Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

AATGCTGAAGGATGGGCTGTGGGATGTTTACAGTGATACAGGGATGGGTGTTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAGgtatcattttgtacccatatattgtgttgcaaacaatttcacaagaaaccttacacttcaacttccagtagttcctccctattcatgcatattgcaattcatttgtaaaaataatcgttatcttaaatctgcttttagtaacacctacaattttttgtgacttgttcctgcacatttgccacag

Basic information

species Vitis vinifera
transcript Vv12s0057g01200.t01
intron # 6
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|110398909|gb|EC965389.1|EC965389
EST:     TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAG                         GATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
genomic: TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAGgtatcatttt ... tttgccacagGATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
EST: gi|30126694|gb|CB912033.1|CB912033
EST:     TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAG                         GATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
genomic: TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAGgtatcatttt ... tttgccacagGATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
EST: gi|30133903|gb|CB919242.1|CB919242
EST:     TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAG                         GATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
genomic: TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAGgtatcatttt ... tttgccacagGATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
EST: gi|110699364|gb|EE076300.1|EE076300
EST:     TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAG                         GATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
genomic: TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAGgtatcatttt ... tttgccacagGATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
EST: gi|110403296|gb|EC964774.1|EC964774
EST:     TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAG                         GATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
genomic: TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAGgtatcatttt ... tttgccacagGATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
EST: gi|71859096|gb|DT008151.1|DT008151
EST:     TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAG                         GATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
genomic: TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAGgtatcatttt ... tttgccacagGATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
EST: gi|110701385|gb|EE078893.1|EE078893
EST:     TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAG                         GATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
genomic: TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAGgtatcatttt ... tttgccacagGATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
EST: gi|161716985|gb|FC066530.1|FC066530
EST:     TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAG                         GATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
genomic: TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAGgtatcatttt ... tttgccacagGATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
EST: gi|161717757|gb|FC064725.1|FC064725
EST:     TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAG                         GATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
genomic: TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAGgtatcatttt ... tttgccacagGATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
EST: gi|71866622|gb|DT015677.1|DT015677
EST:     TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAG                         GATGCTTATGCTATTC
genomic: TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAGgtatcatttt ... tttgccacagGATGCTTATGCTATTC
EST: gi|161712803|gb|FC062326.1|FC062326
EST:     TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAG                         GATGCTTATGCT-TTCATAGCTTTGAGCGTGGTAT-GCTGCCCA-GATGGT
genomic: TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAGgtatcatttt ... tttgccacagGATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
EST: gi|30128765|gb|CB914104.1|CB914104
EST:     TAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAG                         GATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
genomic: TAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAGgtatcatttt ... tttgccacagGATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
EST: gi|110700654|gb|EE077500.1|EE077500
EST:     TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAG                         GATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
genomic: TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAGgtatcatttt ... tttgccacagGATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
EST: gi|110398035|gb|EC964108.1|EC964108
EST:     TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAG                         GATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
genomic: TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAGgtatcatttt ... tttgccacagGATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
EST: gi|32269649|gb|CD718808.1|CD718808
EST:     TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAG                         GATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGT
genomic: TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAGgtatcatttt ... tttgccacagGATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGT
EST: gi|30254555|gb|CB971300.1|CB971300
EST:     TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAG                         GATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
genomic: TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAGgtatcatttt ... tttgccacagGATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
EST: gi|71875811|gb|DT024866.1|DT024866
EST:     TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAG                         GATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
genomic: TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAGgtatcatttt ... tttgccacagGATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
EST: gi|110723077|gb|EE099979.1|EE099979
EST:     TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAG                         GATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
genomic: TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAGgtatcatttt ... tttgccacagGATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
EST: gi|30130051|gb|CB915390.1|CB915390
EST:     TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAG                         GATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
genomic: TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAGgtatcatttt ... tttgccacagGATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
EST: gi|110686757|gb|EE064757.1|EE064757
EST:     TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAG                         GATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
genomic: TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAGgtatcatttt ... tttgccacagGATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
EST: gi|30129595|gb|CB914934.1|CB914934
EST:     TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAG                         GATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
genomic: TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAGgtatcatttt ... tttgccacagGATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
EST: gi|349833317|gb|FQ416695.1|FQ416695
EST:     TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAG                         GATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
genomic: TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAGgtatcatttt ... tttgccacagGATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
EST: gi|161720962|gb|FC070684.1|FC070684
EST:     TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAG                         GATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
genomic: TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAGgtatcatttt ... tttgccacagGATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
EST: gi|110698167|gb|EE075418.1|EE075418
EST:     TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAG                         GATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
genomic: TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAGgtatcatttt ... tttgccacagGATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
EST: gi|110685325|gb|EE063616.1|EE063616
EST:     TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAG                         GATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
genomic: TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAGgtatcatttt ... tttgccacagGATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
EST: gi|110723249|gb|EE100343.1|EE100343
EST:     TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAG                         GATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
genomic: TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAGgtatcatttt ... tttgccacagGATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
EST: gi|110368276|gb|EC932247.1|EC932247
EST:     TGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAG                         GATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
genomic: TGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAGgtatcatttt ... tttgccacagGATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
EST: gi|110371396|gb|EC935385.1|EC935385
EST:     TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAG                         GATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
genomic: TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAGgtatcatttt ... tttgccacagGATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
EST: gi|71859317|gb|DT008372.1|DT008372
EST:     TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAG                         GATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
genomic: TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAGgtatcatttt ... tttgccacagGATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
EST: gi|33402805|gb|CF208432.1|CF208432
EST:     TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAG                         GATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
genomic: TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAGgtatcatttt ... tttgccacagGATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
EST: gi|34543095|gb|CF511327.1|CF511327
EST:     TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAG                         GATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
genomic: TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAGgtatcatttt ... tttgccacagGATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
EST: gi|110361968|gb|EC925474.1|EC925474
EST:     TTTGTGGTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAG                         GATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
genomic: TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAGgtatcatttt ... tttgccacagGATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
EST: gi|77587675|gb|DV223012.1|DV223012
EST:     TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAG                         GATGCTTATGCTATTCA
genomic: TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAGgtatcatttt ... tttgccacagGATGCTTATGCTATTCA
EST: gi|30299187|gb|CB975981.1|CB975981
EST:     TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAG                         GATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
genomic: TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAGgtatcatttt ... tttgccacagGATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
EST: gi|110361336|gb|EC924802.1|EC924802
EST:     TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAG                         GATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
genomic: TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAGgtatcatttt ... tttgccacagGATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
EST: gi|110362059|gb|EC925566.1|EC925566
EST:     GATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAG                         GATGCTTATGCTTTTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
genomic: GATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAGgtatcatttt ... tttgccacagGATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
EST: gi|110357331|gb|EC920800.1|EC920800
EST:     TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAG                         GATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
genomic: TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAGgtatcatttt ... tttgccacagGATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
EST: gi|110702702|gb|EE078902.1|EE078902
EST:     TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAG                         GATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
genomic: TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAGgtatcatttt ... tttgccacagGATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
EST: gi|110364569|gb|EC927918.1|EC927918
EST:     TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAG                         GATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
genomic: TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAGgtatcatttt ... tttgccacagGATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
EST: gi|77586011|gb|DV222101.1|DV222101
EST:     TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAG                         GATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
genomic: TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAGgtatcatttt ... tttgccacagGATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
EST: gi|71858509|gb|DT007564.1|DT007564
EST:     TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAG                         GATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
genomic: TTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAGgtatcatttt ... tttgccacagGATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
EST: gi|110723122|gb|EE100072.1|EE100072
EST:     ATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAG                         GATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT
genomic: ATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAGgtatcatttt ... tttgccacagGATGCTTATGCTATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGT

Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
AATGCTGAAGGATGGGCTGTGGGATGTTTACAGTGATACAGGGATGGGTGTTTGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAGgtatcattttgtacccatatattgtgttgcaaacaatttcacaagaaaccttacacttcaacttccagtagttcctccctattcatgcatattgcaattcatttgtaaaaataatcgttatcttaaatctgcttttagtaacacctacaattttttgtgacttgttcctgcacatttgccacag

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  GCAGAT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  GAGGAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  GGAGCA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGCAG