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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

CACACTGCTGGCTCACAGCGTGGTCCATGGAGCCATGGCTGGATATACTGGTTTTACCATTGGCCAAGTGAATGGTCGGCACTGCTACATCCCATTCTATgtaagtcacacccctgccggagcagggcacggaattctttttaccgcattcatcatctcagcatctgagacctacttattctgcttgaactaatgccctc...

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G443985_T02
intron # 13
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GRMZM2G443985_T04 (Zea mays), 5'ss of exon 13
lower sequence: LOC_Os06g05860.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 13
CACACTGCTGGCTCACAGCGTGGTCCATGGAGCCATGGCTGGATATACTGGTTTTACCATTGGCCAAGTGAATGGTCGGCACTGCTACATCCCATTCTATgtaagtcacac-ccctgccggagcagggcacggaattctttttaccgcattcatcatctcagcatctgagacc--tacttatt-ctgcttga--actaatgccctc--
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CACACTGTTGGCACACAGTGTGGTTCATGGAGCCATGGCTGGATACACTGGTTTCACTGTTGGCCAAGTAAATGGTCGGCATTGCTATATCCCGTTTTACgtaagtcattcgctatagggcagttaaactttctgttaatacaaaaaaaaaaaaactctgctccactgctctccatactgattactgtcttatcactaaaattttcag