Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   
2  
 5'  3'   
3  
 5'  3'   
4  
 5'  3'   
5  
 5'  3'   
6  
 5'  3'   
7  
 5'  3'   
8  
 5'  3'   
9  
 5'  3'   
10  
 5'  3'   
11  
 5'  3'   
12  
 5'  3'   
13  
 5'  3'   
14  
 5'  3'   
15  
 5'  3'   
16  
 5'  3'   
17  
 5'  3'   
18  
 5'  3'   
19  
 5'  3'   
20  
 5'  3'   
21  
 5'  3'   
22  
 5'  3'   
23  
 5'  3'   
24  
 5'  3'   
25  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GGAACTGAACGACAATCTGTTGACTGGGTTCATTCCTCCTGATCTTGGAAAACTTACAGAATTGTTTGAATTgtaagtatatttattttcatattttttacatatgatgcttactagaatgctaatttagatgtttgtcaatgtcgcttgtcacttattattcacag

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G463904_T01
intron # 13
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|211045102|gb|FL385027.1|FL385027
EST:     ACTGGGTTCATTCCTCCTGATCTTGGAAAACTTACAGAATTGTTTGAATT                         GAACCTTGCAAACAACAACCTTATAGGACCTATCCCTGAGAATTTAAGTTC
genomic: ACTGGGTTCATTCCTCCTGATCTTGGAAAACTTACAGAATTGTTTGAATTgtaagtatat ... ttattcacagGAACCTTGCAAACAACAACCTTATAGGACCTATCCCTGAGAATTTAAGTTC
EST: gi|211374959|gb|FL429401.1|FL429401
EST:     ACTGGGTTCATTCCTCCTGATCTTGGAAAACTTACAGAATTGTTTGAATT                         GAACCTTGCAAACAACAACCTTATAGGACCTATCCCTGAGAATTTAAGTTC
genomic: ACTGGGTTCATTCCTCCTGATCTTGGAAAACTTACAGAATTGTTTGAATTgtaagtatat ... ttattcacagGAACCTTGCAAACAACAACCTTATAGGACCTATCCCTGAGAATTTAAGTTC
EST: gi|71447930|gb|DR828980.1|DR828980
EST:     ACTGGGTTCATTCCTCCTGATCTTGGAAAACTTACAGAATTGTTTGAATT                         GAACCTTGCAAACAACAACCTTATAGGACCTATCCCTGAGAATTTAAGTTC
genomic: ACTGGGTTCATTCCTCCTGATCTTGGAAAACTTACAGAATTGTTTGAATTgtaagtatat ... ttattcacagGAACCTTGCAAACAACAACCTTATAGGACCTATCCCTGAGAATTTAAGTTC
EST: gi|71447931|gb|DR828981.1|DR828981
EST:     ACTGGGTTCATTCCTCCTGATCTTGGAAAACTTACAGAATTGTTTGAATT                         GAACCTTGCAAACAACAACCTTATAGGACCTATCCCTGAGAATTTAAGTTC
genomic: ACTGGGTTCATTCCTCCTGATCTTGGAAAACTTACAGAATTGTTTGAATTgtaagtatat ... ttattcacagGAACCTTGCAAACAACAACCTTATAGGACCTATCCCTGAGAATTTAAGTTC
EST: gi|211131186|gb|FL407402.1|FL407402
EST:     ACTGGGTTCATTCCTCCTGATCTTGGAAAACTTACAGAATTGTTTGAATT                         GAACCTTGCAAACAACAACCTTATAGGACCTATCCCTGAGAATTTAAGTTC
genomic: ACTGGGTTCATTCCTCCTGATCTTGGAAAACTTACAGAATTGTTTGAATTgtaagtatat ... ttattcacagGAACCTTGCAAACAACAACCTTATAGGACCTATCCCTGAGAATTTAAGTTC
EST: gi|101392872|gb|EB818367.1|EB818367
EST:     ACTGGGTTCATTCCTCCTGATCTTGGAAAACTTACAGAATTGTTTGAATT                         GAACCTTGCAAACAACAACCTTATAGGACCTATCCCTGAGAATTTAAGTTC
genomic: ACTGGGTTCATTCCTCCTGATCTTGGAAAACTTACAGAATTGTTTGAATTgtaagtatat ... ttattcacagGAACCTTGCAAACAACAACCTTATAGGACCTATCCCTGAGAATTTAAGTTC