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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTACATTCTGAATTGAGGAACTGGTTTCAAGCAAACGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAGgtaccttggttcatcttttttatagtgtaccctgattcttccttagtcccattcagttattatctctgtttggaagataggttacttatatgttgaatta...

Basic information

species Vitis vinifera
transcript Vv13s0019g01090.t01
intron # 7
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|351038479|gb|FQ464345.1|FQ464345
EST:     AGCAAACACCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAG                         GTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGT
genomic: AGCAAACGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAGgtaccttggt ... cctgttgcagGTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGT
EST: gi|351041132|gb|FQ444109.1|FQ444109
EST:     AGCAAACACCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAG                         GTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
genomic: AGCAAACGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAGgtaccttggt ... cctgttgcagGTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
EST: gi|349816046|gb|FQ413560.1|FQ413560
EST:     AGCAAACACCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAG                         GTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGTCAAACCTGATGTTG
genomic: AGCAAACGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAGgtaccttggt ... cctgttgcagGTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
EST: gi|352794351|gb|FQ481582.1|FQ481582
EST:     AGCAAACACCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAG                         GTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
genomic: AGCAAACGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAGgtaccttggt ... cctgttgcagGTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
EST: gi|22009233|gb|BQ794267.1|BQ794267
EST:     AGCAAACACCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAG                         GTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAGCCTGATGTTG
genomic: AGCAAACGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAGgtaccttggt ... cctgttgcagGTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
EST: gi|351019486|gb|FQ429621.1|FQ429621
EST:     AGCAAACACCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAG                         GTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
genomic: AGCAAACGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAGgtaccttggt ... cctgttgcagGTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
EST: gi|110385016|gb|EC949495.1|EC949495
EST:     AGCAAACACCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAG                         GTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGTCAAACCTGATGTTG
genomic: AGCAAACGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAGgtaccttggt ... cctgttgcagGTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
EST: gi|33409894|gb|CF215521.1|CF215521
EST:     AGCAAACACCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAG                         GTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAGCCTGATGTTG
genomic: AGCAAACGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAGgtaccttggt ... cctgttgcagGTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
EST: gi|352794720|gb|FQ475218.1|FQ475218
EST:     AGCAAACACCAGTCCTGACGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAG                         GTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGA
genomic: AGCAAACGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAGgtaccttggt ... cctgttgcagGTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGA
EST: gi|351041944|gb|FQ456154.1|FQ456154
EST:     AGCAAACACCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAG                         GTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGTCAGACCTGATGTTG
genomic: AGCAAACGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAGgtaccttggt ... cctgttgcagGTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
EST: gi|351040825|gb|FQ438369.1|FQ438369
EST:     AGCAAACACCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAG                         GTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
genomic: AGCAAACGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAGgtaccttggt ... cctgttgcagGTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
EST: gi|349816969|gb|FQ405095.1|FQ405095
EST:     AGCCAACACCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAG                         GTTCCGTCAGTGGTGC
genomic: AGCAAACGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAGgtaccttggt ... cctgttgcagGTTCCGTCAGTGGTGC
EST: gi|351013812|gb|FQ433964.1|FQ433964
EST:     GCAAACACCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCCGAAT-ATCTATGGAG                         GTTCGGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCAAAACCTGATGT
genomic: GCAAACGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCC-GAATTATCTATGGAGgtaccttggt ... cctgttgcagGTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGT
EST: gi|351047362|gb|FQ451874.1|FQ451874
EST:     AGCAAACACCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAG                         GTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACC
genomic: AGCAAACGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAGgtaccttggt ... cctgttgcagGTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACC
EST: gi|351039910|gb|FQ464948.1|FQ464948
EST:     AGCAAACACCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAG                         GTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGNCA-GGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTT
genomic: AGCAAACGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAGgtaccttggt ... cctgttgcagGTTCCGTCAGTGGTGCAAACTG-CAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTT
EST: gi|351036877|gb|FQ459399.1|FQ459399
EST:     AGCAAACACCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAG                         GTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGTCAAACCTGATGTTG
genomic: AGCAAACGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAGgtaccttggt ... cctgttgcagGTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
EST: gi|349829292|gb|FQ419824.1|FQ419824
EST:     AGCAAACACCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAG                         GTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
genomic: AGCAAACGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAGgtaccttggt ... cctgttgcagGTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
EST: gi|110373850|gb|EC938250.1|EC938250
EST:     AGCAAACACCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAG                         GTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGTCAAACCTGATGTTG
genomic: AGCAAACGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAGgtaccttggt ... cctgttgcagGTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
EST: gi|352786559|gb|FQ479766.1|FQ479766
EST:     AGCGAACACCAGTCTTGAGGTTGCTGCAACAATCCCAATTATCTATGGAG                         GTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGTCCAACCC-GATGTT
genomic: AGCAAACGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAGgtaccttggt ... cctgttgcagGTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAG-CCAAACCTGATGTT
EST: gi|349809355|gb|FQ401123.1|FQ401123
EST:     AGCAAACACCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAG                         GTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGG
genomic: AGCAAACGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAGgtaccttggt ... cctgttgcagGTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGG
EST: gi|110371956|gb|EC936094.1|EC936094
EST:     AGCAAACACCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAG                         GTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGTCAAACCTGATGTTG
genomic: AGCAAACGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAGgtaccttggt ... cctgttgcagGTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
EST: gi|34542570|gb|CF510802.1|CF510802
EST:     AGCAAACACCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAG                         GTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGTCAAACCTGATGTTG
genomic: AGCAAACGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAGgtaccttggt ... cctgttgcagGTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
EST: gi|351014966|gb|FQ444255.1|FQ444255
EST:     AGCAAACACCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAG                         GTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
genomic: AGCAAACGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAGgtaccttggt ... cctgttgcagGTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
EST: gi|351054192|gb|FQ450274.1|FQ450274
EST:     AGCAAACACCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAG                         GTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAAATGGCAGCCAAACCTGATGTTG
genomic: AGCAAACGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAGgtaccttggt ... cctgttgcagGTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
EST: gi|110701828|gb|EE079848.1|EE079848
EST:     AGCAAACACCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAG                         GTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
genomic: AGCAAACGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAGgtaccttggt ... cctgttgcagGTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
EST: gi|110367539|gb|EC931476.1|EC931476
EST:     AGCAAACACCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAG                         GTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAGCCTGATGTTG
genomic: AGCAAACGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAGgtaccttggt ... cctgttgcagGTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
EST: gi|22008532|gb|BQ793566.1|BQ793566
EST:     AGCAAACACCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAG                         GTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAGCCTGATGTTG
genomic: AGCAAACGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAGgtaccttggt ... cctgttgcagGTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
EST: gi|349830607|gb|FQ416905.1|FQ416905
EST:     AGCAAACACCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAG                         GTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGTCAAACCTGATGTTG
genomic: AGCAAACGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAGgtaccttggt ... cctgttgcagGTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
EST: gi|351041047|gb|FQ443823.1|FQ443823
EST:     AGCAAACACCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAG                         GTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
genomic: AGCAAACGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAGgtaccttggt ... cctgttgcagGTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
EST: gi|22010611|gb|BQ795645.1|BQ795645
EST:     AGCAAACACCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAG                         GTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
genomic: AGCAAACGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAGgtaccttggt ... cctgttgcagGTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
EST: gi|351026742|gb|FQ436395.1|FQ436395
EST:     GCAAAACACCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAG                         GTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCCGATGTTG
genomic: GCAAA-CGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAGgtaccttggt ... cctgttgcagGTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
EST: gi|349810354|gb|FQ401800.1|FQ401800
EST:     AGCAAACACCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAG                         GTTTCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAAGAATTGGCAGTCAAACCTGATGTTT
genomic: AGCAAACGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAGgtaccttggt ... cctgttgcagGTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTT-
EST: gi|30252441|gb|CB969992.1|CB969992
EST:     AGCAAACACCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAG                         GTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGTCAAACCTGATGTTG
genomic: AGCAAACGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAGgtaccttggt ... cctgttgcagGTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
EST: gi|110412052|gb|EC977785.1|EC977785
EST:     AGCAAACGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAG                         GTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
genomic: AGCAAACGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAGgtaccttggt ... cctgttgcagGTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
EST: gi|349830236|gb|FQ420496.1|FQ420496
EST:     AGCAAACACCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAG                         GTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGTCAAACCTGAT
genomic: AGCAAACGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAGgtaccttggt ... cctgttgcagGTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGAT
EST: gi|352798926|gb|FQ480775.1|FQ480775
EST:     AGCAAACACCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAG                         GTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCGAGGAATTGGCAGTCAAACCTGATGTCG
genomic: AGCAAACGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAGgtaccttggt ... cctgttgcagGTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
EST: gi|351043162|gb|FQ451335.1|FQ451335
EST:     AGCAAACACCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAG                         GGTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAAC
genomic: AGCAAACGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAGgtaccttggt ... cctgttgcagGTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAAC
EST: gi|110397666|gb|EC963477.1|EC963477
EST:     AGCAAACACCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAG                         GTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGTCAAACCTGATGTTG
genomic: AGCAAACGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAGgtaccttggt ... cctgttgcagGTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
EST: gi|351023730|gb|FQ448281.1|FQ448281
EST:     AGCAAACACCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAG                         GTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGTCAAACCTGATGTTG
genomic: AGCAAACGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAGgtaccttggt ... cctgttgcagGTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
EST: gi|349827625|gb|FQ422493.1|FQ422493
EST:     AGCAAACACCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAG                         GTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
genomic: AGCAAACGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAGgtaccttggt ... cctgttgcagGTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
EST: gi|351042773|gb|FQ431251.1|FQ431251
EST:     AGCAAACACCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAG                         GTTCCGTCAGTGGTGCAAACCGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
genomic: AGCAAACGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAGgtaccttggt ... cctgttgcagGTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
EST: gi|351027707|gb|FQ446874.1|FQ446874
EST:     AGCAAACACCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAG                         GTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
genomic: AGCAAACGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAGgtaccttggt ... cctgttgcagGTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
EST: gi|351052015|gb|FQ455308.1|FQ455308
EST:     AGCAAACACCAGTCCTGAAGTTGCTGCAACAATCCCAATTATCTATGGAG                         GTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
genomic: AGCAAACGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAGgtaccttggt ... cctgttgcagGTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
EST: gi|351047662|gb|FQ455059.1|FQ455059
EST:     AGCAAACACCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAG                         GTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGTCAAACCTGATGTTG
genomic: AGCAAACGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAGgtaccttggt ... cctgttgcagGTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
EST: gi|349826786|gb|FQ418877.1|FQ418877
EST:     AGCAAACACCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAG                         GTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
genomic: AGCAAACGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAGgtaccttggt ... cctgttgcagGTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
EST: gi|351033084|gb|FQ446437.1|FQ446437
EST:     AGCAAACACCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAG                         GTTCCGTCAGTGGTGCAAACTGCAAGGAATTGGCAGCCAAACCTGATGTTG
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Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
GTACATTCTGAATTGAGGAACTGGTTTCAAGCAAACGCCAGTCCTGAGGTTGCTGCAACAATCCGAATTATCTATGGAGgtaccttggttcatcttttttatagtgtaccctgattcttccttagtcccattcagttattatctctgtttggaagataggttacttatatgttgaatta

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGCTGC
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