Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   		16  
 5'  3'   		17  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GGACAACCTTGGAGGAGATAAGCTTGTCACTGTTGAAGATATTGTCCGTCAGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAGgtacttccttttttttgacatgccccttgcatatatgtaccacctgtttaagatatcattctaaatgcacaagtttttttttttgtgaag

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G109383_T01
intron # 14
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GRMZM2G109383_T02 (Zea mays), 5'ss of exon 14
lower sequence: LOC_Os03g50480.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 14
GGACAACCTTGGAGGAGATAAGCTTGTCACTGTTGAAGATATTGTCCGTCAGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAGgtacttccttt---tttttgacatgccccttgcatatatgtaccacctgtttaagatatcattctaaatgcacaagtttttttttttgtgaag
||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||        | ||  |  | |   ||   | ||||||  |    |||  |  | ||| ||||     | | ||||||| ||  |||||
GGACAACCTTGGAGGCGATAAGCTTGTTACTGTTGAAGATATTGTTCGCCAGCACTGGGGTACTTATGGTCGCCATTATTATACACGATATGACTATGAGgtactttacacaaatattcaatgtacat-ttatgtgtatgtat-atacattt--ggcaacatgctaaccatgcca-tttttttcttcctgaag

upper sequence: GRMZM2G109383_T02 (Zea mays), 5'ss of exon 14
lower sequence: GLYMA05G34790.1 (Glycine max), 5'ss of exon 14
---GGACAACCTTGGAGGAGATAAGCTTGTCACTGTTGAAGATATTGTCCGTCAGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAGgtacttccttttttttgacatgccccttgcatatatgtaccacctgtttaagatatcattctaaatgcacaagtttttttttttgtgaag
    || || |||| ||   | |||||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || || || ||||||||||| |||  |  |    |   |  | | |||    | |   ||  |   ||||   | |||| | ||    |   | |||||||||   | |||
TAAAGATAAACTTGAAG---ACAAGCTTGTCACTGTTGAAGACATAGTTCGCCAGCATTGGGCTACTTATGGGCGCCATTATTATACTCGATATGACTATGAAgta--tgatacaatcgcattttctcctactttgt---tataattggttttgaaaatcagt-tagtgacctcaatttttttttccttaaag

upper sequence: GRMZM2G109383_T02 (Zea mays), 5'ss of exon 14
lower sequence: GLYMA03G05150.1 (Glycine max), 5'ss of exon 8
---GGACAACCTTGGAGGAGATAAGCTTGTCACTGTTGAAGATATTGTCCGTCAGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAGgtacttccttttttttgacatgccccttgcatatatgtaccacctgtttaagatatcattctaaatgcacaagtttttttttttgtgaag
    || || |||| ||   | |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||| |||||||| || |  |  ||||||||||| |||       |    | ||||   |||   |  |   ||  | ||||||     |||| | |||   |   | ||||||||  | | |||
TAAAGATAAACTTGAAG---ACAAGCTTGTCACTGTTGAAGACATAGTTCGTCAGCATTGGGCTACTTATGGGCGCCATTATTATAATCAATATGACTATGAAgtatga----tacaatcacattttcctcctactttgttataatctgttttgagaatcagt-taatcacctcaattttttttcct-taaag

upper sequence: GRMZM2G109383_T02 (Zea mays), 5'ss of exon 14
lower sequence: GLYMA08G04890.1 (Glycine max), 5'ss of exon 14
---GGACAACCTTGGAGGAGATAAGCTTGTCACTGTTGAAGATATTGTCCGTCAGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAGgtacttccttttttttgacatgccccttgcatatatgtaccacctgtttaagatatcattctaaatgcacaagtttttttttttgtgaag
    || || |||| ||   | |||||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || || || ||||||||||| |||       |    | ||||    ||   |  |   ||  | ||||||     |||| |       | ||| |||||||  ||      
TAAAGATAAACTTGAAG---ACAAGCTTGTCACTGTTGAAGACATAGTTCGCCAGCATTGGGCTACTTATGGGCGCCATTATTATACTCGATATGACTATGAAgtatga----tacaatcacat-tttctcctactttgttataatctgttttgagaatcagttagtgacctcaattttttttccttaaag--

