Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

ATATTTAATGGTGTCTTTCTGAAAGTAAACAAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttctgactgccaacttcataaccttcagggatcatatctccacatgcaatctgttattcatatactgaagattgtttcag

Basic information

species Vitis vinifera
transcript Vv11s0052g00290.t01
intron # 5
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: Vv11s0052g00290.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 5
lower sequence: LOC_Os08g13690.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 5
ATATTTAATGGTGTCTTTCTGAAAGTAAACAAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgt-----gttctgactgccaac---ttcata-----accttcagggatcatatctc-cacatgcaatctgttattcatatactgaagattgtttcag
|| || ||||||||||| || || || ||||||||||| || || ||||||| |||||||||||| |||||  |||| ||||||||      || |  ||||       || |||     | ||      || ||  ||  |   | ||  ||  || || |  |  | | ||| |     
ATCTTCAATGGTGTCTTCCTCAAGGTTAACAAGGCAACCATTAACATGCTGCGCAGGGTTGAGCCATATGTTGCATATGGgtatgttatcaattttagctgctgttctgtttatatatttagctgtgctaattattgcttgctgttacagacttgtaatcctccatcgcaaattatcaat-

upper sequence: Vv11s0052g00290.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 5
lower sequence: GRMZM5G868433_T02 (Zea mays), 5'ss of exon 5
ATATTTAATGGTGTCTTTCTGAAAGTAAACAAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttctgactgccaacttcataaccttcagggatcatatctccacatgcaatctgtt--attcatatactgaagattgtttcag-------------
||||| ||||| || || |||||||| |||||||| || || || ||||| | ||||||||||||||||||  |||| |||||  |  |||   |||  | || || |   ||  |  || ||| |     |    |    |  |   |  || |  | |     |||              
ATATTCAATGGCGTGTTCCTGAAAGTCAACAAGGCTACCATTAACATGCTTCGCAGGGTTGAGCCTTATGTTGCATATGGgtaatttctct--ttgctgatttaattattgtcttgcttcttattttggtgtatttttcactcgaagtacgtagttgaaaagagatcatactgtgacctgtt

upper sequence: Vv11s0052g00290.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 5
lower sequence: GLYMA08G23750.2 (Glycine max), 5'ss of exon 5
ATATTTAATGGTGTCTTTCTGAAAGTAAACAAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttctgac-tgccaacttcataaccttcagggatcatatctccacatgcaatctgttattcatatactgaagattgtttcag
|| || |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| | ||  | |||||   | ||    ||    ||| |||  |    ||   | ||| || | | |         |||||| ||
ATTTTCAATGGTGTATTTCTCAAAGTTAACAAAGCCACAGTGAACATGCTGCACAGAGTTGAGCCCTATGTGACTTATGGgtatgtttacttccctgccatacttatttaatt--atgattataggtttttat---aactgctaatgagacttctgcttttgttttag

upper sequence: Vv11s0052g00290.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 5
lower sequence: GLYMA07G02270.1 (Glycine max), 5'ss of exon 5
ATATTTAATGGTGTCTTTCTGAAAGTAAACAAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttctgactgccaacttcataaccttcagggatcatatctccacatgcaatctgttattcatatactgaagattgtttcag
|| || |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||   ||         |||  | |  || |   |  ||   |    ||     |||||| | | |         |||||  ||
ATTTTCAATGGTGTATTTCTCAAAGTTAACAAAGCCACAGTGAACATGCTGCACAGAGTTGAGCCGTATGTGACTTATGGgtatgtcaacttttccttgtcttactta--tttaaatacgatgattt---atttttactgttaatgagacttctgcttttgttctag

upper sequence: Vv11s0052g00290.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 5
lower sequence: GLYMA09G06860.1 (Glycine max), 5'ss of exon 5
ATATTTAATGGTGTCTTTCTGAAAGTAAACAAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttctgactgccaacttcataaccttcagggatcatatctccacatgcaatctgttattcatatactgaagattgtttcag
|| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |||      |  | |  || ||   | | | || ||||   | |     | |   ||| || ||||    ||      |||||
ATTTTTAATGGCGTCTTTCTTAAAGTGAACAAAGCTACCGTGAATATGCTGCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGGgtaagtgaaagttcaacgacattgattgtcat-atggttcat---tacctgcaccacgggttcttaatatttgcaaatccacttcag

upper sequence: Vv11s0052g00290.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 5
lower sequence: GLYMA15G18170.2 (Glycine max), 5'ss of exon 5
ATATTTAATGGTGTCTTTCTGAAAGTAAACAAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttctgactgccaacttcat-aaccttcagggatcatatctccacatgcaatctg-ttattcatatactgaagattgtttcag
|| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||| |||     |    ||||| |||  |   ||| || ||||      || ||||   || || || ||||    ||      |||||
ATTTTTAATGGCGTCTTTCTTAAAGTGAACAAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGGgtaagtg----aaagttcaactacattgattctcatggttcat-----tacctgcaccatggttcttaatatttgcaaatccacttcag

upper sequence: Vv11s0052g00290.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 5
lower sequence: PP1S163_37V6.1 (Physcomitrella patens), 5'ss of exon 3
--------------------ATATTTAATGGTGTCTTTCTGAAAGTAAACAAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttctgac-tgccaacttcataacc--ttcagggatcatatctccacatgcaatctgttattcatatactgaagattgtttcag----------------------------------------------------------------------
                    || || || ||||| ||  |||| || |||||||| ||  |||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||  ||   | | | | |   |||  | |    ||   |||| |  |  |    |   ||       |||| ||  |    || |||                                                                         
AGCTGTTGAGGCTTAGACAGATCTTCAACGGTGTGTTCATGAAGGTGAACAAGGCCACTGTGAATATGTTGCGCAGAGTTGAGCCTTATGTCACATACGGgtgagttaacagtcattcttgctttgtcatgggttttaggattagctgcctgtttcgcattgacgtatcattta--gggtgttatttagaactttggtgtctctaggttgaatagccctaaatgtgaacttgactcaatcgaaacttcgctatctttcag

