Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GACCTGCATTCTACAAATATATCACAATCATGTGCTGCTTGAATGCATTAGCATTGTTTGCTTGTGGGCTTACAGGAAATGGGGCTGGTTTTGGGTTCTGgtattcctcaatctagtttttctatgaagcaaagaatttcactggcatttattgagtcgagatactaaattttttctttaattttttttgcag

Basic information

species Vitis vinifera
transcript Vv14s0030g00750.t01
intron # 4
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|30131882|gb|CB917221.1|CB917221
EST:     GCATTGTTTGCTTGTGGGCTTACAGGAAATGGGGCTGGTTTTGGGTTCTG                         GTTATATGGTCTTACAATGATTTTCTACCATGCCTTTTATCTTCCCCTTCT
genomic: GCATTGTTTGCTTGTGGGCTTACAGGAAATGGGGCTGGTTTTGGGTTCTGgtattcctca ... ttttttgcagGTTATATGGTCTTACAATGATTTTCTACCATGCCTTTTATCTTCCCCTTCT
EST: gi|22012612|gb|BQ797646.1|BQ797646
EST:     GCATTGTTTGCTTGTGGGCTTACAGGAAATGGGGCTGGTTTTGGGTTCTG                         GTTATATGGTCTTACAATGATTTTCTACCATGCCTTTTATCTTCCCCTTCT
genomic: GCATTGTTTGCTTGTGGGCTTACAGGAAATGGGGCTGGTTTTGGGTTCTGgtattcctca ... ttttttgcagGTTATATGGTCTTACAATGATTTTCTACCATGCCTTTTATCTTCCCCTTCT
EST: gi|110365218|gb|EC927851.1|EC927851
EST:     GCATTGTTTGCTTGTGGGCTTACGGGAAATGGGGCTGGTTTTGGGTTCTG                         GTTATATGGTCTTACAATGATTTTCTACCATGCCTTTTATCTTCCCCTTCT
genomic: GCATTGTTTGCTTGTGGGCTTACAGGAAATGGGGCTGGTTTTGGGTTCTGgtattcctca ... ttttttgcagGTTATATGGTCTTACAATGATTTTCTACCATGCCTTTTATCTTCCCCTTCT
EST: gi|30133320|gb|CB918659.1|CB918659
EST:     GCATTGTTTGCTTGTGGGCTTACAGGAAATGGGGCTGGTTTTGGGTTCTG                         GTTATATGGTCTTACAATGATTTTCTACCATGCCTTTTATCTTCCCCTTCT
genomic: GCATTGTTTGCTTGTGGGCTTACAGGAAATGGGGCTGGTTTTGGGTTCTGgtattcctca ... ttttttgcagGTTATATGGTCTTACAATGATTTTCTACCATGCCTTTTATCTTCCCCTTCT
EST: gi|110703012|gb|EE079484.1|EE079484
EST:     GCATTGTTTGCTTGTGGGCTTACAGGAAATGGGGCTGGTTTTGGGTTCTG                         GTTATATGGTCTTACAATGATTTTCTACCATGCCTTTTATCTTCCCCTTCT
genomic: GCATTGTTTGCTTGTGGGCTTACAGGAAATGGGGCTGGTTTTGGGTTCTGgtattcctca ... ttttttgcagGTTATATGGTCTTACAATGATTTTCTACCATGCCTTTTATCTTCCCCTTCT
EST: gi|110414461|gb|EC980293.1|EC980293
EST:     GCATTGTTTGCTTGTGGGCTTACAGGAAATGGGGCTGGTTTTGGGTTCTG                         GTTATATGGTCTTACAATGATTTTCTACCATGCCTTTTATCTTCCCCTTCT
genomic: GCATTGTTTGCTTGTGGGCTTACAGGAAATGGGGCTGGTTTTGGGTTCTGgtattcctca ... ttttttgcagGTTATATGGTCTTACAATGATTTTCTACCATGCCTTTTATCTTCCCCTTCT
EST: gi|110394639|gb|EC959842.1|EC959842
EST:     GCATTGTTTGCTTGTGGGCTTACAGGAAATGGGGCTGGTTTTGGGTTCTG                         GTTATATGGTCTTACAATGATTTTCTACCATGCCTTTTATCTTCCCCTTCT
genomic: GCATTGTTTGCTTGTGGGCTTACAGGAAATGGGGCTGGTTTTGGGTTCTGgtattcctca ... ttttttgcagGTTATATGGTCTTACAATGATTTTCTACCATGCCTTTTATCTTCCCCTTCT