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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GAACGTCGAACCTCTTGTTGAACAATTCAGAAAAAGGCCCAAATGCTTCTTCATTTTGACTAATTCCCGGGCATTGACTCCAGAGAAGgtaaagagttttcttcaaacacatacaatttttggttctcaagacttgtttcctattacaatcaaacaagatatctatatccagaaattaggtttgtttttatgaaaggtctctgtaccatttgcttatttgaggatcgcgttcctgattagaagtttgacttcttatag

Basic information

species Vitis vinifera
transcript Vv17s0000g02140.t01
intron # 22
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|161707308|gb|FC055152.1|FC055152
EST:     CCAAATGCTTCTTCATTTTGACTAATTCCCGGGCATTGACTCCAGAGAAG                         GCCACTGCATTGATTAAAGATATCTGCACAAACATACGTAATGCAGCGAAC
genomic: CCAAATGCTTCTTCATTTTGACTAATTCCCGGGCATTGACTCCAGAGAAGgtaaagagtt ... cttcttatagGCCACTGCATTGATTAAAGATATCTGCACAAACATACGTAATGCAGCGAAC
EST: gi|37184380|gb|CF603734.1|CF603734
EST:     AAATGCTTCTTCATTTTGACTAATTCCCGGGCATTGACTCCAGAGAAG                         GCCACTGCATTGATTAAAGATATCTGCACAAACATACGTAATGCAGCGAAC
genomic: AAATGCTTCTTCATTTTGACTAATTCCCGGGCATTGACTCCAGAGAAGgtaaagagtt ... cttcttatagGCCACTGCATTGATTAAAGATATCTGCACAAACATACGTAATGCAGCGAAC
EST: gi|71854879|gb|DT003934.1|DT003934
EST:     CCAAATGCTTCTTCATTTTGACTAATTCCCGGGCATTGACTCCAGAGAAG                         GCCACTGCATTGATTAAAGATATCTGCACAAACATACGTAATGCAGCGAAC
genomic: CCAAATGCTTCTTCATTTTGACTAATTCCCGGGCATTGACTCCAGAGAAGgtaaagagtt ... cttcttatagGCCACTGCATTGATTAAAGATATCTGCACAAACATACGTAATGCAGCGAAC