1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
GTTTGTGTGTATGATATGGATTGGTCTCAACCAACAGCTATTGTTGTGGGCAATGAGCTTAGgtatgagctgttccttgtatatgtatcttttgttgaatttacattacatttagaaatacttaaaatgaagcactcagttactaggttgtgctttccattg...
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G026869_T01 |
intron # | 3 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: GATATGGATTGGTCTCAACCAACAGCTATTGTTGTGGGCAATGAGCTTAG GGGTATAAGTGATGATGCTCTAGAATTGTCAGATTTGCACTGCAGCATTCCEST: gi|78118115|gb|DV536502.1|DV536502
genomic: GATATGGATTGGTCTCAACCAACAGCTATTGTTGTGGGCAATGAGCTTAGgtatgagctg ... ttggtggcagGGGTATAAGTGATGATGCTCTAGAATTGTCAGATTTGCACTGCAGCATTCC
EST: GATATGGATTGGTCTCAACCAACAGCTATTGTTGTGGGCAATGAGCTTAG GGGTATAAGTGATGATGCTCTAGAATTGTCAGATTTGCACTGCAGCATTCCEST: gi|71764970|gb|DR962907.1|DR962907
genomic: GATATGGATTGGTCTCAACCAACAGCTATTGTTGTGGGCAATGAGCTTAGgtatgagctg ... ttggtggcagGGGTATAAGTGATGATGCTCTAGAATTGTCAGATTTGCACTGCAGCATTCC
EST: GATATGGATGGGTCTCAACCAACAGCTATTGTTGTGGGCAATGAGCTTAG GGGTATAAGTGATGATGCTCTAGAATTGTCAGATTTGCACTGCAGCATTCC
genomic: GATATGGATTGGTCTCAACCAACAGCTATTGTTGTGGGCAATGAGCTTAGgtatgagctg ... ttggtggcagGGGTATAAGTGATGATGCTCTAGAATTGTCAGATTTGCACTGCAGCATTCC
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GTTTGTGTGTATGATATGGATTGGTCTCAACCAACAGCTATTGTTGTGGGCAATGAGCTTAGgtatgagctgttccttgtatatgtatcttttgttgaatttacattacatttagaaatacttaaaatgaagcactcagttactaggttgtgctttccattg
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGCTT