1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
GGAAAGACATCTTCGTGCGCATGCTTTGTGGTGGCAAGCATCCGAGCAGGGTAATGAGCATGCTGCATTGTTGATTGGCGATGCCTACTACTATGGTCGGgtatgcactacagtcatctgaatttttaaaatacataaaattggttagggccgcttgtgctagttttgaatctgtatacactcctttcggactacatttt...
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G372398_T03 |
intron # | 2 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: GTAATGAGCATGCTGCATTGTTGATTGGCGATGCCTACTACTATGGTCGG GGCGTAGCAAGGGACTATGAACGTGCAGCAGAGGCATATATGCATGCTCGGEST: gi|211224649|gb|FL333451.1|FL333451
genomic: GTAATGAGCATGCTGCATTGTTGATTGGCGATGCCTACTACTATGGTCGGgtatgcacta ... tctgttatagGGCGTAGCAAGGGACTATGAACGTGCAGCAGAGGCATATATGCATGCTCGG
EST: GTAATGAGCATGCTGCATTGTTGATTGGCGATGCCTACTACTATGGTCGG GGCGTAGCAAGGGACTATGAACGTGCAGCAGAGGCATATATGCATGCTCGGEST: gi|76291540|gb|DV031108.1|DV031108
genomic: GTAATGAGCATGCTGCATTGTTGATTGGCGATGCCTACTACTATGGTCGGgtatgcacta ... tctgttatagGGCGTAGCAAGGGACTATGAACGTGCAGCAGAGGCATATATGCATGCTCGG
EST: GTAATGAGCATGCTGCATTGTTGATTGGCGATGCCTACTACTATGGTCGG GGCGTAGCAAGGGACTATGAACGTGCAGCAGAGGCATATATGCATGCTCGGEST: gi|211345453|gb|FL473816.1|FL473816
genomic: GTAATGAGCATGCTGCATTGTTGATTGGCGATGCCTACTACTATGGTCGGgtatgcacta ... tctgttatagGGCGTAGCAAGGGACTATGAACGTGCAGCAGAGGCATATATGCATGCTCGG
EST: GTAATGAGCATGCTGCATGGTTGATTGCCGATGCTTACTACTATGGTCGG GGCGTAGCAAGGGACTATGAACGTGCAGCAGAGGCATATATGCATGCTCGGEST: gi|211541444|gb|FL362038.1|FL362038
genomic: GTAATGAGCATGCTGCATTGTTGATTGGCGATGCCTACTACTATGGTCGGgtatgcacta ... tctgttatagGGCGTAGCAAGGGACTATGAACGTGCAGCAGAGGCATATATGCATGCTCGG
EST: GTAATGAGCATGCTGCATTGTTGATTGGCGATGCCTACTACTATGGTCGG GGCGTAGCAAGGGACTATGAACGTGCAGCAGAGGCATATATGCATGCTCGG
genomic: GTAATGAGCATGCTGCATTGTTGATTGGCGATGCCTACTACTATGGTCGGgtatgcacta ... tctgttatagGGCGTAGCAAGGGACTATGAACGTGCAGCAGAGGCATATATGCATGCTCGG
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GGAAAGACATCTTCGTGCGCATGCTTTGTGGTGGCAAGCATCCGAGCAGGGTAATGAGCATGCTGCATTGTTGATTGGCGATGCCTACTACTATGGTCGGgtatgcactacagtcatctgaatttttaaaatacataaaattggttagggccgcttgtgctagttttgaatctgtatacactcctttcggactacatttt
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - ATGCTG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGCTGC