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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

AGCGCCAGGTACGCGGGTCTTTTTCGGCCGAGGTCGCTGCCGCCCCACGCCAGGTGGTCAGGTCTTCTCCGGTCCCTTCGCCGGCGACGTGCACCACCAGgtacgcccaccctttggccttcctttcctgctgtgcgaaaccgagcacccaaaccctaacttgctatctgtattcggatctgatctgattacaaacttta...

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G477146_T02
intron # 1
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|78106037|gb|DV524455.1|DV524455
EST:     CAGGTGGTCAGGTCTTCTCCGGTCCCTTCGCCGGCGACGTGCACCACCAG                         GCTGAGCTCCACAGTGGTTCTTGCAGAGGTTTCAGGTTTGTAACAGACTGC
genomic: CAGGTGGTCAGGTCTTCTCCGGTCCCTTCGCCGGCGACGTGCACCACCAGgtacgcccac ... tgttttgcagGCTGAGCTCCACAGTGGTTCTTGCAGAGGTTTCAGGTTTGTAACAGACTGC
EST: gi|76918522|gb|DV167332.1|DV167332
EST:     CAGGTGGTCAGGTCTTCTCCGGTCCCTTCGCCGGCGACGTGCACCACCAG                         GCTGAGCTCCACAGTGGTTCTTGCAGAGGTTTCAGGTTTGTAACAGACTGC
genomic: CAGGTGGTCAGGTCTTCTCCGGTCCCTTCGCCGGCGACGTGCACCACCAGgtacgcccac ... tgttttgcagGCTGAGCTCCACAGTGGTTCTTGCAGAGGTTTCAGGTTTGTAACAGACTGC
EST: gi|71332502|gb|DR803214.1|DR803214
EST:     CAGGTGGTCAGGTCTTCTCCGGTCCCTTCGCCGGCGACGTGCACCACCAG                         GCTGAGCTCCACAGTGGTTCTTGCAGAGGTTTCAGGTTTGTAACAGACTGC
genomic: CAGGTGGTCAGGTCTTCTCCGGTCCCTTCGCCGGCGACGTGCACCACCAGgtacgcccac ... tgttttgcagGCTGAGCTCCACAGTGGTTCTTGCAGAGGTTTCAGGTTTGTAACAGACTGC