1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
CTGACCGCGGTCGGTTCACTGAGATGAAGCGGTCAGTTGTGGACAAGAATCTGGGTCCCTTGGTTAAGACAGTGATGACTCGTTGCATCCAATGTACAAGgtgatgcttttttgcttgttgataaaagtctattgttcttgtttcaggtaatttttcaggcctatcctgtttatatatgtgtattctgcagggtcattct...
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G145854_T01 |
intron # | 2 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: CTGGGTCCCTTGGTTAAGACAGTGATGACTCGTTGCATCCAATGTACAAG ATGTGTCAGGTTTGCTACTGAGGTTGCTGGTGTTCAAGACCTTGGTATGTTEST: gi|149083007|gb|EE172249.2|EE172249
genomic: CTGGGTCCCTTGGTTAAGACAGTGATGACTCGTTGCATCCAATGTACAAGgtgatgcttt ... taaattgcagATGTGTCAGGTTTGCTACTGAGGTTGCTGGTGTTCAAGACCTTGGTATGTT
EST: CTGGGTCCCTTGGTTAAGACAGTGATGACTCGTTGCATCCAATGTACAAG ATGTGTCAGGTTTGCTACTGAGGTTGCTGGTGTTCAAGACCTTGGTATGTTEST: gi|148940315|gb|EC885101.2|EC885101
genomic: CTGGGTCCCTTGGTTAAGACAGTGATGACTCGTTGCATCCAATGTACAAGgtgatgcttt ... taaattgcagATGTGTCAGGTTTGCTACTGAGGTTGCTGGTGTTCAAGACCTTGGTATGTT
EST: CTGGGTCCCTTGGTTAAGACAGTGATGACTCGTTGCATCCAATGTACAAG ATGTGTCAGGTTTGCTACTGAGGTTGCTGGTGTTCAAGACCTTGGTATGTTEST: gi|149085246|gb|EE174753.2|EE174753
genomic: CTGGGTCCCTTGGTTAAGACAGTGATGACTCGTTGCATCCAATGTACAAGgtgatgcttt ... taaattgcagATGTGTCAGGTTTGCTACTGAGGTTGCTGGTGTTCAAGACCTTGGTATGTT
EST: CTGGGTCCCTTGGTTAAGACAGTGATGACTCGTTGCATCCAATGTACAAG ATGTGTCAGGTTTGCTACTGAGGTTGCTGGTGTTCAAGACCTTGGTATGTT
genomic: CTGGGTCCCTTGGTTAAGACAGTGATGACTCGTTGCATCCAATGTACAAGgtgatgcttt ... taaattgcagATGTGTCAGGTTTGCTACTGAGGTTGCTGGTGTTCAAGACCTTGGTATGTT
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| CTGACCGCGGTCGGTTCACTGAGATGAAGCGGTCAGTTGTGGACAAGAATCTGGGTCCCTTGGTTAAGACAGTGATGACTCGTTGCATCCAATGTACAAGgtgatgcttttttgcttgttgataaaagtctattgttcttgtttcaggtaatttttcaggcctatcctgtttatatatgtgtattctgcagggtcattct
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - gataaaag