1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
GTTTTAGCAGGTTTTCAGAATCCAACGGCCGGTACAGTGTATATAAACAGACCATGCAGCTATGTCTTCCAAAATCCTGATCACCAGgtggtaaaacttctctttctttaatagttctctaactggtctgttgtcaggtctcacaatagattttaagtggaatctgtagtatactagtatgccaaca...
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G111511_T04 |
intron # | 2 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: GTATATAAACAGACCATGCAGCTATGTCTTCCAAAATCCTGATCACCAG GTTGTGATGCCTACAGTGGGATCTGATGTAGCATTTGGTCTCGGTAAGCTCEST: gi|17931952|gb|BM268912.1|BM268912
genomic: GTATATAAACAGACCATGCAGCTATGTCTTCCAAAATCCTGATCACCAGgtggtaaaac ... ttggatgcagGTTGTGATGCCTACAGTGGGATCTGATGTAGCATTTGGTCTCGGTAAGCTC
EST: TGTATATAAACAGACCATGCAGCTATGTCTTCCAAAATCCTGATCACCAG GTTGTGATGCCTACAGTGGGATCTGATGTAGCATTTGGTCTCGGTAAGCTCEST: gi|14242904|gb|BG840234.2|BG840234
genomic: TGTATATAAACAGACCATGCAGCTATGTCTTCCAAAATCCTGATCACCAGgtggtaaaac ... ttggatgcagGTTGTGATGCCTACAGTGGGATCTGATGTAGCATTTGGTCTCGGTAAGCTC
EST: TGTATATAAACAGACCATGCAGCTATGTCTTCCAAAATCCTGATCACCAG GTTGTGATGCCTACAGTGGGATCTGATGTAGCATTTGGTCTCGGTAAGCTCEST: gi|14243054|gb|BG840773.2|BG840773
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atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GTTTTAGCAGGTTTTCAGAATCCAACGGCCGGTACAGTGTATATAAACAGACCATGCAGCTATGTCTTCCAAAATCCTGATCACCAGgtggtaaaacttctctttctttaatagttctctaactggtctgttgtcaggtctcacaatagattttaagtggaatctgtagtatactagtatgccaaca
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCAGCT