1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' |
ATATTTATAGGGTTGGGCCTTGTGATATCTGgtaagttgcaatttagtatgcatgattcgcatgcacatgcacggacaagtagagatgaaaacttaggaaggctgcttggtaaaagcttaggaatatacct...
species | Vitis vinifera |
transcript | Vv05s0020g02660.t01 |
intron # | 8 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: ATATTTATAGGGTTGGGCCTTGTGATATCTG TGATTCTAATGGTTTGTGTTACTAAAGTTGCCAAGGCTGCTTTGGAAAAAGEST: gi|34546576|gb|CF514808.1|CF514808
genomic: ATATTTATAGGGTTGGGCCTTGTGATATCTGgtaagttgca ... ttgtttgcagTGATTCTAATGGTTTGTGTTACTAAAGTTGCCAAGGCTGCTTTGGAAAAAG
EST: ATATTTATAGGGTTGGGCCTTGTGATATCTG TGATTCTAATGGTTTGTGTTACTAAAGTTGCCAAGGCTGCTTTGGAAAAAG
genomic: ATATTTATAGGGTTGGGCCTTGTGATATCTGgtaagttgca ... ttgtttgcagTGATTCTAATGGTTTGTGTTACTAAAGTTGCCAAGGCTGCTTTGGAAAAAG
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| ATATTTATAGGGTTGGGCCTTGTGATATCTGgtaagttgcaatttagtatgcatgattcgcatgcacatgcacggacaagtagagatgaaaacttaggaaggctgcttggtaaaagcttaggaatatacct
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - ggacaag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - atgaaaa
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -ggtaaaa
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - aggaata