYMA08G45990.1 (Glycine max), 5'ss of exon 3
ATTCATTGCTGGAGTTGCTGATGATAATGGCTATGGATGGGCAATTGCGAAGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat----cagactct--tacag-atttctttgcattgaacacttttgct----gatcg-attgtct-tatgtagtattcttctttgacag---------------------------
 ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||  | ||||| || || || |||||||||||||| || |||||||| || ||| ||  ||    | || |||  |  ||  | | |   |||||   |||||| |      |||   || ||| | |||| ||| |   |  | |||                           
TTTCATTGCTGGTGTGGCTGATGACAATGGATATGGCTGGGCAATAGCAAAATCTCTTGCAGCAGCAGGAGCTGAAATTCTTGTCGGCACATGGGTACCTgtaagtaaatatcactgattctggtgtagtgtgtttgcacattgtttacttttaccctgaaatcatgttatctctgtgtaatatacaagtg-gtcaggttctaacttcgaacattttcatgcag

upper sequence: GRMZM2G070422_T03 (Zea mays), 5'ss of exon 3
lower sequence: GLYMA11G10770.1 (Glycine max), 5'ss of exon 3
ATTCATTGCTGGAGTTGCTGATGATAATGGCTATGGATGGGCAATTGCGAAGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgatcagactcttacagatttctttgcattgaacactttt--gctgatcgattgtcttatgtagtattcttctttgacag--------------------------------------------------------------------------------------
 || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  | |||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| || ||| ||| ||  |  | ||   |||        | ||   || | |  | ||||  |     | | |  ||  | |    ||||                                                                                        
TTTTATTGCTGGTGTTGCTGATGACAATGGATATGGATGGGCAATTGCAAAATCTCTTGCTGCAGCCGGAGCTGAAATTCTTGTTGGCACATGGGTACCTgtaagtt-atttgtttattttggataa----aaaatgggtacctatcagttgatatacaaattcacgaggttctgtctgctgacttttggaacaacacctcccccctccagtgcatatgttttccagtccttttacggtgatacatttactaactgtgaactatttctatag

upper sequence: GRMZM2G070422_T03 (Zea mays), 5'ss of exon 3
lower sequence: GLYMA12G03060.1 (Glycine max), 5'ss of exon 4
ATTCATTGCTGGAGTTGCTGATGATAATGGCTATGGATGGGCAATTGCGAAGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgatcagactcttacagatttctttgcattgaacactttt--gctgatcgattgtcttatgtagtattcttctttgacag----------------------------------------------------------------------------------------
 || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| || || ||||| || ||||| || |||||||| || ||| ||| ||  |  | ||   |||        | ||   |  | |  | ||||  |     | | |  ||  | |    ||||                                                                                          
TTTTATTGCTGGTGTTGCTGATGACAATGGATATGGATGGGCAATTGCAAAAGCTCTTGCTGCAGCAGGAGCTGAGATCCTTGTTGGCACATGGGTACCTgtaagtt-atttgtttattttggataa----aaaatgggtatctatcagttgatatacgaattcacgaggttctgtctgctgacttttggaacaacacctcccccctccagtgcatatgttttttccagtccttttgtgctgatacatttactaactgtgaaccatttctatag

upper sequence: GRMZM2G070422_T03 (Zea mays), 5'ss of exon 3
lower sequence: AT2G05990.2 (Arabidopsis thaliana), 5'ss of exon 3
ATTCATTGCTGGAGTTGCTGATGATAATGGCTATGGATGGGCAATTGCGAAGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgt------tgatcagactcttacagatttctttgcattgaacacttttgctgatcgattgtcttatgtagtattcttctttgacag
 |||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||| || || ||  | |||||||| ||||| ||||||||  | || || || ||||| || ||| ||      || |    ||  |     |||| || |||||   | || | || | | ||      |||   || |            
TTTCATTGCTGGTATAGCTGATGATAATGGCTATGGTTGGGCCATAGCAAAATCTCTTGCTGCTGCTGGAGCTGAAATATTGGTTGGGACTTGGGTTCCTgtaagtcatttttggttcagctgcttttagtttcctt-cattgctaaattatactaacctatgaatggatggtctactag----------

upper sequence: GRMZM2G070422_T03 (Zea mays), 5'ss of exon 3
lower sequence: Vv08s0007g06390.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 3
ATTCATTGCTGGAGTTGCTGATGATAATGGCTATGGATGGGCAATTGCGAAGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgatcagactcttacagatttctttgcattg--aacacttttgctgatcgattgtcttatgta-gtattcttctttgacag--------------------------------------------
||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||  | |||||||| || || |||||||||||| | || ||||||||||| ||||||  || |   ||| ||   |||  |||  |||   | |   |   | ||   || |   |   | || || ||| |||  |                                             
ATTTATTGCGGGTGTAGCTGATGATAATGGATATGGTTGGGCAATAGCAAAATCGCTTGCTGCTGCAGGAGCTGAAATTCTTATTGGCACATGGGTGCCTgtatgtaaatta--ttctaacttctttaattgacttgtggatagactgattcatgagttctggcaacaatgttttgttccttgtaaaatattttattttttaatgataataataattttttattttcatag

upper sequence: GRMZM2G070422_T03 (Zea mays), 5'ss of exon 3
lower sequence: Vv06s0004g01310.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 3
ATTCATTGCTGGAGTTGCTGATGATAATGGCTATGGATGGGCAATTGCGAAGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgatcag-actcttacagat--ttctttgcattgaacact---tttgctgatcgattgtcttatgtagtattcttctttgacag-------------
 || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||  | ||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||| ||  || |    ||  | | ||  |||| ||| || | |||    |   |||| | ||         | | |||  |   ||  |              
CTTTATTGCTGGTGTTGCTGATGACAATGGATATGGTTGGGCAATAGCCAAATCTCTTGCAGCTGCAGGTGCTGAAATTCTTGTTGGCACATGGGTTCCTgtaagtaaattaatgatcacatatatcattctctgctttaatcacagagtaatctgagccatgtcaaaccattggattactaactgggaagctccttgtgtag

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|211044396|gb|FL359389.1|FL359389
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGA
EST: gi|211502525|gb|FL308724.1|FL308724
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211308112|gb|FL334851.1|FL334851
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211283609|gb|FL349544.1|FL349544
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|32914780|gb|CF019592.1|CF019592
EST:     GGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACCATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: GGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTA-CATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211286546|gb|FL312257.1|FL312257
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211288948|gb|FL325917.1|FL325917
EST:     GGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: GG-CACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|67017641|gb|CO446390.1|CO446390
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211304659|gb|FL364485.1|FL364485
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGG
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGG
EST: gi|211253629|gb|FL364837.1|FL364837
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211327096|gb|FL352863.1|FL352863
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211415134|gb|FL353852.1|FL353852
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211258322|gb|FL357420.1|FL357420
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211412582|gb|FL353838.1|FL353838
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211399086|gb|FL329174.1|FL329174
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211427383|gb|FL331466.1|FL331466
EST:     GGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATC
genomic: GGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCC-Ggtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATC
EST: gi|211510288|gb|FL344841.1|FL344841
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211007421|gb|FL345275.1|FL345275
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211434682|gb|FL309148.1|FL309148
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGC-G                         GCACTTAACATATTT
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTT
EST: gi|211135434|gb|FL356365.1|FL356365
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211103788|gb|FL340549.1|FL340549
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAG
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAG
EST: gi|32914607|gb|CF019419.1|CF019419
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211305791|gb|FL318627.1|FL318627
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211064079|gb|FL320238.1|FL320238
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211393336|gb|FL308676.1|FL308676
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|31356384|gb|CD440741.1|CD440741
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211382814|gb|FL308633.1|FL308633
EST:     -GGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCC                         GCACTTTACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCC
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATC-
EST: gi|211529231|gb|FL353934.1|FL353934
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|6526869|gb|AW216132.1|AW216132
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211164083|gb|FL357846.1|FL357846
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211468358|gb|FL359310.1|FL359310
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211480969|gb|FL350629.1|FL350629
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211154091|gb|FL335987.1|FL335987
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATA
EST: gi|211295243|gb|FL321244.1|FL321244
EST:     GGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGNTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGGCGTGGAAAAGTTTGATGAAT
genomic: GGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGG-TACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGG-CGTGGAAA-GTTTGATGAAT
EST: gi|211385699|gb|FL320886.1|FL320886
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTTGATGAATC
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTT-GATGAATC
EST: gi|211298034|gb|FL348700.1|FL348700
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211324425|gb|FL327329.1|FL327329
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTT
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTT
EST: gi|211129502|gb|FL314437.1|FL314437
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCG
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTT-AACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCG
EST: gi|31361470|gb|CD445827.1|CD445827
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|6022101|gb|AW067029.1|AW067029
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211486128|gb|FL325707.1|FL325707
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211507944|gb|FL346101.1|FL346101
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|6021144|gb|AW066072.1|AW066072
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|67018992|gb|CO447741.1|CO447741
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211072240|gb|FL315242.1|FL315242
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211117366|gb|FL349405.1|FL349405
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTTGATGAATC
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTT-GATGAATC
EST: gi|211088687|gb|FL328958.1|FL328958
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211080738|gb|FL326806.1|FL326806
EST:     AGGCACTTGCTGCNGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCC                         GCACTTAACATATTTGAGAACA-GTCTGAAGCGTGAAAAGTTTGATGAATC
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGA-CAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATC
EST: gi|24774154|gb|CA409408.1|CA409408
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|67019739|gb|CO448488.1|CO448488
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211391003|gb|FL321745.1|FL321745
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|6636971|gb|AW261243.1|AW261243
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211101339|gb|FL340997.1|FL340997
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGANCA-GTCTGAGGGCGTG-AAAGTTTGATGAAA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGA-CAAGTCTGAGG-CGTGGAAAGTTTGATGAA-
EST: gi|211433427|gb|FL362817.1|FL362817
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211508160|gb|FL357204.1|FL357204
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGCGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|7162427|gb|AW520049.1|AW520049
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|29576949|gb|CB617061.1|CB617061
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|84980240|gb|DW530589.1|DW530589
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|71766309|gb|DR964246.1|DR964246
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|31354494|gb|CD438851.1|CD438851
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|24774062|gb|CA409316.1|CA409316
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211385451|gb|FL308647.1|FL308647
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211477146|gb|FL315192.1|FL315192
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGC
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGC
EST: gi|28910331|gb|CB331385.1|CB331385
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211267880|gb|FL003945.1|FL003945
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211289669|gb|FL360449.1|FL360449
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211154562|gb|FL361241.1|FL361241
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211468357|gb|FL359309.1|FL359309
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211337385|gb|FL322965.1|FL322965
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTT
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTT
EST: gi|211385522|gb|FL311833.1|FL311833
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211269735|gb|FL319996.1|FL319996
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|31353471|gb|CD437828.1|CD437828
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211274498|gb|FL347705.1|FL347705
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211115017|gb|FL350288.1|FL350288
EST:     GGCACTTGCTGCGGCCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATAT
genomic: GGCACTTGCTGCGGC-TGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATAT
EST: gi|211264853|gb|FL319961.1|FL319961
EST:     GGCACTTGNCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: GGCACTTG-CTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211474665|gb|FL315664.1|FL315664
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|24774150|gb|CA409404.1|CA409404
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|32914888|gb|CF019700.1|CF019700
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211265428|gb|FL346823.1|FL346823
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|78023662|gb|DV492049.1|DV492049
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211430723|gb|FL358038.1|FL358038
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211393346|gb|FL308686.1|FL308686
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211457493|gb|FL333166.1|FL333166
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211447013|gb|FL349619.1|FL349619
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211366821|gb|FL308171.1|FL308171
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTT
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTT
EST: gi|211167061|gb|FL336578.1|FL336578
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211298039|gb|FL348705.1|FL348705
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
EST: gi|211318796|gb|FL360998.1|FL360998
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTC
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTC
EST: gi|211255771|gb|FL352255.1|FL352255
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAA
EST: gi|211525761|gb|FL336364.1|FL336364
EST:     AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCG                         GCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA
genomic: AGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgat ... tctttgacagGCACTTAACATATTTGAGACAAGTCTGAGGCGTGGAAAGTTTGATGAATCA

Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
ATTCATTGCTGGAGTTGCTGATGATAATGGCTATGGATGGGCAATTGCGAAGGCACTTGCTGCGGCTGGTGCTGAAATTCTTGTGGGTACATGGGTGCCGgtatgttgatcagactcttacagatttctttgcattgaacacttttgctgatcgattgtcttatgtagtattcttctttgacag

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  TGCTGC