Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

CAGAAACGTGAGAAACGTGTTTCGGTGGAACGGTGTGTTGAACTGACAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttcattctgaacactgcatcatagttgtgatgcttgaagtctaattttatttttgctgtatcatgcaatagtaaattccatgattgtttagtaa...

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G003692_T07
intron # 10
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|12968787|gb|BG265824.1|BG265824
EST:     CCATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG                         CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: gi|37376662|gb|CF624883.1|CF624883
EST:     CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG                         CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: gi|32919173|gb|CF023985.1|CF023985
EST:     CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG                         CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: gi|14244326|gb|BG842296.2|BG842296
EST:     CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG                         CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: gi|5343223|gb|AI795408.1|AI795408
EST:     CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG                         CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: gi|14208321|gb|BG842006.1|BG842006
EST:     CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG                         CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAA
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAA
EST: gi|32919094|gb|CF023906.1|CF023906
EST:     CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG                         CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: gi|113703640|gb|EE681144.1|EE681144
EST:     CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG                         CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: gi|32940746|gb|CF045565.1|CF045565
EST:     CAATTGTTGTTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG                         CCTGTGCTGACTGTTATGT
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGT
EST: gi|88757473|gb|DY541614.1|DY541614
EST:     CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG                         CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: gi|37397592|gb|CF636096.1|CF636096
EST:     CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG                         CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: gi|32909212|gb|CF014024.1|CF014024
EST:     CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG                         CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: gi|32856130|gb|CD995811.1|CD995811
EST:     CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG                         CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: gi|88757474|gb|DY541615.1|DY541615
EST:     CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG                         CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: gi|6101980|gb|AW126450.1|AW126450
EST:     CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG                         CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: gi|88753506|gb|DY537647.1|DY537647
EST:     CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG                         CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: gi|40337101|gb|CK371171.1|CK371171
EST:     CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG                         CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: gi|37390564|gb|CF632514.1|CF632514
EST:     CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG                         CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: gi|67023347|gb|CO452096.1|CO452096
EST:     CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG                         CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: gi|31362808|gb|CD447165.1|CD447165
EST:     CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG                         CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: gi|32864068|gb|CF003750.1|CF003750
EST:     CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG                         CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: gi|31363218|gb|CD447575.1|CD447575
EST:     CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG                         CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: gi|32847718|gb|CD987399.1|CD987399
EST:     CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG                         CCTGTGCTGACTGTTATGT
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGT
EST: gi|7227555|gb|AW566196.1|AW566196
EST:     GAAAGAAGCATGGATATCATATCAG                         CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
genomic: GAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: gi|6022668|gb|AW067596.1|AW067596
EST:     CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG                         CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: gi|32864069|gb|CF003751.1|CF003751
EST:     CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG                         CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: gi|71759817|gb|DR957754.1|DR957754
EST:     CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG                         CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: gi|211078663|gb|FL128724.1|FL128724
EST:     CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG                         CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: gi|78021266|gb|DV489653.1|DV489653
EST:     CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG                         CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: gi|211495955|gb|FL480154.1|FL480154
EST:     CAATTGTTGCTGCTACTCATGGATTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG                         CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: gi|22935891|gb|BU572166.1|BU572166
EST:     GGATATCATATCAG                         CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCCACAATTGGTTAT
genomic: GGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: gi|32856553|gb|CD996234.1|CD996234
EST:     GACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG                         CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
genomic: GACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: gi|6095476|gb|AW120143.1|AW120143
EST:     CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG                         CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: gi|6194694|gb|AW146798.1|AW146798
EST:     CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG                         CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: gi|5915523|gb|AW053164.1|AW053164
EST:     CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG                         CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: gi|211078661|gb|FL128722.1|FL128722
EST:     CAATTGTTGCTGCTACTCATGGATTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG                         CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: gi|93015973|gb|EB641493.1|EB641493
EST:     CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAC                         CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATCCATGCCACCAATTGGTTAT
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: gi|37387558|gb|CF630976.1|CF630976
EST:     CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG                         CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: gi|60353742|gb|DN220715.1|DN220715
EST:     CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG                         CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT

RNA-Seq data


 ATGC   Supported by RNA-Seq exonic block that spans over the splice site

 atgs   Truncated intron sequence

Each block is as long as the maximal overhang of any read spanning the junction.
The score is the number of alignments spanning the junction.


Found data for 4 RNA-Seq libraries.


Block sizes: 49 (upstream exon), 49 (downstream exon)
Score: 111

CAGAAACGTGAGAAACGTGTTTCGGTGGAACGGTGTGTTGAACTGACAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTATTGGCTAATGGACAAG


Block sizes: 49 (upstream exon), 49 (downstream exon)
Score: 319

CAGAAACGTGAGAAACGTGTTTCGGTGGAACGGTGTGTTGAACTGACAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTATTGGCTAATGGACAAG


Block sizes: 49 (upstream exon), 49 (downstream exon)
Score: 296

CAGAAACGTGAGAAACGTGTTTCGGTGGAACGGTGTGTTGAACTGACAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTATTGGCTAATGGACAAG


Block sizes: 49 (upstream exon), 49 (downstream exon)
Score: 261

CAGAAACGTGAGAAACGTGTTTCGGTGGAACGGTGTGTTGAACTGACAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTATTGGCTAATGGACAAG


Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
CAGAAACGTGAGAAACGTGTTTCGGTGGAACGGTGTGTTGAACTGACAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttcattctgaacactgcatcatagttgtgatgcttgaagtctaattttatttttgctgtatcatgcaatagtaaattccatgattgtttagtaa

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  TGCTGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  CATGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAAGAA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  AAGAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGAAGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  CATGGA