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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GATGATTATCTGGATTGTTTCGGTGACCCCCAAGTGATTGGTAAGgtaagtttcagggttactacactcatttggtttgtggaatgtaattgtattaatcatcaatatataaccagtttgagcaaagaatatggatcttagtgttacctttcatgctaccag

Basic information

species Vitis vinifera
transcript Vv19s0015g01010.t01
intron # 9
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|110702878|gb|EE079232.1|EE079232
EST:     GATGATTATCTGGATTGTTTCGGTGACCCCCAAGTGATTGGTAAG                         ATAGGAACGGATATTGAAGATTTTAAGTGCTCTTGGTTGGTTGTGAAAGCA
genomic: GATGATTATCTGGATTGTTTCGGTGACCCCCAAGTGATTGGTAAGgtaagtttca ... atgctaccagATCGGAACGGATATTGAAGATTTTAAGTGCTCTTGGTTGGTTGTGAAAGCA
EST: gi|110396453|gb|EC962139.1|EC962139
EST:     GATGATTATCTGGATTGTTTCGGTTACCCCCAAGTGATTGGTAAG                         ATCGGAACGGATATTGAAGATTTTAAGTGCTCTTGGTTGGTTGTGAAAGCA
genomic: GATGATTATCTGGATTGTTTCGGTGACCCCCAAGTGATTGGTAAGgtaagtttca ... atgctaccagATCGGAACGGATATTGAAGATTTTAAGTGCTCTTGGTTGGTTGTGAAAGCA
EST: gi|22013972|gb|BQ799006.1|BQ799006
EST:     GATGATTATCTGGATTGTTTCGGTGACCCCCAAGTGATTGGTAAG                         ATCGGAACGGATATTGAAGATTTTAAGTGCTCTTGGTTGGTTGTGAAAACA
genomic: GATGATTATCTGGATTGTTTCGGTGACCCCCAAGTGATTGGTAAGgtaagtttca ... atgctaccagATCGGAACGGATATTGAAGATTTTAAGTGCTCTTGGTTGGTTGTGAAAGCA
EST: gi|110698392|gb|EE075834.1|EE075834
EST:     GATGATTATCTGGGATTGTTTCGGTGACCCCCAAGTGATTGGTAAG                         ATAGGAACGGATATTGAAGATTTTAAGTGCTTCTGGGT-GGTTGTGAA-GC
genomic: GATGATTATCTGG-ATTGTTTCGGTGACCCCCAAGTGATTGGTAAGgtaagtttca ... atgctaccagATCGGAACGGATATTGAAGATTTTAAGTGCT-CTTGGTTGGTTGTGAAAGC
EST: gi|110375001|gb|EC939952.1|EC939952
EST:     GATGATTATCTGGATTGTTTCGGTGACCCCCAAGTGATTGGTAAG                         ATCGGAACGGATATTGAAGATTTTAAGTGCTCTTGGTTGGTTGTGAAAACA
genomic: GATGATTATCTGGATTGTTTCGGTGACCCCCAAGTGATTGGTAAGgtaagtttca ... atgctaccagATCGGAACGGATATTGAAGATTTTAAGTGCTCTTGGTTGGTTGTGAAAGCA
EST: gi|30128757|gb|CB914096.1|CB914096
EST:     GATGATTATCTGGATTGTTTCGGTGACCCCCAAGTGATTGGTAAG                         ATCGGAACGGATATTGAAGATTTTAAGTGCTCTTGGTTGGTTGTGAAAGCA
genomic: GATGATTATCTGGATTGTTTCGGTGACCCCCAAGTGATTGGTAAGgtaagtttca ... atgctaccagATCGGAACGGATATTGAAGATTTTAAGTGCTCTTGGTTGGTTGTGAAAGCA
EST: gi|110687343|gb|EE064671.1|EE064671
EST:     GATGATTATCTGGATTGTTTCGGTGACCCCCAAGTGATTGGTAAG                         ATCGGAACGGATATTGAA
genomic: GATGATTATCTGGATTGTTTCGGTGACCCCCAAGTGATTGGTAAGgtaagtttca ... atgctaccagATCGGAACGGATATTGAA