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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

CACTGCAGCCGGGATCCGGCGGCCAGCGGCAACCGGCGGGGGGCAGGCGGTCGGGACCTGGTGTCGGTCTACAGCCAGACAGCAGCAGCAGCAGCGTGACgtgagtcaggccgaacttctagttctctgcttccgtagttttgttttataaatcagattcaatttcttaaggaataggagtagcaatttgtgaatcactt...

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G038667_T02
intron # 1
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|71766569|gb|DR964506.1|DR964506
EST:     TCGGGACCTGGTGTCGGTCTACAGCCAGACAGCAGCAGCAGCAGCGTGAC                         CCTCAAAATCCTAGACCACTACCGTATGGTCCACTGCTCCTTTGCTGGTGT
genomic: TCGGGACCTGGTGTCGGTCTACAGCCAGACAGCAGCAGCAGCAGCGTGACgtgagtcagg ... taatacccagCCTCAAAATCCTAGACCACTACCGTATGGTCCACTGCTCCTTTGCTGGTGT
EST: gi|71767672|gb|DR965609.1|DR965609
EST:     TCGGGACCTGGTGTCGGTCTACAGCCAGACAGCAGCAGCAGCAGCGTGAC                         CCTCAAAATCCTAGACCACTACCGTATGGTCCACTGCTCCTTTGCTGGTGT
genomic: TCGGGACCTGGTGTCGGTCTACAGCCAGACAGCAGCAGCAGCAGCGTGACgtgagtcagg ... taatacccagCCTCAAAATCCTAGACCACTACCGTATGGTCCACTGCTCCTTTGCTGGTGT
EST: gi|149014738|gb|EE044419.2|EE044419
EST:     TCGGGACCTGGTGTCGGTCTACAGCCAGACAGCAGCAGCAGCAGCGTGAC                         CCTCAAAATCCTAGACCACTACCGTATGGTCCACTGCTCCTTTGCTGGTGT
genomic: TCGGGACCTGGTGTCGGTCTACAGCCAGACAGCAGCAGCAGCAGCGTGACgtgagtcagg ... taatacccagCCTCAAAATCCTAGACCACTACCGTATGGTCCACTGCTCCTTTGCTGGTGT
EST: gi|101393701|gb|EB818783.1|EB818783
EST:     TCGGGACCTGGTGTCGGTCTACAGCCAGACAGCAGCAGCAGCAGCGTGAC                         CCTCAAAATCCTAGACCACTACCGTATGGTCCACTGCTCCTTTGCTGGTGT
genomic: TCGGGACCTGGTGTCGGTCTACAGCCAGACAGCAGCAGCAGCAGCGTGACgtgagtcagg ... taatacccagCCTCAAAATCCTAGACCACTACCGTATGGTCCACTGCTCCTTTGCTGGTGT
EST: gi|211247273|gb|FL044130.1|FL044130
EST:     TCGGGACCTGGTGTCGGTCTACAGCCAGACAGCAGCAGCAGCAGCGTGAC                         CCTCAAAATCCTAGACCACTACCGTATGGTCCACTGCTCCTTTGCTGGTGT
genomic: TCGGGACCTGGTGTCGGTCTACAGCCAGACAGCAGCAGCAGCAGCGTGACgtgagtcagg ... taatacccagCCTCAAAATCCTAGACCACTACCGTATGGTCCACTGCTCCTTTGCTGGTGT
EST: gi|148948173|gb|EC893688.2|EC893688
EST:     TCGGGACCTGGTGTCGGTCTACAGCCAGACAGCAGCAGCAGCAGCGTGAC                         CCTCAAAATCCTAGACCACTACCGTATGGTCCACTGCTCCTTTGCTGGTGT
genomic: TCGGGACCTGGTGTCGGTCTACAGCCAGACAGCAGCAGCAGCAGCGTGACgtgagtcagg ... taatacccagCCTCAAAATCCTAGACCACTACCGTATGGTCCACTGCTCCTTTGCTGGTGT
EST: gi|149084673|gb|EE174157.2|EE174157
EST:     TCGGGACCTGGTGTCGGTCTACAGCCAGACAGCAGCAGCAGCAGCGTGAC                         CCTCAAAATCCTAGACCACTACCGTATGGTCCACTGCTCCTTTGCTGGTGT
genomic: TCGGGACCTGGTGTCGGTCTACAGCCAGACAGCAGCAGCAGCAGCGTGACgtgagtcagg ... taatacccagCCTCAAAATCCTAGACCACTACCGTATGGTCCACTGCTCCTTTGCTGGTGT
EST: gi|89252014|gb|DY623800.1|DY623800
EST:     TCGGGACCTGGTGTCGGTCTACAGCCAGACAGCAGCAGCAGCAGCGTGAC                         CCTCAAAATCCTAGACCACTACCGTATGGTCCACTGCTCCTTTGCTGGTGT
genomic: TCGGGACCTGGTGTCGGTCTACAGCCAGACAGCAGCAGCAGCAGCGTGACgtgagtcagg ... taatacccagCCTCAAAATCCTAGACCACTACCGTATGGTCCACTGCTCCTTTGCTGGTGT
EST: gi|148964028|gb|EE015172.2|EE015172
EST:     TCGGGACCTGGTGTCGGTCTACAGCCAGACAGCAGCAGCAGCAGCGTGAC                         CCTCAAAATCCTAGACCACTACCGTATGGTCCACTGCTCCTTTGCTGGTGT
genomic: TCGGGACCTGGTGTCGGTCTACAGCCAGACAGCAGCAGCAGCAGCGTGACgtgagtcagg ... taatacccagCCTCAAAATCCTAGACCACTACCGTATGGTCCACTGCTCCTTTGCTGGTGT