1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
TGAAGTTGCTTCAAAATATCCTGGTATTCAGTACAATGAAATGATTGTTGACAACTGCTCTATGCAACTTGTTTCAAAGCCTGAACAATTTGATGTCATGgtatgtatctaaatttctgggcatttttctgtgtatactatttaatttggaactttacttttttgttcaaacaaaccttggattacatttctctgttcta...
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G025366_T02 |
intron # | 2 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: ACAACTGCTCTATGCAACTTGTTTCAAAGCCTGAACAATTTGATGTCATG GTTACGCCTAATCTTTATGGCANTTTGGTGGCTAACACGGCTGCAEST: gi|148959186|gb|EE010640.2|EE010640
genomic: ACAACTGCTCTATGCAACTTGTTTCAAAGCCTGAACAATTTGATGTCATGgtatgtatct ... ttttttgtagGTTACGCCTAATCTTTATGGCAATTTGGTGGCTAACACGGCTGCA
EST: ACAACTGCTCTATGCAACTTGTTTCAAAGCCTGAACAATTTGATGTCATG GTTACGCCTAATCTTTATGGCAATTTGGGGGCTAACACGGCTGCAGGTATTEST: gi|148959185|gb|EC905302.2|EC905302
genomic: ACAACTGCTCTATGCAACTTGTTTCAAAGCCTGAACAATTTGATGTCATGgtatgtatct ... ttttttgtagGTTACGCCTAATCTTTATGGCAATTTGGTGGCTAACACGGCTGCAGGTATT
EST: ACAACTGCTCTATGCAACTTGTTTCAAAGCCTGAACAATTTGATGTCATG GTTACGCCTAATCTTTAEST: gi|5901228|gb|AW042328.1|AW042328
genomic: ACAACTGCTCTATGCAACTTGTTTCAAAGCCTGAACAATTTGATGTCATGgtatgtatct ... ttttttgtagGTTACGCCTAATCTTTA
EST: AACTGCTCTATGCAACTTGTTTCAAAGGCCTGAACAATTTGATGGTCATG GTTACGCCTAATCTTTATGGCAATTTGEST: gi|76285692|gb|DV025260.1|DV025260
genomic: AACTGCTCTATGCAACTTGTTTCAAAG-CCTGAACAATTTGATG-TCATGgtatgtatct ... ttttttgtagGTTACGCCTAATCTTTATGGCAATTTG
EST: ACAACTGCTCTATGCAACTTGTTTCAAAGCCTGAACAATTTGATGTCATG GTTACGCCTAATCTTTATGGCAATTTGGTGGCTAACACGGCTGCAGGTATTEST: gi|149089013|gb|EE178164.2|EE178164
genomic: ACAACTGCTCTATGCAACTTGTTTCAAAGCCTGAACAATTTGATGTCATGgtatgtatct ... ttttttgtagGTTACGCCTAATCTTTATGGCAATTTGGTGGCTAACACGGCTGCAGGTATT
EST: NCA-CTGCTCTATGCAACTTGTTTCAAAGCCTGAACAATTTGATGTCATG GTTACGCCTAATCTTTATGGCCATTTTGGTGGCTAACACGGCTGCAGGTAT
genomic: -CAACTGCTCTATGCAACTTGTTTCAAAGCCTGAACAATTTGATGTCATGgtatgtatct ... ttttttgtagGTTACGCCTAATCTTTATGGCAATTT-GGTGGCTAACACGGCTGCAGGTAT
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| TGAAGTTGCTTCAAAATATCCTGGTATTCAGTACAATGAAATGATTGTTGACAACTGCTCTATGCAACTTGTTTCAAAGCCTGAACAATTTGATGTCATGgtatgtatctaaatttctgggcatttttctgtgtatactatttaatttggaactttacttttttgttcaaacaaaccttggattacatttctctgttcta
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -caaacaaa