Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggcactcttcattttttcaataaaagttatacatgaacactcccataacccctctgctacatttttatctatgtactaagttatttcttgtttgcag

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G105019_T01
intron # 2
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GRMZM2G105019_T01 (Zea mays), 5'ss of exon 2
lower sequence: GLYMA09G23980.1 (Glycine max), 5'ss of exon 2
AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggcac-tcttcattttttcaataaaagttatacatgaacactcccataacccctc-tgctacatttttatctatgtactaa-gttatttcttgtttgcag
|||||||||| ||||||||||||||||||||  |  |||||    | |  ||||| || |  |||||||||| |||  ||| ||  | | |  |         |||  ||| |  |     || ||   ||    |   ||||| ||||| ||  || | ||  | |   |     
AGGCTGTGGCTGATGCTAACAAAGCAATTGAATTGAATCCTTCTCTACCAAAAGCATATTTGCGGAAAGGgtaagtaccacatcaccttgtcctttccctttcttaatcat-actataattatcactattcactttgagtttttttctatatataaatggtagatatgaat-----
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|211027354|gb|FL173897.1|FL173897
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGC
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGC
EST: gi|211398161|gb|FL173842.1|FL173842
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|67041846|gb|CO468101.1|CO468101
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211024886|gb|FL173871.1|FL173871
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211398170|gb|FL173851.1|FL173851
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211392922|gb|FL173824.1|FL173824
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|67031272|gb|CO460021.1|CO460021
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211395543|gb|FL173833.1|FL173833
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|149074736|gb|EE163165.2|EE163165
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211024887|gb|FL173872.1|FL173872
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211024897|gb|FL173882.1|FL173882
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|31358963|gb|CD443320.1|CD443320
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211024899|gb|FL173884.1|FL173884
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211392916|gb|FL173818.1|FL173818
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211032266|gb|FL173919.1|FL173919
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211398165|gb|FL173846.1|FL173846
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211024893|gb|FL173878.1|FL173878
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|5901292|gb|AW042392.1|AW042392
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211029796|gb|FL173908.1|FL173908
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211032269|gb|FL173922.1|FL173922
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211398163|gb|FL173844.1|FL173844
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|149000611|gb|EE037809.2|EE037809
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211027347|gb|FL173890.1|FL173890
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|32804177|gb|CD956413.1|CD956413
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTA
EST: gi|211395539|gb|FL173829.1|FL173829
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGACTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|6021590|gb|AW066518.1|AW066518
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211027355|gb|FL173898.1|FL173898
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|60354886|gb|DN221859.1|DN221859
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|148952074|gb|EC897865.2|EC897865
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211024894|gb|FL173879.1|FL173879
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211024889|gb|FL173874.1|FL173874
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211392914|gb|FL173816.1|FL173816
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|149095998|gb|EE181667.2|EE181667
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211029802|gb|FL173914.1|FL173914
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211029791|gb|FL173903.1|FL173903
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211398168|gb|FL173849.1|FL173849
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211024885|gb|FL173870.1|FL173870
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATAC-AAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211029800|gb|FL173912.1|FL173912
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211398173|gb|FL173854.1|FL173854
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211029788|gb|FL173900.1|FL173900
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211022433|gb|FL173858.1|FL173858
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211395544|gb|FL173834.1|FL173834
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGMTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|15554147|gb|BI644145.1|BI644145
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|32826612|gb|CD966290.1|CD966290
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTA
EST: gi|211392919|gb|FL173821.1|FL173821
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|22819579|gb|BU499669.1|BU499669
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211392918|gb|FL173820.1|FL173820
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211032268|gb|FL173921.1|FL173921
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211395546|gb|FL173836.1|FL173836
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211395535|gb|FL173825.1|FL173825
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATMCCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211029790|gb|FL173902.1|FL173902
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211032265|gb|FL173918.1|FL173918
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTG
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTT-GAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTG
EST: gi|211392917|gb|FL173819.1|FL173819
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211029798|gb|FL173910.1|FL173910
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211024891|gb|FL173876.1|FL173876
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211027346|gb|FL173889.1|FL173889
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211029793|gb|FL173905.1|FL173905
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|149014157|gb|EE043702.2|EE043702
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211395540|gb|FL173830.1|FL173830
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211398167|gb|FL173848.1|FL173848
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211024896|gb|FL173881.1|FL173881
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAASTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211395545|gb|FL173835.1|FL173835
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211029801|gb|FL173913.1|FL173913
EST:     AAGCAATTTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAGCAATT-GAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211024895|gb|FL173880.1|FL173880
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211027352|gb|FL173895.1|FL173895
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACTGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211022443|gb|FL173868.1|FL173868
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211395536|gb|FL173826.1|FL173826
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTT
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTT
EST: gi|211029799|gb|FL173911.1|FL173911
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211032264|gb|FL173917.1|FL173917
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211398160|gb|FL173841.1|FL173841
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211022440|gb|FL173865.1|FL173865
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAKG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|32824337|gb|CD964059.1|CD964059
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGTATTA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTA
EST: gi|211024892|gb|FL173877.1|FL173877
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211395549|gb|FL173839.1|FL173839
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211392915|gb|FL173817.1|FL173817
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAVG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211027351|gb|FL173894.1|FL173894
EST:     AAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATMCCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTG
genomic: AAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAA-GGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTG
EST: gi|211392921|gb|FL173823.1|FL173823
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211024898|gb|FL173883.1|FL173883
EST:     AAAGCAATT-AGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211032267|gb|FL173920.1|FL173920
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211027345|gb|FL173888.1|FL173888
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211027349|gb|FL173892.1|FL173892
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|71429578|gb|DR810628.1|DR810628
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211398171|gb|FL173852.1|FL173852
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211027344|gb|FL173887.1|FL173887
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211398172|gb|FL173853.1|FL173853
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211395538|gb|FL173828.1|FL173828
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|148995931|gb|EE035174.2|EE035174
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211398169|gb|FL173850.1|FL173850
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211022434|gb|FL173859.1|FL173859
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211029792|gb|FL173904.1|FL173904
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCA
EST: gi|211029789|gb|FL173901.1|FL173901
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|5932648|gb|AW057009.1|AW057009
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211398166|gb|FL173847.1|FL173847
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211398159|gb|FL173840.1|FL173840
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211024890|gb|FL173875.1|FL173875
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGSATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|86467579|gb|DY233949.1|DY233949
EST:     AAAGCATTTGATCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAAAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|32827004|gb|CD966682.1|CD966682
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTA
EST: gi|211029795|gb|FL173907.1|FL173907
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGC
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGC
EST: gi|211027350|gb|FL173893.1|FL173893
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211022436|gb|FL173861.1|FL173861
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         GGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211027353|gb|FL173896.1|FL173896
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211395542|gb|FL173832.1|FL173832
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|32803959|gb|CD956195.1|CD956195
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTA
EST: gi|148936646|gb|EC880771.2|EC880771
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
EST: gi|211392920|gb|FL173822.1|FL173822
EST:     AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGG                         TGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA
genomic: AAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGA

