Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagtaataaatactttcgagaattgttatgattcaacccattgtttatggagcatcccatatgaacttgaaacctctatctcag

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G062425_T03
intron # 2
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GRMZM2G062425_T04 (Zea mays), 5'ss of exon 2
lower sequence: LOC_Os03g21830.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 2
GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagtaataaatactttcgagaattgttatgattcaacccattgtttatggagcatcccatatgaacttgaaacctctatctcag
|||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||| |        |  ||||   |||      ||| ||| | | |||     || ||  ||| ||||  ||||| |||     ||   ||
GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGCTAGGAGGTGGAGGTGTAGATGGAGgtgattgaatgcagctactagtgag-----ctatcatttatctcatcaccgattgactatctcatacaaacttaaaattctcattgtag
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|211488224|gb|FL180862.1|FL180862
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211499768|gb|FL180921.1|FL180921
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211493987|gb|FL180886.1|FL180886
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211493991|gb|FL180890.1|FL180890
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211009284|gb|FK961277.1|FK961277
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211499771|gb|FL180924.1|FL180924
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATNCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211309014|gb|FL381286.1|FL381286
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211493989|gb|FL180888.1|FL180888
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211488231|gb|FL180869.1|FL180869
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211485341|gb|FL180850.1|FL180850
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211066115|gb|FL180931.1|FL180931
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211066122|gb|FL180938.1|FL180938
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211312231|gb|FK994146.1|FK994146
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211491112|gb|FL180881.1|FL180881
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211499777|gb|FL180930.1|FL180930
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211496879|gb|FL180902.1|FL180902
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211499763|gb|FL180916.1|FL180916
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211499776|gb|FL180929.1|FL180929
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211499770|gb|FL180923.1|FL180923
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211214235|gb|FL024779.1|FL024779
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211491105|gb|FL180874.1|FL180874
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211066127|gb|FL180943.1|FL180943
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCGAAGCATGCCGGAAAGTT
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGC-AAGCATGCCGGAAAGTT
EST: gi|6031392|gb|AW076294.1|AW076294
EST:     AATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: AATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211485339|gb|FL180848.1|FL180848
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211488226|gb|FL180864.1|FL180864
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|32915279|gb|CF020091.1|CF020091
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211066121|gb|FL180937.1|FL180937
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211491103|gb|FL180872.1|FL180872
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATSTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211500169|gb|FL426487.1|FL426487
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211493997|gb|FL180896.1|FL180896
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211066116|gb|FL180932.1|FL180932
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGGAAAGTT
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGG-AAAGTT
EST: gi|211496890|gb|FL180913.1|FL180913
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211485342|gb|FL180851.1|FL180851
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211496888|gb|FL180911.1|FL180911
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211350576|gb|FL379662.1|FL379662
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211496882|gb|FL180905.1|FL180905
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211493995|gb|FL180894.1|FL180894
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211488229|gb|FL180867.1|FL180867
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211214236|gb|FL024780.1|FL024780
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|20208314|gb|BQ134403.1|BQ134403
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211493988|gb|FL180887.1|FL180887
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211207798|gb|FL424436.1|FL424436
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211494000|gb|FL180899.1|FL180899
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|9733666|gb|BE512418.1|BE512418
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211488230|gb|FL180868.1|FL180868
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211496883|gb|FL180906.1|FL180906
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211066126|gb|FL180942.1|FL180942
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211034222|gb|FL370386.1|FL370386
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211491102|gb|FL180871.1|FL180871
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211496881|gb|FL180904.1|FL180904
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|20803361|gb|BQ294411.1|BQ294411
EST:     TGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: TGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211491116|gb|FL180885.1|FL180885
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211070640|gb|FL369043.1|FL369043
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211329865|gb|FL380475.1|FL380475
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
EST: gi|211496884|gb|FL180907.1|FL180907
EST:     GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAG                         CTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC
genomic: GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagta ... tctatctcagCTATACATCAAGCTGCTGGACCAGAGCTAGTGCAAGCATGCCGGAAAGTTC

Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
GTTAATGCTGCTAATGAGCGAATGTTAGGTGGCGGAGGTGTTGATGGAGgtaacgagtaataaatactttcgagaattgttatgattcaacccattgtttatggagcatcccatatgaacttgaaacctctatctcag

- - ATGCTG
- -  TGCTGC
- - - GCTGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GATGGA