Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTTTTTCTATGCATCCAGCGCTTGTATTTATCCTGAATTTAAACAGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctctaatcttataaaaaatatcagttctaaatatattcatttgaggattattggcataactgatgagctttttgcttttgtttag

Basic information

species Vitis vinifera
transcript Vv05s0020g04510.t01
intron # 3
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: Vv05s0020g04510.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 3
lower sequence: LOC_Os11g37890.2 (Oryza sativa), 5'ss of exon 3
GTTTTTCTATGCATCCAGCGCTTGTATTTATCCTGAATTTAAACAGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctctaatcttataaaaaatatcagttctaa-atatattcatttgaggattattg--gcataactgatgagctttttgcttttg---tttag
||| || ||||| || || |||||||| || ||||||||||| ||| |||| |||   || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |     ||  ||   |   ||||  |||||     | ||| || ||   |||||||   || ||| |    | |||  |   ||    |||||
GTTCTTTTATGCTTCAAGTGCTTGTATCTACCCTGAATTTAAGCAGCTGGACACTGTAGTTAGCTTGAAGGAGTCAGATGCTTGGCCTGCAGAGgtttcta----aactttcccactgatatatgttctgttgcaaattgatatgttaattattgttacaaaacagcactgatttcagtaattaccttttag

upper sequence: Vv05s0020g04510.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 3
lower sequence: GRMZM2G138907_T01 (Zea mays), 5'ss of exon 3
GTTTTTCTATGCATCCAGCGCTTGTATTTATCCTGAATTTAAACAGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgttttt------cctctaatcttataaaaa---atatcagttctaaatatattcatttgaggattat--tggcataa------ctgatgagctttttgcttttgtttag
||| ||||||||||| || || || || || ||||| || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |      | |||    || |  |      | | || | | |     || |  || |  ||    ||||| ||       |  ||| ||  |  ||  | |||||
GTTCTTCTATGCATCAAGTGCCTGCATCTACCCTGAGTTCAAGCAGCTGGAAACTGTAGTTAGCTTGAAGGAGTCCGATGCTTGGCCTGCCGAGgtttctaataaacttctgcatttctttacgctcgtgttagctgtcacctacttgagctgtgacttgcgatggcaaaatggtttttactgaactgatgcctaatttttag

upper sequence: Vv05s0020g04510.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 3
lower sequence: PP1S171_56V6.2 (Physcomitrella patens), 5'ss of exon 2
GTTTTTCTATGCATCCAGCGCTTGTATTTATCCTGAATTTAAACAGTTGGAAACTAATGTGAGC---TTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctcta--atcttataaaaaatatcagtt------ctaaatatattcatttgaggat-tattggcataactgatgagctttttgcttttgtttag
|||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||| ||| | ||||||    |||||||||| || |||||||| |||  ||| || ||| |   | ||   |||  |||     |      ||||  || || | |    | | | || | |     | |||    | |  ||| |   | 
GTTTTTCTATGCTTCAAGCGCGTGTATCTATCCTGAATTCAAACAGCTGGAGACTGACGTGAGCAGCCTGAAGGAGTCGGACGCTTGGCCCGCTCTGgtattgcctttttcacctcccaaatgatacagtattggcgactaagaatcttaaataacagttgttttagtaatgtcggtgaatcgtattgtttcggcga-

upper sequence: Vv05s0020g04510.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 3
lower sequence: PP1S237_14V6.1 (Physcomitrella patens), 5'ss of exon 2
GTTTTTCTATGCATCCAGCGCTTGTATTTATCCTGAATTTAAACAGTTGGAAACTAATGTGAGC---TTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgttt--ttcctctaatctta-taaaaaatatcagttctaaatatattcatttgaggattattggcataactgatgagctttttgcttttgtttag-----
|||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||| || ||  | |||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||||| |||  ||| |  || |||||  |||| |   ||  |   ||  |  ||   |  |  |        ||||      ||| |   |       || |   |      
GTTTTTCTATGCCTCAAGCGCGTGCATTTACCCTGAATTCAAGCAACTCGAAACTGATGTGAGCAGTTTGAAGGAGTCTGATGCGTGGCCCGCTCTGgtatagtttctctacccttagtgggaagaacttgtggtctatgattgaaagtctactcctttggtgaccttgagggattcgcgttgttcgggaaattcga

upper sequence: Vv05s0020g04510.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 3
lower sequence: PP1S98_250V6.1 (Physcomitrella patens), 5'ss of exon 2
GTTTTTCTATGCATCCAGCGCTTGTATTTATCCTGAATTTAAACAGTTGGAAACTAATGTGAGCT---TGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttc---ctctaatcttataaaaaat-atcagttctaaatatattcatttgaggatta--ttggcataactgatgagctttttgcttttgtttag--
|||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| || || ||| |||| ||| |||||||||   |||| || || |||||||||||||||  |||         | |   |||| |  | |  ||||||  | |||   |   | ||||   |   | ||  |   |     ||  || |  |||  |||   
GTTTTTCTATGCCTCAAGCGCGTGTATTTACCCTGAGTTCAAGCAGCTGGAGACTGATGTGAGCTCTTTGAAAGAATCGGATGCTTGGCCTGCTCTGgtacagtaaattttttccttagaggagaggatcagtgttcaatgagtgattatgagttctcactgggtttttttttcctgcgattcgtcttttgttatcc