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|71868080|gb|DT017135.1|DT017135
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|351043525|gb|FQ430999.1|FQ430999
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|30329623|gb|CD012885.1|CD012885
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|110722112|gb|EE098055.1|EE098055
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|349812134|gb|FQ410931.1|FQ410931
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACCAAGAGGGGTTATG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTAC-AAGAGGGGTTATG
EST: gi|351012206|gb|FQ426928.1|FQ426928
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|351013753|gb|FQ433905.1|FQ433905
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|34542829|gb|CF511061.1|CF511061
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|110725716|gb|EE102533.1|EE102533
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|110689658|gb|EE066085.1|EE066085
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|110685837|gb|EE062904.1|EE062904
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|34548592|gb|CF516824.1|CF516824
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|351014510|gb|FQ437512.1|FQ437512
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|77580651|gb|DV219229.1|DV219229
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|110695684|gb|EE073981.1|EE073981
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|110722869|gb|EE099531.1|EE099531
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|26266801|gb|CA817864.1|CA817864
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|37188941|gb|CF608290.1|CF608290
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATT
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATT
EST: gi|87584219|gb|DY473459.1|DY473459
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|161712382|gb|FC061687.1|FC061687
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|33407532|gb|CF213159.1|CF213159
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAGTTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|30127744|gb|CB913083.1|CB913083
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|30304879|gb|CB981673.1|CB981673
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|29785690|gb|CB342958.2|CB342958
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|34320197|gb|CF372951.1|CF372951
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCNCAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|351032161|gb|FQ460418.1|FQ460418
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|71875336|gb|DT024391.1|DT024391
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|34542742|gb|CF510974.1|CF510974
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|110389408|gb|EC954242.1|EC954242
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|161720606|gb|FC070216.1|FC070216
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|33407447|gb|CF213074.1|CF213074
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAGTTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|110700111|gb|EE077779.1|EE077779
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|351019405|gb|FQ429540.1|FQ429540
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|351015300|gb|FQ445584.1|FQ445584
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|351024712|gb|FQ433127.1|FQ433127
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTGCAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|351044035|gb|FQ431466.1|FQ431466
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|351030503|gb|FQ436929.1|FQ436929
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|34548001|gb|CF516233.1|CF516233
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|351015964|gb|FQ431919.1|FQ431919
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|71888187|gb|DT037242.1|DT037242
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|110699001|gb|EE077139.1|EE077139
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|110702119|gb|EE080467.1|EE080467
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|110709244|gb|EE084536.1|EE084536
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|161719021|gb|FC067641.1|FC067641
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|30304952|gb|CB981746.1|CB981746
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|30304884|gb|CB981678.1|CB981678
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|351016367|gb|FQ446227.1|FQ446227
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|110397494|gb|EC963234.1|EC963234
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|26264883|gb|CA815946.1|CA815946
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|34548504|gb|CF516736.1|CF516736
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|351029873|gb|FQ427713.1|FQ427713
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGCCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|351037576|gb|FQ462559.1|FQ462559
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|351021842|gb|FQ437227.1|FQ437227
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAAGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|77582255|gb|DV220090.1|DV220090
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|26265679|gb|CA816742.1|CA816742
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|87584426|gb|DY473609.1|DY473609
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|30304947|gb|CB981741.1|CB981741
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|351029733|gb|FQ427573.1|FQ427573
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|110700689|gb|EE077563.1|EE077563
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|29784736|gb|CB345836.2|CB345836
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|349826288|gb|FQ416093.1|FQ416093
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|351042582|gb|FQ431180.1|FQ431180
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|71884048|gb|DT033103.1|DT033103
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|33407017|gb|CF212644.1|CF212644
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|110429780|gb|EC996285.1|EC996285
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|110691911|gb|EE070557.1|EE070557
EST:     CCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: CCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|110703700|gb|EE080774.1|EE080774
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|161720911|gb|FC070321.1|FC070321
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|110703784|gb|EE080935.1|EE080935
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|22015391|gb|BQ800425.1|BQ800425
EST:     GGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: GGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|351028634|gb|FQ446307.1|FQ446307
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|34320356|gb|CF373110.1|CF373110
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|351029952|gb|FQ430694.1|FQ430694
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|34548330|gb|CF516562.1|CF516562
EST:     AACAATGAATATGCTGCACAGGG-NGATCCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGA-GCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|26263687|gb|CA814750.1|CA814750
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|33405893|gb|CF211520.1|CF211520
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|351030952|gb|FQ438988.1|FQ438988
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|349824683|gb|FQ413350.1|FQ413350
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|351014750|gb|FQ437950.1|FQ437950
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|37187339|gb|CF606692.1|CF606692
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|110386718|gb|EC951335.1|EC951335
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|37189894|gb|CF609243.1|CF609243
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|27584547|gb|CB007242.1|CB007242
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|351032451|gb|FQ458816.1|FQ458816
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|110379121|gb|EC944297.1|EC944297
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|110420223|gb|EC986488.1|EC986488
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|71879320|gb|DT028375.1|DT028375
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
EST: gi|351048122|gb|FQ442092.1|FQ442092
EST:     AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGG                         GTATCCCAATTTAAAGAGTGCCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG
genomic: AAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttc ... attgtttcagGTATCCCAATTTAAAGAGTGTCAGGGAACTGATTTACAAGAGGGGTTATGG

Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
ATATTTAATGGTGTCTTTCTGAAAGTAAACAAGGCAACAATGAATATGCTGCACAGGGTTGAGCCTTATGTGACATACGGgtatgtgttctgactgccaacttcataaccttcagggatcatatctccacatgcaatctgttattcatatactgaagattgtttcag

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  ATGCTG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGCTGC