Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TGACAAGAGATTTGCTGGATTCTCAAAGGATAGCAAGCAGCTTGATGCCGAGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaaaattttgtcgtttgcctgtgttgcatatataaatgtgatttcgaaaatagtggttttccttttcagatgaagtcattttaataactcagcccttttgttgggtgctttccag

Basic information

species Vitis vinifera
transcript Vv05s0094g00870.t01
intron # 7
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|110688743|gb|EE067647.1|EE067647
EST:     AGGTTCACCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAAGA-GTACCAATCTCACTTCAGTGAATA
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGA-GAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATA
EST: gi|352786243|gb|FQ478854.1|FQ478854
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAAGAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|110687993|gb|EE066033.1|EE066033
EST:     AGGTTCAACGAAAGTATATTTATGGGGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         G
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccag-
EST: gi|110687993|gb|EE066033.1|EE066033
EST:     AGGTTCAACGAAAGTATATTTATGGGGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         G
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccag-
EST: gi|110701586|gb|EE079326.1|EE079326
EST:     AGGGTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCA-TCTTC-CTTC-GATGAAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCT-CACTTCAG-TGAAT
EST: gi|351052716|gb|FQ453824.1|FQ453824
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAATACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|351035828|gb|FQ463673.1|FQ463673
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAAATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAG
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAG
EST: gi|351037797|gb|FQ464238.1|FQ464238
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|351049402|gb|FQ450003.1|FQ450003
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATNTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAAATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|110686568|gb|EE064352.1|EE064352
EST:     AGGTTCACCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCANTCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|351028657|gb|FQ446330.1|FQ446330
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|351054984|gb|FQ440323.1|FQ440323
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCGGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|351032064|gb|FQ460321.1|FQ460321
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|351028159|gb|FQ426060.1|FQ426060
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|351042347|gb|FQ442814.1|FQ442814
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|349816158|gb|FQ403654.1|FQ403654
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGGTGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|110696492|gb|EE072654.1|EE072654
EST:     AGGTTCACCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|349816937|gb|FQ405063.1|FQ405063
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTACTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|352791372|gb|FQ480951.1|FQ480951
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAACCAGAGAAGTACCCATCTCCCTTCA
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCA
EST: gi|71875274|gb|DT024329.1|DT024329
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|110732133|gb|EE107155.1|EE107155
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|351022139|gb|FQ438724.1|FQ438724
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAAAAGATGAGCCAGAGAA
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAA
EST: gi|351048147|gb|FQ442117.1|FQ442117
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|349818595|gb|FQ403230.1|FQ403230
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGNG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|351047781|gb|FQ459001.1|FQ459001
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|351054171|gb|FQ450253.1|FQ450253
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|110731536|gb|EE106033.1|EE106033
EST:     AGGTTCACCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTANTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAAATGAGCCAGAGAAGTACCATTCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|351031632|gb|FQ459889.1|FQ459889
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAAGAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|352793942|gb|FQ479184.1|FQ479184
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|352795717|gb|FQ480305.1|FQ480305
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAATACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|110685153|gb|EE063252.1|EE063252
EST:     AGGTTCACCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|349809512|gb|FQ414402.1|FQ414402
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|110728621|gb|EE104351.1|EE104351
EST:     AGGTTCACCGAAAGTA-ATTTATGGGGGCCATGTTAGTGCCTATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAACCAGAAAAGTACC
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACC
EST: gi|351052704|gb|FQ453812.1|FQ453812
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGA
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGA
EST: gi|110690339|gb|EE067354.1|EE067354
EST:     AGGTTCACCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|351043389|gb|FQ451441.1|FQ451441
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|110690035|gb|EE066784.1|EE066784
EST:     AGGTTCACCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|110700226|gb|EE078022.1|EE078022
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|110732496|gb|EE107833.1|EE107833
EST:     AGGTTCACCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|110688303|gb|EE066703.1|EE066703
EST:     AGGTTCACCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|110688735|gb|EE067623.1|EE067623
EST:     AGGTTCACCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTAC-AATCTCACTTCAGTGGATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|110687863|gb|EE065759.1|EE065759
EST:     AGGTTCACCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|110690562|gb|EE067780.1|EE067780
EST:     AGGTTCACCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAG-ACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|110689577|gb|EE065921.1|EE065921
EST:     AGGTTCACCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|349825764|gb|FQ421863.1|FQ421863
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAAATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|110686949|gb|EE063934.1|EE063934
EST:     AGGTTCACCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         G
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccag-
EST: gi|110686949|gb|EE063934.1|EE063934
EST:     AGGTTCACCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         G
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccag-
EST: gi|351053892|gb|FQ441658.1|FQ441658
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|161717746|gb|FC068154.1|FC068154
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|351051682|gb|FQ449496.1|FQ449496
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|351017467|gb|FQ435820.1|FQ435820
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGA-TAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|110686761|gb|EE064769.1|EE064769
EST:     AGGTTCACCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAAAAGATGAGCCAGAGAAATACCCATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|351054606|gb|FQ456803.1|FQ456803
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|349828292|gb|FQ416245.1|FQ416245
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTT
EST: gi|110703592|gb|EE080575.1|EE080575
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|71870747|gb|DT019802.1|DT019802
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAAGA-GTACCAATCTCACTTCAGTGAATA
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGA-GAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATA
EST: gi|110700868|gb|EE077897.1|EE077897
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAAGC-AGAGAAGTAC-AATCTCACTTCAGTGAATA
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGA-GCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATA
EST: gi|351045369|gb|FQ451817.1|FQ451817
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|110728760|gb|EE104609.1|EE104609
EST:     AGGTTCACCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAATGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAAATGAGCCAGAAAAGTACCNATCTCCCTTCAGTGAAAAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|351036479|gb|FQ457192.1|FQ457192
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGCGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|349827005|gb|FQ419096.1|FQ419096
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCGGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|351034672|gb|FQ458029.1|FQ458029
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAG
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAG
EST: gi|351055460|gb|FQ442058.1|FQ442058
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|110701016|gb|EE078177.1|EE078177
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|161713914|gb|FC062586.1|FC062586
EST:     AGGTTCACCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGT
EST: gi|351035652|gb|FQ463497.1|FQ463497
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGAACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|351023942|gb|FQ423365.1|FQ423365
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|71870743|gb|DT019798.1|DT019798
EST:     AGGTTCACCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGACCCAGAAAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|110686174|gb|EE063536.1|EE063536
EST:     AGGTTCACCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|110685135|gb|EE063210.1|EE063210
EST:     AGGTTCACCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|110729513|gb|EE105541.1|EE105541
EST:     AGGTTCACCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|351042500|gb|FQ431098.1|FQ431098
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|110694169|gb|EE071050.1|EE071050
EST:     AGGTTCACCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|351056253|gb|FQ453715.1|FQ453715
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|110368413|gb|EC932387.1|EC932387
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|351056821|gb|FQ443448.1|FQ443448
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATTTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|110687419|gb|EE064811.1|EE064811
EST:     AGGTTCACCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAG-ACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|351044649|gb|FQ443180.1|FQ443180
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|352790933|gb|FQ478535.1|FQ478535
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|351053060|gb|FQ456667.1|FQ456667
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACCTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAATACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|110705984|gb|EE083454.1|EE083454
EST:     AGGTTCACCGAAAGTATAATTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGAAAAAAGATGAGCCAGAGAAGTACCCATCTCACTTTC-GTGAATA
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTT-CAGTGAATA
EST: gi|351015342|gb|FQ445626.1|FQ445626
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|110701654|gb|EE079474.1|EE079474
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|110708835|gb|EE086828.1|EE086828
EST:     AGGTTCACCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|351015070|gb|FQ444359.1|FQ444359
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|351023309|gb|FQ432692.1|FQ432692
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|351039209|gb|FQ457884.1|FQ457884
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCA
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCA
EST: gi|351017666|gb|FQ436019.1|FQ436019
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCATTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|351036473|gb|FQ457186.1|FQ457186
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGCGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|349833286|gb|FQ416664.1|FQ416664
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|349823837|gb|FQ415248.1|FQ415248
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|349822510|gb|FQ412774.1|FQ412774
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATAGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|110715670|gb|EE093983.1|EE093983
EST:     GGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATNGT-AGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGA-GAGCCAGAGAA-TACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: GGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCAT-GTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|110696093|gb|EE074862.1|EE074862
EST:     AGGTTCACCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAAAA-
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|110689486|gb|EE065752.1|EE065752
EST:     AGGTTCACCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAAGC-AGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGGATA
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGA-GCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATA
EST: gi|351028856|gb|FQ434857.1|FQ434857
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|110690704|gb|EE068094.1|EE068094
EST:     AGGTTCACCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAAAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|110710329|gb|EE086567.1|EE086567
EST:     AGGTTCACCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGT-CCAATCTGACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|349833203|gb|FQ416581.1|FQ416581
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|352791507|gb|FQ481086.1|FQ481086
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|34546375|gb|CF514607.1|CF514607
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|352769837|gb|FQ468765.1|FQ468765
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCCGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|110686600|gb|EE064424.1|EE064424
EST:     AGGTTCACCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|351039799|gb|FQ464837.1|FQ464837
EST:     AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGNG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
EST: gi|110702002|gb|EE080214.1|EE080214
EST:     AGGTTCACCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGG                         ACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT
genomic: AGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaa ... tgctttccagACTTTGATAGAAGATGAGCCAGAGAAGTACCAATCTCACTTCAGTGAATAT

Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
TGACAAGAGATTTGCTGGATTCTCAAAGGATAGCAAGCAGCTTGATGCCGAGGTTCATCGAAAGTATATTTATGGTGGCCATGTTAGTGCATATATGGGGgtaaggctaaaattttgtcgtttgcctgtgttgcatatataaatgtgatttcgaaaatagtggttttccttttcagatgaagtcattttaataactcagcccttttgttgggtgctttccag

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGTGG