1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' |
CTTATAATAAAGCTCTTGAGGATGCTATTGCGGTGCTTGACAAGATTGCAGCCCCTGTTGATGTGAATGACCgtaagcttttacaatatttcccttcttattttatgcacttctttttatttgagttaaaatttctctttgtagtgtttatttacctgggtaattagaaata...
species | Vitis vinifera |
transcript | Vv17s0000g08170.t01 |
intron # | 7 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TGCTATTGCGGTGCTTGACAAGATTGCAGCCCCTGTTGATGTGAATGACC GTGTTGCAATGTTGGGAATGGTGAAGAGTTGTATAGGTACAAAATTTACTGEST: gi|352764588|gb|FQ472945.1|FQ472945
genomic: TGCTATTGCGGTGCTTGACAAGATTGCAGCCCCTGTTGATGTGAATGACCgtaagctttt ... tatttggcagGTGTTGCAATGTTGGGAATGGTGAAGAGTTGTATAGGTACAAAATTTACTG
EST: TGCTATTGCGGTGCTTGACAAGATTGCAGCCCCTGTTGATGTGAATGACC GTGTTGCAATGTTGGGAATGGTGAAGAGTTGTATAGGTACAAAATTTACTGEST: gi|352769725|gb|FQ468653.1|FQ468653
genomic: TGCTATTGCGGTGCTTGACAAGATTGCAGCCCCTGTTGATGTGAATGACCgtaagctttt ... tatttggcagGTGTTGCAATGTTGGGAATGGTGAAGAGTTGTATAGGTACAAAATTTACTG
EST: TGCTATTGCGGTGCTTGACAAGATTGCAGCCCCTGTTGATGTGAATGACC GTGTTGCAATGTTGGGAATGGTGAAGAGTTGTATAGGTACAAAATTTACTGEST: gi|161719245|gb|FC064810.1|FC064810
genomic: TGCTATTGCGGTGCTTGACAAGATTGCAGCCCCTGTTGATGTGAATGACCgtaagctttt ... tatttggcagGTGTTGCAATGTTGGGAATGGTGAAGAGTTGTATAGGTACAAAATTTACTG
EST: TGCTATTGCGGTGCTTGACAAGATTGCAGCCCCTGTTGATGTGAATGACC GTGTTGCAATGTTGGGAATGGTGAAGAGTTGTATAGGTACAAAATTTACTGEST: gi|71857633|gb|DT006688.1|DT006688
genomic: TGCTATTGCGGTGCTTGACAAGATTGCAGCCCCTGTTGATGTGAATGACCgtaagctttt ... tatttggcagGTGTTGCAATGTTGGGAATGGTGAAGAGTTGTATAGGTACAAAATTTACTG
EST: TGCTATTGCGGTGCTTGACAAGATTGCAGCCCCTGTTGATGTGAATGACC GTGTTGCAATGTTGGGAATGGGTGAAGAGTTGTATAGGTACAAAATTTACTEST: gi|71857432|gb|DT006487.1|DT006487
genomic: TGCTATTGCGGTGCTTGACAAGATTGCAGCCCCTGTTGATGTGAATGACCgtaagctttt ... tatttggcagGTGTTGCAATGTTGGGAATGG-TGAAGAGTTGTATAGGTACAAAATTTACT
EST: TGCTATTGCGGTGCTTGACAAGATTGCAGCCCCTGTTGATGTGAATGACC GTGTTGCAATGTTGGGAATGGTGAAGAGTTGTATAGGTACAAAATTTACTGEST: gi|71857184|gb|DT006239.1|DT006239
genomic: TGCTATTGCGGTGCTTGACAAGATTGCAGCCCCTGTTGATGTGAATGACCgtaagctttt ... tatttggcagGTGTTGCAATGTTGGGAATGGTGAAGAGTTGTATAGGTACAAAATTTACTG
EST: TGCTATTGCGGTGCTTGACAAGATTGCAGCCCCTGTTGATGTGAATGACC GTGTTGCAATGTTGEST: gi|71857006|gb|DT006061.1|DT006061
genomic: TGCTATTGCGGTGCTTGACAAGATTGCAGCCCCTGTTGATGTGAATGACCgtaagctttt ... tatttggcagGTGTTGCAATGTTG
EST: TGCTATTGCGGTGCTTGACAAGATTGCAGCCCCTGTTGATGTGAATGACC GTGTTGCAATGTTGGGAATGGTGAAG
genomic: TGCTATTGCGGTGCTTGACAAGATTGCAGCCCCTGTTGATGTGAATGACCgtaagctttt ... tatttggcagGTGTTGCAATGTTGGGAATGGTGAAG
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| CTTATAATAAAGCTCTTGAGGATGCTATTGCGGTGCTTGACAAGATTGCAGCCCCTGTTGATGTGAATGACCgtaagcttttacaatatttcccttcttattttatgcacttctttttatttgagttaaaatttctctttgtagtgtttatttacctgggtaattagaaata
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - tcccttct
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -ttagaaa