1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
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species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G005737_T02 |
intron # | 3 |
splice site | 5' |
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EST: ATGTTGCAGGTCTATCACCGCCAAGCTATTCAGCTGGAGTGCAGTCTGAG GGACTGGATGACCTTTCACATTCCCATAAGEST: gi|211144985|gb|FK968678.1|FK968678
genomic: ATGTTGCAGGTCTATCACCGCCAAGCTATTCAGCTGGAGTGCAGTCTGAGgtagctttat ... cttgtggcagGGACTGGATGACCTTTCACATTCCCATAAG
EST: ATGTTGCAGGTCTATCACCGCCAAGCTATTCAGCTGGAGTGCAGTCTGAG GGACTGGATGACCTTTCACATTCCCATAAGTTTGCCGTTGGTACTAGAGTTEST: gi|211371098|gb|FL037570.1|FL037570
genomic: ATGTTGCAGGTCTATCACCGCCAAGCTATTCAGCTGGAGTGCAGTCTGAGgtagctttat ... cttgtggcagGGACTGGATGACCTTTCACATTCCCATAAGTTTGCCGTTGGTACTAGAGTT
EST: ATGTTGCAGGTCTATCACCGCCAAGCTATTCAGCTGGAGTGCAGTCTGAG GGACTGGATGACCTTTCACATTCCCATAAGTTTGCCGTTGGTACTAGAGTT
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atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GTTAACCGAAGAGATTTTGGCAACTGCAAAGCAAACTGAGAGTGCCCAGAATGTTGCAGGTCTATCACCGCCAAGCTATTCAGCTGGAGTGCAGTCTGAGgtagctttattcttcattttttgttagatggcttccttccttagctgaaattctgaataagggagaagtacatgccaattgttccattgataaaagggattgtcctgatgaattacaatttatgttgcttatactgagatataatggcttgtgttcctactctactctgacagtcttgtggcag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CAAGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TCAGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CAGCTG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGGA