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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTTCCAGATGAGGAAAAAAACCTTGGTCCCTTTGATCGATTGATTCATGTATATCATTTTACAAAAGATACTCAAAACCAAACGgtaatgatggaaacttggctaatgttcatctgaatgtcgcagtcttgtcattatttttaacgtgtatataaaaaaacagctgaagttctagaatataatg...

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G018508_T03
intron # 25
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GRMZM2G018508_T03 (Zea mays), 5'ss of exon 25
lower sequence: LOC_Os07g06950.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 29
GTTCCAGATGAGGAAAAAAACCTTGGTCCCTTTGATCGATTGATTCATGTATATCATTTTACAAAAGATACTCAAAACCAAACGgtaatgatggaaacttggctaatg-ttcatctgaatgtcgcagtcttgtcattattttta---acgtgtatataaaaaaacagctgaagttctagaatataatg-
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GTTCCGGAGGAAGAGAAAAATCTTGGTCCTTTTGATCGCTTGATTCATGTATACCATTTTACCAAAGACACTCAAAATCAGACGgtaatgg----aattctgctaataatttatctacatatatagcttaaatggataactgcatatgcactgctacaaaattttagcc-actttgttgcctgtaattt