Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GATTGGGGTGCCCCAATTACTGATGCCCCCCAGTGGGGCGCTGATGTGCCTGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagatttattattattttttttttgcatgttattacttactatactatgataatttgtttaggtgattcatagcagtgtaaggccaagttctccatgt...

Basic information

species Vitis vinifera
transcript Vv09s0002g00610.t01
intron # 4
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|34548874|gb|CF517106.1|CF517106
EST:     TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG                         CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: gi|110389336|gb|EC954165.1|EC954165
EST:     TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG                         CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: gi|110398915|gb|EC965395.1|EC965395
EST:     TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG                         CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: gi|110686910|gb|EE063860.1|EE063860
EST:     TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG                         CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: gi|110361246|gb|EC924704.1|EC924704
EST:     TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG                         CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: gi|110410432|gb|EC976115.1|EC976115
EST:     TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG                         CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: gi|110421416|gb|EC987712.1|EC987712
EST:     TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG                         CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: gi|33403267|gb|CF208894.1|CF208894
EST:     TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGNAATTGGGGGGATGCAG                         CTCCAATGCCAAGTGC
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGC
EST: gi|110418119|gb|EC984238.1|EC984238
EST:     TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG                         CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: gi|34319062|gb|CF371816.1|CF371816
EST:     TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG                         CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: gi|110405324|gb|EC970865.1|EC970865
EST:     TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG                         CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: gi|110358619|gb|EC922961.1|EC922961
EST:     TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG                         CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: gi|77584300|gb|DV221222.1|DV221222
EST:     TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG                         CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: gi|351016834|gb|FQ424261.1|FQ424261
EST:     TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCATTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG                         CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCCATTGCCACAGATGGAT
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGAT
EST: gi|71866748|gb|DT015803.1|DT015803
EST:     TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG                         CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: gi|110684621|gb|EE062112.1|EE062112
EST:     TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG                         CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: gi|45771399|gb|CN007251.1|CN007251
EST:     TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG                         CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: gi|349830243|gb|FQ420503.1|FQ420503
EST:     TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG                         CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: gi|110423447|gb|EC989793.1|EC989793
EST:     TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG                         CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: gi|351030264|gb|FQ432202.1|FQ432202
EST:     TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG                         CTCCAATGCCAAGTGCAAGTTC-AATTGCAACA
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCA-GTTCCAATTGCAACA
EST: gi|30299183|gb|CB975977.1|CB975977
EST:     TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG                         CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: gi|45770192|gb|CN006044.1|CN006044
EST:     TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG                         CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: gi|110388054|gb|EC952769.1|EC952769
EST:     TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG                         CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: gi|110692344|gb|EE071478.1|EE071478
EST:     TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG                         CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: gi|22015361|gb|BQ800395.1|BQ800395
EST:     TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG                         CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: gi|77587539|gb|DV222935.1|DV222935
EST:     TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG                         CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: gi|110359530|gb|EC921169.1|EC921169
EST:     TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG                         CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: gi|29782971|gb|CB348758.2|CB348758
EST:     TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG                         CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: gi|110403126|gb|EC964326.1|EC964326
EST:     TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG                         CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: gi|110373042|gb|EC937249.1|EC937249
EST:     TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG                         CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: gi|351048419|gb|FQ448693.1|FQ448693
EST:     TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG                         CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGA
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGA
EST: gi|110358191|gb|EC922231.1|EC922231
EST:     TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG                         CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: gi|110702912|gb|EE079300.1|EE079300
EST:     TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG                         CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: gi|110701387|gb|EE078903.1|EE078903
EST:     TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCATTTCCAGGAAGCAATTGGAGGGATGCAG                         CTCCAATGTCAAGTGCAGTTCC
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCC
EST: gi|71876528|gb|DT025583.1|DT025583
EST:     TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG                         CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: gi|110358702|gb|EC923113.1|EC923113
EST:     TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG                         CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: gi|77578207|gb|DV217883.1|DV217883
EST:     TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG                         CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: gi|28964615|gb|CB343648.1|CB343648
EST:     TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG                         CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: gi|110358822|gb|EC923315.1|EC923315
EST:     TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG                         CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: gi|45770198|gb|CN006050.1|CN006050
EST:     TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG                         CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: gi|110700247|gb|EE078067.1|EE078067
EST:     TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGAAAGCAATTGGGGGGATGCAG                         CTCCAATGCCAAGTGCAGTTTCCA-TTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCA
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTT-CCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCA
EST: gi|352776475|gb|FQ474777.1|FQ474777
EST:     TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG                         CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: gi|110378066|gb|EC943179.1|EC943179
EST:     TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG                         CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: gi|110424414|gb|EC990775.1|EC990775
EST:     TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG                         CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: gi|34415358|gb|CF414112.1|CF414112
EST:     TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG                         CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG

Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
GATTGGGGTGCCCCAATTACTGATGCCCCCCAGTGGGGCGCTGATGTGCCTGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagatttattattattttttttttgcatgttattacttactatactatgataatttgtttaggtgattcatagcagtgtaaggccaagttctccatgt

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  CTGCAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGCAA