1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' |
GCTAGTTCTCCCGGGAAAAGGTCTTCAATGGAAGATTTTTATGAGACAAGAATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttctttctctttctctctcttctacccatcccccaacaacactcaagcataggtaggtagattctgcatgcagtctttggtgtagcttgtatc...
species | Vitis vinifera |
transcript | Vv04s0008g07320.t01 |
intron # | 3 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|351015288|gb|FQ445572.1|FQ445572
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|351049231|gb|FQ449953.1|FQ449953
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|351042063|gb|FQ456273.1|FQ456273
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|351012818|gb|FQ430381.1|FQ430381
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|352789850|gb|FQ478665.1|FQ478665
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|351045009|gb|FQ449263.1|FQ449263
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|351013013|gb|FQ433740.1|FQ433740
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGC-GCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|351029309|gb|FQ436703.1|FQ436703
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|349827540|gb|FQ422408.1|FQ422408
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|349829612|gb|FQ421130.1|FQ421130
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|27580592|gb|CB003287.1|CB003287
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|351027298|gb|FQ444547.1|FQ444547
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGC-GCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|351045561|gb|FQ440746.1|FQ440746
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|351027940|gb|FQ425841.1|FQ425841
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|349821400|gb|FQ411021.1|FQ411021
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCTGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|352794348|gb|FQ481579.1|FQ481579
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|351040277|gb|FQ425363.1|FQ425363
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|351012750|gb|FQ430313.1|FQ430313
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|351054667|gb|FQ456864.1|FQ456864
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|349817052|gb|FQ399799.1|FQ399799
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|351027358|gb|FQ444607.1|FQ444607
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGC-GCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|349830755|gb|FQ417053.1|FQ417053
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|351028368|gb|FQ427264.1|FQ427264
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|351055478|gb|FQ442274.1|FQ442274
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|349833265|gb|FQ416643.1|FQ416643
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGC-GCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|161707944|gb|FC055687.1|FC055687
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|110392949|gb|EC957627.1|EC957627
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|27580653|gb|CB003348.1|CB003348
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|349830969|gb|FQ418253.1|FQ418253
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGC-GCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|351012611|gb|FQ430175.1|FQ430175
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGC-GCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|351056642|gb|FQ443269.1|FQ443269
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGTGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|352790958|gb|FQ479951.1|FQ479951
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|351048943|gb|FQ449786.1|FQ449786
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|27579783|gb|CB002478.1|CB002478
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|351026415|gb|FQ428427.1|FQ428427
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|351032995|gb|FQ461884.1|FQ461884
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|351045607|gb|FQ440792.1|FQ440792
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGATGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|351055896|gb|FQ452361.1|FQ452361
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|351040210|gb|FQ425296.1|FQ425296
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|351053821|gb|FQ441587.1|FQ441587
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|351041917|gb|FQ456127.1|FQ456127
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|352794319|gb|FQ481550.1|FQ481550
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|351022909|gb|FQ428818.1|FQ428818
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|110702341|gb|EE080945.1|EE080945
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|352786293|gb|FQ478904.1|FQ478904
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|32249919|gb|CD715738.1|CD715738
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|349830841|gb|FQ418149.1|FQ418149
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|351052370|gb|FQ455542.1|FQ455542
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|110357029|gb|EC920283.1|EC920283
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|351014237|gb|FQ434826.1|FQ434826
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTAAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|351041635|gb|FQ455845.1|FQ455845
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|351012059|gb|FQ429865.1|FQ429865
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|351038077|gb|FQ460819.1|FQ460819
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|352798552|gb|FQ480577.1|FQ480577
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTAEST: gi|351043128|gb|FQ451301.1|FQ451301
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
EST: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATG GTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
genomic: AATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttc ... gttgtctcagGTCATGGAGGTGCTCGAGCAGCTGAATATGTTAAACAAAACCTTTTTAGTA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GCTAGTTCTCCCGGGAAAAGGTCTTCAATGGAAGATTTTTATGAGACAAGAATTGATGGTGTTGAAGGAGAGATAGTTGGCCTTTTTGGAGTCTTTGATGgtactctttctttctctttctctctcttctacccatcccccaacaacactcaagcataggtaggtagattctgcatgcagtctttggtgtagcttgtatc
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TTGAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGGAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGGAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TTGGAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -ctctctc
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - atccccc
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -aacaaca