Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TTCCTCTGGTGGTATACGGATTCCAGCATTATATTTCCATGGTCGGTTCAATCATCCTGATTCCTCTCGTGATGGTCCCTGCTATGGGTGGCTCGGCTgtgagttctggaattgaatttgttgtatctcgtgcaccattactgatttattgggtttcttactgaatactaggttatatttggtcgtgtttgggtcag

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G095611_T01
intron # 2
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|78117552|gb|DV535939.1|DV535939
EST:     CAATCATCCTGATTCCTCTCGTGATGGTCCCTGCTATGGGTGGCTCGGCT                         GATGACATGGCGGCAGTGGTATCCACAGTGTTGCTCGTCACCGGGGTGACT
genomic: CAATCATCCTGATTCCTCTCGTGATGGTCCCTGCTATGGGTGGCTCGGCTgtgagttctg ... tttgggtcagGATGACATGGCGGCAGTGGTATCCACAGTGTTGCTCGTCACCGGGGTGACT
EST: gi|71443803|gb|DR824853.1|DR824853
EST:     CAATCATCCTGATTCCTCTCGTGATGGTCCCTGCTATGGGTGGCTCGGCT                         GATGACATGGCGGCAGTGGTATCCACAGTGTTGCTCGTCACCGGGGTGACT
genomic: CAATCATCCTGATTCCTCTCGTGATGGTCCCTGCTATGGGTGGCTCGGCTgtgagttctg ... tttgggtcagGATGACATGGCGGCAGTGGTATCCACAGTGTTGCTCGTCACCGGGGTGACT
EST: gi|78090543|gb|DV518917.1|DV518917
EST:     CAATCATCCTGATTCCTCTCGTGATGGTCCCTGCTATGGGTGGCTCGGCT                         GATGACATGGCGGCAGTGGTATCCACAGTGTTGCTCGTCACCGGGGTGACT
genomic: CAATCATCCTGATTCCTCTCGTGATGGTCCCTGCTATGGGTGGCTCGGCTgtgagttctg ... tttgggtcagGATGACATGGCGGCAGTGGTATCCACAGTGTTGCTCGTCACCGGGGTGACT