1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
CTCTACGAGGATGATATGTGCTTGTGCATCCTGGATGCTAAACCTCTAACAAGCGGgtaagggtttaatgctcttctcacttgtcagctctatcattacttcagttcttggtgtgcttaatttcgttaagttactcgagtttgtcacccacgatta...
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G022283_T01 |
intron # | 2 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: GAGGATGATATGTGCTTGTGCATCCTGGATGCTAAACCTCTAACAAGCGG GCATTCCCTTATCATTCCAAAAAGTCAEST: gi|211398809|gb|FK976970.1|FK976970
genomic: GAGGATGATATGTGCTTGTGCATCCTGGATGCTAAACCTCTAACAAGCGGgtaagggttt ... tcctctgtagGCATTCCCTTATCATTCCAAAAAGTCA
EST: GAGGATGATATGTGCTTGTGCATCCTGGATGCTAAACCTCTAACAAGCGG GCATTCCCTTATCATTCCAAAAAGTCATTATCCATCAGTGCAEST: gi|211398812|gb|FK976973.1|FK976973
genomic: GAGGATGATATGTGCTTGTGCATCCTGGATGCTAAACCTCTAACAAGCGGgtaagggttt ... tcctctgtagGCATTCCCTTATCATTCCAAAAAGTCATTATCCATCAGTGCA
EST: GAGGATGATATGTGCTTGTGCATCCTGGATGCTAAACCTCTAACAAGCGG GCATTCCCTTATCATTCCEST: gi|91053381|gb|EB163799.1|EB163799
genomic: GAGGATGATATGTGCTTGTGCATCCTGGATGCTAAACCTCTAACAAGCGGgtaagggttt ... tcctctgtagGCATTCCCTTATCATTCC
EST: GAGGATGATATGTGCTTGTGCACCCTGGATGCTAAACCTCTAACAAGCGG GCATTCCCTTATCATTCCCAAAAGACATTATCCATCAGTG
genomic: GAGGATGATATGTGCTTGTGCATCCTGGATGCTAAACCTCTAACAAGCGGgtaagggttt ... tcctctgtagGCATTCCCTTATCATTCCAAAAAGTCATTATCCATCAGTG
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| CTCTACGAGGATGATATGTGCTTGTGCATCCTGGATGCTAAACCTCTAACAAGCGGgtaagggtttaatgctcttctcacttgtcagctctatcattacttcagttcttggtgtgcttaatttcgttaagttactcgagtttgtcacccacgatta
- - - GAGGAT
- - - AGGATG