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|110690520|gb|EE067689.1|EE067689
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTANAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|351056646|gb|FQ443273.1|FQ443273
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|349823754|gb|FQ415165.1|FQ415165
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|77584261|gb|DV221202.1|DV221202
EST:     TTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: TTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|161715726|gb|FC068393.1|FC068393
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110724254|gb|EE099931.1|EE099931
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110712339|gb|EE089844.1|EE089844
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTANAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110697772|gb|EE075142.1|EE075142
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|351039352|gb|FQ461219.1|FQ461219
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGATGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|71870290|gb|DT019345.1|DT019345
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110713058|gb|EE088647.1|EE088647
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTANAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110710946|gb|EE087579.1|EE087579
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTANAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|351053527|gb|FQ459274.1|FQ459274
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110711807|gb|EE088704.1|EE088704
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTANAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|351023083|gb|FQ430958.1|FQ430958
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110429041|gb|EC995528.1|EC995528
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|37188406|gb|CF607755.1|CF607755
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|30296895|gb|CB973689.1|CB973689
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|161717618|gb|FC066267.1|FC066267
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110710842|gb|EE087363.1|EE087363
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|77587013|gb|DV222647.1|DV222647
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110688673|gb|EE067497.1|EE067497
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110688752|gb|EE067664.1|EE067664
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110709756|gb|EE085496.1|EE085496
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTANAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|161717025|gb|FC068457.1|FC068457
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110727892|gb|EE105171.1|EE105171
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTANAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|77588003|gb|DV223206.1|DV223206
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|161716416|gb|FC068414.1|FC068414
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTTATGCA-
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTT-ATGCAA
EST: gi|110699656|gb|EE076844.1|EE076844
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|77586407|gb|DV222325.1|DV222325
EST:     GCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGGAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: GCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110711660|gb|EE088389.1|EE088389
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110701564|gb|EE079280.1|EE079280
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|351056774|gb|FQ443401.1|FQ443401
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|30136809|gb|CB922147.1|CB922147
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCNAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|349826666|gb|FQ418757.1|FQ418757
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110712020|gb|EE089165.1|EE089165
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTANAGAAGCTCGCAACTGANGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110711140|gb|EE087341.1|EE087341
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110711116|gb|EE087296.1|EE087296
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAAAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110718172|gb|EE094701.1|EE094701
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTANAGAAGCTCGCAACTGANGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|351055373|gb|FQ441971.1|FQ441971
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|30133677|gb|CB919016.1|CB919016
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|71862707|gb|DT011762.1|DT011762
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110708471|gb|EE086048.1|EE086048
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTANAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110692467|gb|EE071745.1|EE071745
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110713774|gb|EE089987.1|EE089987
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110691490|gb|EE069648.1|EE069648
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|352789795|gb|FQ478610.1|FQ478610
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|351035857|gb|FQ463702.1|FQ463702
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110690440|gb|EE067539.1|EE067539
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTANAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110397943|gb|EC963950.1|EC963950
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110689288|gb|EE065379.1|EE065379
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|71867732|gb|DT016787.1|DT016787
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110690011|gb|EE066739.1|EE066739
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTANAGAAGCTCGCAACTGANGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|351046356|gb|FQ452972.1|FQ452972
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110706385|gb|EE081866.1|EE081866
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110730002|gb|EE106582.1|EE106582
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAAAGAAGCTCGCAACTGAAGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110689401|gb|EE065591.1|EE065591
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|22013933|gb|BQ798967.1|BQ798967
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|87586940|gb|DY475007.1|DY475007
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|30134831|gb|CB920169.1|CB920169
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGNCA-CTGAGGAGTTATGCAA
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCG-CAACTGAGGAGTTATGCAA
EST: gi|30251726|gb|CB969459.1|CB969459
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110710487|gb|EE086864.1|EE086864
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110712797|gb|EE088155.1|EE088155
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAANGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGANGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|351030340|gb|FQ432278.1|FQ432278
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110702753|gb|EE079001.1|EE079001
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTANAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110703437|gb|EE080280.1|EE080280
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTANAGAAGCTCGCAACTGANGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110690995|gb|EE068593.1|EE068593
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110711219|gb|EE087490.1|EE087490
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110711728|gb|EE088537.1|EE088537
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCCCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAAGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|30135108|gb|CB920446.1|CB920446
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGNCA-CTGAGGAGTTATGCAA
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCG-CAACTGAGGAGTTATGCAA
EST: gi|110701563|gb|EE079279.1|EE079279
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110700929|gb|EE078013.1|EE078013
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|351048894|gb|FQ449737.1|FQ449737
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110710987|gb|EE087668.1|EE087668
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAAAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110720679|gb|EE096810.1|EE096810
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG

Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
GTTTTTCTATGCATCCAGCGCTTGTATTTATCCTGAATTTAAACAGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctctaatcttataaaaaatatcagttctaaatatattcatttgaggattattggcataactgatgagctttttgcttttgtttag

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGCTT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TTGAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  AAGGAG