1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgtttttctttttttacctctttatcaagtccaggctttctgagttgtttcatttatccatttgacaaaccttgagttttcttcagatggggcttta...
species | Vitis vinifera |
transcript | Vv00s0187g00220.t01 |
intron # | 4 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATGEST: gi|51051352|gb|CO819013.1|CO819013
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTGGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCTATGTTACAAAATGEST: gi|77586760|gb|DV222522.1|DV222522
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATGEST: gi|34321024|gb|CF373778.1|CF373778
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: TACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATGEST: gi|28961834|gb|CB340921.1|CB340921
genomic: TACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATGEST: gi|110726655|gb|EE102627.1|EE102627
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTGGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCTATGTTACAAAATGEST: gi|110685864|gb|EE062959.1|EE062959
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATGEST: gi|29783362|gb|CB349482.2|CB349482
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTCACAAAATGEST: gi|77577964|gb|DV217740.1|DV217740
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATGEST: gi|71881457|gb|DT030512.1|DT030512
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTGGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCTATGTTACAAAATGEST: gi|110701548|gb|EE079248.1|EE079248
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTGGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCTATGTTACAAAATGEST: gi|26257347|gb|CA808410.1|CA808410
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATGEST: gi|110383463|gb|EC947838.1|EC947838
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATGEST: gi|34542613|gb|CF510845.1|CF510845
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTGGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCTATGTTACAAAATGEST: gi|110396217|gb|EC961898.1|EC961898
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATGEST: gi|71873805|gb|DT022860.1|DT022860
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTGGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCTATGTTACAAAATGEST: gi|110371370|gb|EC935343.1|EC935343
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTGGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCTATGTTACAAAATGEST: gi|34549179|gb|CF517411.1|CF517411
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTGGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCTATGTTACAAAATGEST: gi|71875866|gb|DT024921.1|DT024921
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATGEST: gi|110701549|gb|EE079249.1|EE079249
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTGGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCTATGTTACAAAATGEST: gi|27585127|gb|CB007822.1|CB007822
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGAAGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATGEST: gi|352790841|gb|FQ475478.1|FQ475478
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: TTCTCTGGATTTGTAGCAG CCAAG-TTCCTTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATEST: gi|71867954|gb|DT017009.1|DT017009
genomic: TTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACC-TTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAAT
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATGEST: gi|294964063|gb|GW837866.1|GW837866
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATGEST: gi|77577299|gb|DV217363.1|DV217363
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATGEST: gi|22009765|gb|BQ794799.1|BQ794799
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGNTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATGEST: gi|352794704|gb|FQ475202.1|FQ475202
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATGEST: gi|71873978|gb|DT023033.1|DT023033
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTGGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCTATGTTACAAAATGEST: gi|71874611|gb|DT023666.1|DT023666
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATGEST: gi|71875857|gb|DT024912.1|DT024912
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATGEST: gi|110712770|gb|EE088107.1|EE088107
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTGGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCTATGTTACAAAATGEST: gi|71868316|gb|DT017371.1|DT017371
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCT-TGGATTTGTGGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCTATGTTACAAAATGEST: gi|34542700|gb|CF510932.1|CF510932
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTGGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCTATGTTACAAAATGEST: gi|33406423|gb|CF212050.1|CF212050
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATGEST: gi|26258038|gb|CA809101.1|CA809101
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTGGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGGGGTTTCGCTCTATGTTACAAAATGEST: gi|110729230|gb|EE105337.1|EE105337
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTGGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCTATGTTACAAAATGEST: gi|77584920|gb|DV221543.1|DV221543
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATGEST: gi|352781978|gb|FQ469276.1|FQ469276
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: TACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTGGTAGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATGEST: gi|26258231|gb|CA809294.1|CA809294
genomic: TACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: CTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCCTCCATGTTACAAAATEST: gi|28961974|gb|CB341013.1|CB341013
genomic: CTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCG-CTCCATGTTACAAAAT
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATGEST: gi|110702874|gb|EE079227.1|EE079227
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTGGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCTATGTTACAAAATGEST: gi|77582909|gb|DV220445.1|DV220445
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTGGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCTATGTTACAAAATGEST: gi|32245682|gb|CD711501.1|CD711501
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: GATTTGTAGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATGEST: gi|33405791|gb|CF211418.1|CF211418
genomic: GATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTGGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCTATGTTACAAAATGEST: gi|71869568|gb|DT018623.1|DT018623
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATGEST: gi|110363258|gb|EC926834.1|EC926834
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATGEST: gi|71856647|gb|DT005702.1|DT005702
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTGGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCTATGTTACAAAATGEST: gi|349830208|gb|FQ420468.1|FQ420468
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATGEST: gi|71875634|gb|DT024689.1|DT024689
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATGEST: gi|26257452|gb|CA808515.1|CA808515
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATGEST: gi|110381363|gb|EC946692.1|EC946692
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTGGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCTATGTTACAAAATGEST: gi|26257101|gb|CA808164.1|CA808164
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTGGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGGGGTTTCGCTCTATGTTACAAAATGEST: gi|110687779|gb|EE065579.1|EE065579
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: TTTCTTCTCTGGATTTGTGGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCTATGTTACAAAATGEST: gi|26261832|gb|CA812895.1|CA812895
genomic: TTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ACTCTTACTTTTCCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATGEST: gi|351013193|gb|FQ424898.1|FQ424898
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATGEST: gi|30124839|gb|CB910178.1|CB910178
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATGEST: gi|351016605|gb|FQ424032.1|FQ424032
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
EST: ATTTTTACTTTCGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAG CCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
genomic: ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgttttt ... ttttccccagCCAAGATACCTTTCCCCTTGACTCAGAGGTTTCGCTCCATGTTACAAAATG
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| ACTCTTACTTTTGCTTGGGTTAACTTTTTCTTCTCTGGATTTGTAGCAGgtctgtttttctttttttacctctttatcaagtccaggctttctgagttgtttcatttatccatttgacaaaccttgagttttcttcagatggggcttta
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - gacaaac