upper sequence: GRMZM2G109383_T02 (Zea mays), 5'ss of exon 14
lower sequence: AT1G70730.1 (Arabidopsis thaliana), 5'ss of exon 14
GGACAACCTTGGAGGAGAT---AAGCTTGTCACTGTTGAAGATATTGTCCGTCAGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAGgtacttccttttttttgacatgccccttgcatatatgtaccacctgtttaagatatcattctaaatgcacaagttttt----ttttttgtgaag
    | |||||  ||  ||   || || || || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || || || ||||| || || ||||||||||||   |          | ||| |  |      | |  || |  |||  || |    |||     ||  ||| || |     |||  |    ||
---AACCCTTGATGGGAATGCAAAACTGGTGACGGTTGAAGACATTGTCCGCCAGCACTGGGCTACATATGGCCGTCACTATTACACTCGATACGACTATGAGgtaaaactgac------aaatgtcattattggttgtagacaatatgtagaataaccaattacctttgaccaatttctaaatatttgctccatag

upper sequence: GRMZM2G109383_T02 (Zea mays), 5'ss of exon 14
lower sequence: EFJ05270 (Selaginella moellendorffii), 5'ss of exon 13
GGACAACCTTGGAGGAGATAAGCTTGTCACTGTTGAAGATATTGTCCGTCAGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAGgtacttccttttttttgacatgccccttgcatatatgtaccacctgtttaagatatcattctaaatgcacaagtttttttttttgtgaag
|||    |  |  || |  |||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| |||| |||||| || |||||||| ||||||          | | | | |           |   | |   || | |    | |  ||||   ||| ||                   
GGATGTTCCGGCTGGCGGCAAGCTTGTAACTGTGGAGGATATCGTCCGCCAACACTGGGCCACTTACGGTCGTCATTTCTACACCCGATATGACTACGAGgtaaga-------tgtaagacgtttggcatgacttaatgctttctctcttcctttttgttctgcctgc-cag------------------

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|31363628|gb|CD447985.1|CD447985
EST:     AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAG                         AAATGT-GATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCCTAGTA-GCA
genomic: AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAGgtacttcctt ... ttttgtgaagAA-TGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACC-TAGTAAGCA
EST: gi|211190027|gb|FL186117.1|FL186117
EST:     AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAG                         AATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
genomic: AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAGgtacttcctt ... ttttgtgaagAATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
EST: gi|29130007|gb|CB380711.1|CB380711
EST:     CACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAG                         AATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
genomic: CACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAGgtacttcctt ... ttttgtgaagAATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
EST: gi|7216825|gb|AW562947.1|AW562947
EST:     AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAG                         AATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
genomic: AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAGgtacttcctt ... ttttgtgaagAATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
EST: gi|120480298|gb|EH210799.1|EH210799
EST:     AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAG                         AATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
genomic: AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAGgtacttcctt ... ttttgtgaagAATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
EST: gi|149109220|gb|EE293196.2|EE293196
EST:     AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAG                         AATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
genomic: AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAGgtacttcctt ... ttttgtgaagAATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
EST: gi|32910896|gb|CF015708.1|CF015708
EST:     AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAG                         AATGTTGATGC
genomic: AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAGgtacttcctt ... ttttgtgaagAATGTTGATGC
EST: gi|18167299|gb|BM337138.1|BM337138
EST:     AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAG                         AATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
genomic: AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAGgtacttcctt ... ttttgtgaagAATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
EST: gi|20508129|gb|BQ279907.1|BQ279907
EST:     AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAG                         AATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCGTG
genomic: AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAGgtacttcctt ... ttttgtgaagAATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
EST: gi|12970130|gb|BG266829.1|BG266829
EST:     AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAG                         AATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCGTG
genomic: AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAGgtacttcctt ... ttttgtgaagAATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
EST: gi|67025110|gb|CO453859.1|CO453859
EST:     AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAG                         AATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
genomic: AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAGgtacttcctt ... ttttgtgaagAATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
EST: gi|211541125|gb|FL006426.1|FL006426
EST:     AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAG                         AATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
genomic: AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAGgtacttcctt ... ttttgtgaagAATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
EST: gi|12046898|gb|BF729037.1|BF729037
EST:     AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAG                         AATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
genomic: AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAGgtacttcctt ... ttttgtgaagAATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
EST: gi|78180558|gb|DV551051.1|DV551051
EST:     AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAG                         AATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
genomic: AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAGgtacttcctt ... ttttgtgaagAATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
EST: gi|213170007|gb|FM188153.1|FM188153
EST:     AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAG                         AATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
genomic: AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAGgtacttcctt ... ttttgtgaagAATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
EST: gi|67024524|gb|CO453273.1|CO453273
EST:     AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAG                         AATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
genomic: AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAGgtacttcctt ... ttttgtgaagAATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
EST: gi|32838974|gb|CD978655.1|CD978655
EST:     AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAG                         AATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
genomic: AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAGgtacttcctt ... ttttgtgaagAATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
EST: gi|211341565|gb|FL066571.1|FL066571
EST:     ACGCTATGACTATGAG                         AATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
genomic: ACGCTATGACTATGAGgtacttcctt ... ttttgtgaagAATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
EST: gi|60401463|gb|DN234270.1|DN234270
EST:     CCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAG                         AATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
genomic: CCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAGgtacttcctt ... ttttgtgaagAATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
EST: gi|31354675|gb|CD439032.1|CD439032
EST:     AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAG                         AATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
genomic: AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAGgtacttcctt ... ttttgtgaagAATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
EST: gi|32909657|gb|CF014469.1|CF014469
EST:     AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAG                         AATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
genomic: AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAGgtacttcctt ... ttttgtgaagAATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
EST: gi|67022599|gb|CO451348.1|CO451348
EST:     AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAG                         AAATGT-GATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCAT
genomic: AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAGgtacttcctt ... ttttgtgaagAA-TGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCAT
EST: gi|149013082|gb|EE042781.2|EE042781
EST:     AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAG                         AATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
genomic: AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAGgtacttcctt ... ttttgtgaagAATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
EST: gi|24768906|gb|CA404035.1|CA404035
EST:     GCTATGACTATGAG                         AATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
genomic: GCTATGACTATGAGgtacttcctt ... ttttgtgaagAATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
EST: gi|19769724|gb|BQ034445.1|BQ034445
EST:     GGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAG                         AATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCGTG
genomic: GGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAGgtacttcctt ... ttttgtgaagAATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
EST: gi|67018536|gb|CO447285.1|CO447285
EST:     AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAG                         AATGTTGATGCAGGNGCTGCTAAGGAGCT-ATGGCANACCTAGTA-GCATG
genomic: AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAGgtacttcctt ... ttttgtgaagAATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
EST: gi|67014425|gb|CO443174.1|CO443174
EST:     AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAG                         AATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
genomic: AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAGgtacttcctt ... ttttgtgaagAATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
EST: gi|26456763|gb|CA828346.1|CA828346
EST:     AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAG                         AATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCGTG
genomic: AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAGgtacttcctt ... ttttgtgaagAATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
EST: gi|5296227|gb|AI782907.1|AI782907
EST:     ATTACTACACACGCTATGACTATGAG                         AATGTTGATGGCA-GGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCAT
genomic: ATTACTACACACGCTATGACTATGAGgtacttcctt ... ttttgtgaagAATGTTGAT-GCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCAT
EST: gi|31356718|gb|CD441075.1|CD441075
EST:     AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAG                         AATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
genomic: AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAGgtacttcctt ... ttttgtgaagAATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
EST: gi|148974650|gb|EE025448.2|EE025448
EST:     AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAG                         AATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG
genomic: AGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAGgtacttcctt ... ttttgtgaagAATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATG

