Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GAATGGCACCTGAGGGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCTgtaagtaatatgaacctttctttttaaatttttttacctacttgtgtttatcatctttgacttgagagccaagtgatacctaataacctttacttctatatgtttatgtaatacag

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G116034_T01
intron # 2
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GRMZM2G116034_T01 (Zea mays), 5'ss of exon 2
lower sequence: LOC_Os06g48750.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 2
---------GAATGGCACCTGAGGGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCTgtaagtaatatgaacctttctttttaaatttttttacctacttgtgtttatcatctttgacttgagagccaagtgatacctaataacctttactt-ctatatgtttatgtaatacag
         |||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| | |  ||      ||   || | | | | |    ||| || |  |  || ||      | |  |  |    |  | |     ||| ||   |  |  | |||| |||
TCATGGCGGGAATGGCACCAGAGGGATCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGATTCTAAAATGCAGGAGCTTCTgtaaggaatcttatactgatacgtt---ttatctcagccatcattgtgta-cggcaatgtct----gtctatttcctgtacaggatctaccgcttactgggtagtcttttaatgcag
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|19437234|gb|BM953644.1|BM953644
EST:     GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCT                         GAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCTgtaagtaata ... tgtaatacagGAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|19351508|gb|BM896040.1|BM896040
EST:     GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCT                         GAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCTgtaagtaata ... tgtaatacagGAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|149057504|gb|EE156642.2|EE156642
EST:     GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCT                         GAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCTgtaagtaata ... tgtaatacagGAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|211317180|gb|FL039359.1|FL039359
EST:     TAAGATGCAGGAGCTGCT                         GAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: TAAGATGCAGGAGCTGCTgtaagtaata ... tgtaatacagGAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|211292598|gb|FL286205.1|FL286205
EST:     GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCT                         GAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCTgtaagtaata ... tgtaatacagGAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|87151961|gb|DY396750.1|DY396750
EST:     GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCT                         GAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCTgtaagtaata ... tgtaatacagGAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|211294745|gb|FL286225.1|FL286225
EST:     GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCT                         GAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCTgtaagtaata ... tgtaatacagGAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|148931048|gb|EC873642.2|EC873642
EST:     GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCT                         GAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCTgtaagtaata ... tgtaatacagGAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|211319193|gb|FL039360.1|FL039360
EST:     GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCT                         GAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCTgtaagtaata ... tgtaatacagGAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|5555520|gb|AI881471.1|AI881471
EST:     GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCT                         GAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCTgtaagtaata ... tgtaatacagGAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|149086608|gb|EE176151.2|EE176151
EST:     GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCT                         GAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCTgtaagtaata ... tgtaatacagGAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|211074058|gb|FL286105.1|FL286105
EST:     TTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCT                         GAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: TTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCTgtaagtaata ... tgtaatacagGAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|148944140|gb|EC889228.2|EC889228
EST:     GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCT                         GAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCTgtaagtaata ... tgtaatacagGAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|148978929|gb|EE026387.2|EE026387
EST:     GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCT                         GAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCTgtaagtaata ... tgtaatacagGAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|211085019|gb|FL286163.1|FL286163
EST:     GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCT                         GAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCTgtaagtaata ... tgtaatacagGAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|31558561|gb|CD527773.1|CD527773
EST:     GG-TCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCT                         GAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCTgtaagtaata ... tgtaatacagGAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|78114933|gb|DV533321.1|DV533321
EST:     GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCT                         GAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCTgtaagtaata ... tgtaatacagGAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|149071683|gb|EE160076.2|EE160076
EST:     GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCT                         GAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCTgtaagtaata ... tgtaatacagGAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|149112482|gb|EE295354.2|EE295354
EST:     GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCT                         GAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCTgtaagtaata ... tgtaatacagGAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|31349869|gb|CD434226.1|CD434226
EST:     GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCT                         GAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCTgtaagtaata ... tgtaatacagGAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|31363551|gb|CD447908.1|CD447908
EST:     GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCT                         GAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCTgtaagtaata ... tgtaatacagGAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|211071319|gb|FL286089.1|FL286089
EST:     GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCT                         GAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCTgtaagtaata ... tgtaatacagGAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|211076799|gb|FL286117.1|FL286117
EST:     GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCT                         GAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCTgtaagtaata ... tgtaatacagGAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|31360434|gb|CD444791.1|CD444791
EST:     GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCT                         GAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCTgtaagtaata ... tgtaatacagGAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|149109326|gb|EE190140.2|EE190140
EST:     GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCT                         GAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCTgtaagtaata ... tgtaatacagGAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|13382120|gb|BG458795.1|BG458795
EST:     GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCT                         GAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCTgtaagtaata ... tgtaatacagGAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|211292606|gb|FL286213.1|FL286213
EST:     GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCT                         GAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCTgtaagtaata ... tgtaatacagGAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|13125989|gb|BG316664.1|BG316664
EST:     GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCT                         GAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCTgtaagtaata ... tgtaatacagGAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|211290463|gb|FL286196.1|FL286196
EST:     GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCT                         GAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCTgtaagtaata ... tgtaatacagGAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|211288324|gb|FL286184.1|FL286184
EST:     GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCT                         GAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCTgtaagtaata ... tgtaatacagGAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|211085017|gb|FL286161.1|FL286161
EST:     GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCT                         GAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCTgtaagtaata ... tgtaatacagGAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|149075721|gb|EE164266.2|EE164266
EST:     GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCT                         GAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCTgtaagtaata ... tgtaatacagGAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|211082283|gb|FL286152.1|FL286152
EST:     GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCT                         GAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCTgtaagtaata ... tgtaatacagGAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|6636979|gb|AW261251.1|AW261251
EST:     GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCT                         GAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGATGTTTTTGA
genomic: GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCTgtaagtaata ... tgtaatacagGAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|71768076|gb|DR966013.1|DR966013
EST:     GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCT                         GAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCTgtaagtaata ... tgtaatacagGAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|148953344|gb|EE152835.2|EE152835
EST:     GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCT                         GAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCTgtaagtaata ... tgtaatacagGAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|211288327|gb|FL286187.1|FL286187
EST:     GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCT                         GAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCTgtaagtaata ... tgtaatacagGAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|211076806|gb|FL286124.1|FL286124
EST:     GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCT                         GAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCTgtaagtaata ... tgtaatacagGAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|149023519|gb|EE045864.2|EE045864
EST:     GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCT                         GAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCTgtaagtaata ... tgtaatacagGAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|29947480|gb|CB816678.1|CB816678
EST:     GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCT                         GAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCTgtaagtaata ... tgtaatacagGAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|149097051|gb|EE182858.2|EE182858
EST:     GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCT                         GAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCTgtaagtaata ... tgtaatacagGAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|211319197|gb|FL039364.1|FL039364
EST:     GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCT                         GAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCTgtaagtaata ... tgtaatacagGAGCACCGGTGAGACTGAGGAGTTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA

Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
GAATGGCACCTGAGGGTTCTCAGTTCGATGCTAAGCACTATGATTCTAAGATGCAGGAGCTGCTgtaagtaatatgaacctttctttttaaatttttttacctacttgtgtttatcatctttgacttgagagccaagtgatacctaataacctttacttctatatgtttatgtaatacag

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  AAGATG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  GGAGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  AGCTGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGCT