Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

CTACCTAATGTATGGGAGGATGAACTCCACAATGTTGTTCAAATGGGCTTTAGTACTGGTGCTCCCCTCAACAGCCAAGATTTAAATGgtataactagttggttttcacgtgtaaacaactgctatgaaaaattccatgttcgcttgagctaacaatgaagttgttatgcatttgcag

Basic information

species Vitis vinifera
transcript Vv01s0010g00740.t01
intron # 8
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: Vv01s0010g00740.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 8
lower sequence: GLYMA01G09400.1 (Glycine max), 5'ss of exon 8
CTACCTAATGTATGGGAGGATGAACTCCACAATGTTGTTCAAATGGGCTTTAGTACTGGTGCTCCCCTCAACAGCCAAGATTTAAATGgtataactagttggttttcacgtgtaaacaactgctatgaaaaattccatgttcgcttgagctaacaatgaagttgttatgcatttgcag
|| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||   ||   ||||||||| |  |||||||||||  |||||||         |  ||| |    ||| |||  || |    ||    | | |  ||  | | || ||         |||||   || ||
CTGCCTGATGTATGGGAGGATGAACTTCACAATGTTGTACAGATGAGCTTTGCAACAACTGCTCCCCTTACTAGCCAAGATTTTGATGgtat---------gcattccccaacaaataaccccttttggtaaagttacgatttctcaatcaaataacctttgctatatgctcctgtag