1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
TCACTTGGCCACCATCCCCATCACAGGAACTGGCATTAACCCAGCCAGGAGTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttttgatgagaaaaaaaaaaaaaaacctaaggaattttgcatcctttgatggttaaattgagtttcagttcaagttcttattgtgactttttttctcttgctttcag
species | Vitis vinifera |
transcript | Vv02s0025g03390.t01 |
intron # | 3 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCTTCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCAGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTACEST: gi|110699602|gb|EE076742.1|EE076742
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAA-AGAGAGCATGCATGGGATGACATG -GGAATCTCCTGGGTGGGACCGTTCEST: gi|110689831|gb|EE066398.1|EE066398
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGA-TCTTCTGGGTGGGACCGTTC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGGACC-TTCATTGGAGCTGCTCTTGCEST: gi|110393386|gb|EC958589.1|EC958589
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGG-ACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTACEST: gi|37185605|gb|CF604958.1|CF604958
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTACEST: gi|110393439|gb|EC958679.1|EC958679
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTACEST: gi|71870234|gb|DT019289.1|DT019289
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTACEST: gi|33405135|gb|CF210762.1|CF210762
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTACEST: gi|110700581|gb|EE077371.1|EE077371
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATC-TCTTCA-CAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACAGT-CATTGEST: gi|110707469|gb|EE083902.1|EE083902
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTG
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCACGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGEST: gi|87586384|gb|DY474671.1|DY474671
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTG
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGEST: gi|110368183|gb|EC932152.1|EC932152
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTG
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTACEST: gi|30131483|gb|CB916822.1|CB916822
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCCTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTACEST: gi|110372544|gb|EC936722.1|EC936722
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTACEST: gi|71869347|gb|DT018402.1|DT018402
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTACEST: gi|34545199|gb|CF513431.1|CF513431
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTACEST: gi|110394135|gb|EC958676.1|EC958676
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTACEST: gi|30298996|gb|CB975790.1|CB975790
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTACEST: gi|352791255|gb|FQ477541.1|FQ477541
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGG-ACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTACEST: gi|30297912|gb|CB974706.1|CB974706
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGAACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTACEST: gi|110404357|gb|EC969291.1|EC969291
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGGATCT-CTGGGTEST: gi|110370008|gb|EC934182.1|EC934182
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGG-ATCTTCTGGGT
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTACEST: gi|219554947|gb|FG984736.1|FG984736
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCCTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTEST: gi|30128185|gb|CB913524.1|CB913524
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGT
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCCTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTACEST: gi|352789589|gb|FQ476187.1|FQ476187
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTACEST: gi|110393792|gb|EC959288.1|EC959288
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTACEST: gi|110368511|gb|EC932492.1|EC932492
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTACEST: gi|33402806|gb|CF208433.1|CF208433
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTACEST: gi|110403384|gb|EC964996.1|EC964996
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTACEST: gi|110403205|gb|EC964535.1|EC964535
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTACEST: gi|110372061|gb|EC936204.1|EC936204
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGEST: gi|352789643|gb|FQ476241.1|FQ476241
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTG
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTACEST: gi|161709432|gb|FC058827.1|FC058827
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTACEST: gi|110403825|gb|EC969609.1|EC969609
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTACEST: gi|110365757|gb|EC929186.1|EC929186
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTACEST: gi|32456441|gb|CD797615.1|CD797615
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATTTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATTTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTACEST: gi|34548752|gb|CF516984.1|CF516984
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTACEST: gi|33406416|gb|CF212043.1|CF212043
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
EST: TCTTGGAGCTGCTATCATCGATCGA-AGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGGAC-GTTCATTGGAGCTGCTCTTGEST: gi|30297733|gb|CB974527.1|CB974527
genomic: TCTTGGAGCTGCTATCATCT-TCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGG-ACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTG
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCANCAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTACEST: gi|33405545|gb|CF211172.1|CF211172
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTACEST: gi|110694875|gb|EE072252.1|EE072252
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCCTTCATTGGAEST: gi|352782772|gb|FQ476852.1|FQ476852
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGA
EST: GTCTTGGAGCTGTTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTACEST: gi|349826347|gb|FQ417844.1|FQ417844
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGEST: gi|110702920|gb|EE079315.1|EE079315
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTG
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCCACAGAGAGCACGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGGTGGGACCEST: gi|34550552|gb|CF518770.1|CF518770
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGG-TGGGACC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCGA-GTAEST: gi|30303077|gb|CB979871.1|CB979871
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCC-ATGTA
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGAEST: gi|110368535|gb|EC932517.1|EC932517
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGA
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTEST: gi|352787069|gb|FQ476102.1|FQ476102
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTT
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATTTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTACEST: gi|51051358|gb|CO819016.1|CO819016
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTACEST: gi|110366955|gb|EC930875.1|EC930875
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTACEST: gi|352791120|gb|FQ477447.1|FQ477447
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
EST: GTCTGGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGTTCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTACEST: gi|34546194|gb|CF514426.1|CF514426
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTACEST: gi|34546877|gb|CF515109.1|CF515109
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTACEST: gi|110391040|gb|EC955992.1|EC955992
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTACEST: gi|110366989|gb|EC930909.1|EC930909
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTACEST: gi|110406888|gb|EC972475.1|EC972475
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCEST: gi|111125115|gb|EE253733.1|EE253733
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTACEST: gi|352782552|gb|FQ476632.1|FQ476632
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTACEST: gi|110372188|gb|EC936338.1|EC936338
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCEST: gi|110697955|gb|EE075413.1|EE075413
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCNACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCCTCTGGGTGEST: gi|110363744|gb|EC927355.1|EC927355
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTG
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTACEST: gi|110408286|gb|EC973919.1|EC973919
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCCTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTACEST: gi|110403569|gb|EC969179.1|EC969179
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAEST: gi|111125045|gb|EE253670.1|EE253670
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTA
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTACEST: gi|351017174|gb|FQ424601.1|FQ424601
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACTTG TGGATCTTCTGGGEST: gi|110365973|gb|EC929563.1|EC929563
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGG
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTACEST: gi|352789705|gb|FQ476303.1|FQ476303
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
EST: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATG TGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
genomic: GTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttt ... ttgctttcagTGGATCTTCTGGGTGGGACCGTTCATTGGAGCTGCTCTTGCTGCCATGTAC
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| TCACTTGGCCACCATCCCCATCACAGGAACTGGCATTAACCCAGCCAGGAGTCTTGGAGCTGCTATCATCTTCAACAGAGAGCATGCATGGGATGACATGgtaggtgttttgatgagaaaaaaaaaaaaaaacctaaggaattttgcatcctttgatggttaaattgagtttcagttcaagttcttattgtgactttttttctcttgctttcag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TTGGAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGCTGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGAGCA