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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTTTGCACTTGCATTTTATGGGAATCCAACTCGACCACAACTCATAGCCCTTGTTGCTCAAgtgagggattgtgtcctaccatgtttatttaacattttgatatcagtatatatatcctaacatgcttttcaaaatcaactctggtctattggtcaataaag

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G414496_T08
intron # 13
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GRMZM2G414496_T08 (Zea mays), 5'ss of exon 13
lower sequence: LOC_Os07g08729.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 14
GTTTGCACTTGCATTTTATGGGAATCCAACTCGACCACAACTCATAGCCCTTGTTGCTCAAgtgagggattgtgtcctaccatgtttatttaacattttgatatcagtatatatatcctaacatgcttttcaaaatcaactctggtctattggtcaataaag--
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GTTTGCACTTGCATTTTACGGGAATCCAACTCGCCCACAACTTGTAGCCCTTATTGCACAAgtgagggattctctcca--tgtctatattttgctttacgacatttgc-tgcattcagaattctagtttacaagtacaatatcagtgacctagttaaaacatat