1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
TCCGACGCGGCACCGGCCCCCGCGCACCGGGCCCGGATGCTATGCTGCTGAGCTGCAGGACCCTCTCCACCTGGGTGCGCCGCCTCGTCGCTTGCATGGGgtgcgtcgtgcgtgcctgcgccccgccgccctgccctcccccatcccatcctctcgtgatcctccggcacacgtcacggtgtagtagtggccgcgaggct...
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G097995_T02 |
intron # | 1 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
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EST: AGCTGCAGGACCCTCTCCACCTGGGTGCGCCGCCTCGTCGCTTGCAT--G -G--GAGGTTGCTTTGGATGCTGTGCTAAGCCAACTCCAATAATAGCAGTAEST: gi|211493339|gb|FL154424.1|FL154424
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EST: AGCTGCAGGACCCTCTCCACCTGGGTGCGCCGCCTCGTCGCTTGCATGGG AGCAGAGGTTGCTTTGGATCCTGTGCTAAGCCAACTCCAATAATAGCAGTAEST: gi|211490454|gb|FL154412.1|FL154412
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genomic: GCTGCAGGACCCTCTCCACCTGGGTGCGCCGCCTCG-TCGCTTGCATGGGgtgcgtcgtg ... tttgctacagAGCAGAGGTTGCTTTGGATGCTGTGCTAAGCCAACTCCAATAATAGCAGTA
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genomic: AGCTGCAGGACCCTCTCCACCTGGGTGCGCCGCCTCGTCGCTTGCATGGGgtgcgtcgtg ... tttgctacagAGCAGAGGTTGCTTTGGATGCTGTGCTAAGCCAACTCCAATAATAGCAGTA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| TCCGACGCGGCACCGGCCCCCGCGCACCGGGCCCGGATGCTATGCTGCTGAGCTGCAGGACCCTCTCCACCTGGGTGCGCCGCCTCGTCGCTTGCATGGGgtgcgtcgtgcgtgcctgcgccccgccgccctgccctcccccatcccatcctctcgtgatcctccggcacacgtcacggtgtagtagtggccgcgaggct
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGCTGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CTGCAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - ccccgcc
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -ccctccc
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - cctccggc