RNA-Seq data


 ATGC   Supported by RNA-Seq exonic block that spans over the splice site

 atgs   Truncated intron sequence

Each block is as long as the maximal overhang of any read spanning the junction.
The score is the number of alignments spanning the junction.


Found data for 4 RNA-Seq libraries.


Block sizes: 49 (upstream exon), 49 (downstream exon)
Score: 210

GGACAACCTTGGAGGAGATAAGCTTGTCACTGTTGAAGATATTGTCCGTCAGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAGgtacttcctt ... ttttgtgaagAATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATGCAGTCATCACTTTCTGATGTTAACAA


Block sizes: 49 (upstream exon), 49 (downstream exon)
Score: 286

GGACAACCTTGGAGGAGATAAGCTTGTCACTGTTGAAGATATTGTCCGTCAGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAGgtacttcctt ... ttttgtgaagAATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATGCAGTCATCACTTTCTGATGTTAACAA


Block sizes: 49 (upstream exon), 49 (downstream exon)
Score: 121

GGACAACCTTGGAGGAGATAAGCTTGTCACTGTTGAAGATATTGTCCGTCAGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAGgtacttcctt ... ttttgtgaagAATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATGCAGTCATCACTTTCTGATGTTAACAA


Block sizes: 49 (upstream exon), 49 (downstream exon)
Score: 487

GGACAACCTTGGAGGAGATAAGCTTGTCACTGTTGAAGATATTGTCCGTCAGCACTGGGCCACATATGGTCGCCATTACTACACACGCTATGACTATGAGgtacttcctt ... ttttgtgaagAATGTTGATGCAGGGGCTGCTAAGGAGCTTATGGCAAACCTAGTAAGCATGCAGTCATCACTTTCTGATGTTAACAA