1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
GGGCAAAGTTGCTGAAGGTATTGATTTTGATCGGCACTATGGCAGATTAGTTATCATGTTTGGTGTTCCTTTCCAGTACACATTGAGTCGgtgagttttgttcacattgagcttcaaccctctctaccccttgattttggtgccaagttataggtagtttgatgcatgtacgcagttgtaatttgtggtggcttaatgatttcataacagttgcctttgtttgtctctatacgatttgtag
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G097605_T02 |
intron # | 2 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: GGCAGATTAGTTATCATGTTTGGTGTTCCTTTCCAGTACACATTGAGTCG GATATTGCTTGCTAGGTTGGAGTACCTGCGGGAAACTTTTCAGATAAAGGAEST: gi|71429989|gb|DR811039.1|DR811039
genomic: GGCAGATTAGTTATCATGTTTGGTGTTCCTTTCCAGTACACATTGAGTCGgtgagttttg ... cgatttgtagGATATTGCTTGCTAGGTTGGAGTACCTGCGGGAAACTTTTCAGATAAAGGA
EST: GGCAGATTAGTTATCATGTTTGGTGTTCCTTTCCAGTACACATTGAGTCG GATATTGCTTGCTAGGTTGGAGTACCTGCGGGAAACTTTTCAGATAAAGGAEST: gi|86467670|gb|DY234040.1|DY234040
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EST: GGCAGATTAGTTATCATGTTTGGTGTTCCTTTCCAGTACACATTGAGTCG GATATTGCTTGCTAGGTTGGAGTACCTGCGGGAAACTTTTCAGATAAAGGAEST: gi|61118799|gb|DN559760.1|DN559760
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atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GGGCAAAGTTGCTGAAGGTATTGATTTTGATCGGCACTATGGCAGATTAGTTATCATGTTTGGTGTTCCTTTCCAGTACACATTGAGTCGgtgagttttgttcacattgagcttcaaccctctctaccccttgattttggtgccaagttataggtagtttgatgcatgtacgcagttgtaatttgtggtggcttaatgatttcataacagttgcctttgtttgtctctatacgatttgtag
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