RNA-Seq data


 ATGC   Supported by RNA-Seq exonic block that spans over the splice site

 atgs   Truncated intron sequence

Each block is as long as the maximal overhang of any read spanning the junction.
The score is the number of alignments spanning the junction.


Found data for 4 RNA-Seq libraries.


Block sizes: 49 (upstream exon), 49 (downstream exon)
Score: 810

AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGAGTTGGGTTCTTCTTATGCATCAGGCGATTCAAGGTTTGCTCGTCTATTG


Block sizes: 49 (upstream exon), 49 (downstream exon)
Score: 792

AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGAGTTGGGTTCTTCTTATGCATCAGGCGATTCAAGGTTTGCTCGTCTATTG


Block sizes: 49 (upstream exon), 49 (downstream exon)
Score: 1111

AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGAGTTGGGTTCTTCTTATGCATCAGGCGATTCAAGGTTTGCTCGTCTATTG


Block sizes: 49 (upstream exon), 49 (downstream exon)
Score: 431

AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggca ... ttgtttgcagTGCTGCATGCATTAAGCTTGAAGAATACCAAACTGCAAAGGCTGCTCTTGAGTTGGGTTCTTCTTATGCATCAGGCGATTCAAGGTTTGCTCGTCTATTG


Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
AGGCTGTGGCGGATGCTAACAAAGCAATTGAGCTTGATCCTATGATGCATAAAGCTTACTACCGGAAAGGgttagtggcactcttcattttttcaataaaagttatacatgaacactcccataacccctctgctacatttttatctatgtactaagttatttcttgtttgcag

- - - - - - - - - -  AAGCAA
- - - - - - - - - - - - - -  GAGCTT