1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
AGCTCTTCAAATGTCTGTCCAGGATGCAAACATGTCCAGTGACACTGATATGAGTAAGGTGTTTGAAGACAGAACGTTTGTGTCATCTATCCTTAATTCGgtatgtattattcttaaactaatggcatacaggtacattttagctgcagcttcaataatttattggcccttttatgtgtaaaataacag
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G078663_T03 |
intron # | 2 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TGAGTAAGGTGTTTGAAGACAGAACATTTGTGTCATCTATCCTTAATTCG CTTCCTGGTGTTGEST: gi|148932104|gb|EC875491.2|EC875491
genomic: TGAGTAAGGTGTTTGAAGACAGAACGTTTGTGTCATCTATCCTTAATTCGgtatgtatta ... aaaataacagCTTCCTGGTGTTG
EST: TGAGTAAGGTGTTTGAAGACAGAACGTTTGTGTCATCTATCCTTAATTCG CTTCCTGGTGTTGATCCCAATGATCCATCTATTAAAGATTTEST: gi|50328322|gb|CO523448.1|CO523448
genomic: TGAGTAAGGTGTTTGAAGACAGAACGTTTGTGTCATCTATCCTTAATTCGgtatgtatta ... aaaataacagCTTCCTGGTGTTGATCCCAATGATCCATCTATTAAAGATTT
EST: TGAGTAAGGTGTTTGAGGACAGAACGTTTGTGTCATCTATCCTTAATTCG CTTCCTGGTGTTGATCCCAATGATCCATCTATTAAAGATTTGCTGGCATCA
genomic: TGAGTAAGGTGTTTGAAGACAGAACGTTTGTGTCATCTATCCTTAATTCGgtatgtatta ... aaaataacagCTTCCTGGTGTTGATCCCAATGATCCATCTATTAAAGATTTGCTGGCATCA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| AGCTCTTCAAATGTCTGTCCAGGATGCAAACATGTCCAGTGACACTGATATGAGTAAGGTGTTTGAAGACAGAACGTTTGTGTCATCTATCCTTAATTCGgtatgtattattcttaaactaatggcatacaggtacattttagctgcagcttcaataatttattggcccttttatgtgtaaaataacag
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